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百子莲CONSTANS 同源基因的克隆及表达分析

石玉波 张荻 申晓辉 王玲 卓丽环

石玉波, 张荻, 申晓辉, 王玲, 卓丽环. 百子莲CONSTANS 同源基因的克隆及表达分析[J]. 北京林业大学学报, 2014, 36(4): 113-120. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.04.021
引用本文: 石玉波, 张荻, 申晓辉, 王玲, 卓丽环. 百子莲CONSTANS 同源基因的克隆及表达分析[J]. 北京林业大学学报, 2014, 36(4): 113-120. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.04.021
SHI Yu-bo, ZHANG Di, SHEN Xiao-hui, WANG Ling, ZHUO Li-huan. Molecular cloning and expression pattern analysis of a CONSTANS homolog from Agapanthus praecox ssp. orientalis.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2014, 36(4): 113-120. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.04.021
Citation: SHI Yu-bo, ZHANG Di, SHEN Xiao-hui, WANG Ling, ZHUO Li-huan. Molecular cloning and expression pattern analysis of a CONSTANS homolog from Agapanthus praecox ssp. orientalis.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2014, 36(4): 113-120. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.04.021

百子莲CONSTANS 同源基因的克隆及表达分析

doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.04.021

Molecular cloning and expression pattern analysis of a CONSTANS homolog from Agapanthus praecox ssp. orientalis.

  • 摘要: 根据前期百子莲转录组测序分析的结果,获得了1 个与光周期调控开花途径关键基因CONSTANS(CO)同源 性较高的核心片段。采用cDNA 末端快速扩增(RACE) 方法得到了百子莲CO 基因cDNA 全长序列,命名为 ApCOL,GenBank 登录号为KF683287。序列分析表明,百子莲ApCOL 基因cDNA 全长1 648 bp,5非编码区(5UTR) 和3非编码区(3UTR)分别为126 和355 bp,开放阅读框(ORF,127 ~ 1 293 bp)1 167 bp,编码388 个氨基酸。 ApCOL 具有CO 蛋白典型的结构域:氨基末端有2 个B-box 结构域,羧基末端有1 个CCT 保守结构域。氨基酸同源 性比对发现,ApCOL 与葡萄(XP_002274384.2)、可可(EOX99181.1)和大豆(NP_001241023.1)等植物的CO 蛋白有 很高的相似性,同源性均在50%以上。系统进化树分析表明,ApCOL 与小麦CO(EMS51329.1)聚类关系最近。实 时荧光定量qRT-PCR 结果表明:叶片中ApCOL 的表达量在花芽分化3 个时期均高于花芽中的表达量,且叶片中的 最高表达量和花芽中最低表达量均出现在花芽诱导期;在整个初花期内,各器官中ApCOL 表达量由高到低依次是 花梗、叶片、幼果、子房、花瓣、茎和花葶,花梗中表达量分别为叶片和茎中的2.68 和114.3 倍;不同光周期处理的叶 片中ApCOL 基因表达模式相近,均在暗处理时期呈现高表达。说明该基因的表达具有明显的时空差异性和生物钟 调节特性,推测ApCOL 在百子莲成花过程中以及花发育过程中发挥着一定的作用。
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出版历程
  • 刊出日期:  2014-07-31

百子莲CONSTANS 同源基因的克隆及表达分析

doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.04.021

摘要: 根据前期百子莲转录组测序分析的结果,获得了1 个与光周期调控开花途径关键基因CONSTANS(CO)同源 性较高的核心片段。采用cDNA 末端快速扩增(RACE) 方法得到了百子莲CO 基因cDNA 全长序列,命名为 ApCOL,GenBank 登录号为KF683287。序列分析表明,百子莲ApCOL 基因cDNA 全长1 648 bp,5非编码区(5UTR) 和3非编码区(3UTR)分别为126 和355 bp,开放阅读框(ORF,127 ~ 1 293 bp)1 167 bp,编码388 个氨基酸。 ApCOL 具有CO 蛋白典型的结构域:氨基末端有2 个B-box 结构域,羧基末端有1 个CCT 保守结构域。氨基酸同源 性比对发现,ApCOL 与葡萄(XP_002274384.2)、可可(EOX99181.1)和大豆(NP_001241023.1)等植物的CO 蛋白有 很高的相似性,同源性均在50%以上。系统进化树分析表明,ApCOL 与小麦CO(EMS51329.1)聚类关系最近。实 时荧光定量qRT-PCR 结果表明:叶片中ApCOL 的表达量在花芽分化3 个时期均高于花芽中的表达量,且叶片中的 最高表达量和花芽中最低表达量均出现在花芽诱导期;在整个初花期内,各器官中ApCOL 表达量由高到低依次是 花梗、叶片、幼果、子房、花瓣、茎和花葶,花梗中表达量分别为叶片和茎中的2.68 和114.3 倍;不同光周期处理的叶 片中ApCOL 基因表达模式相近,均在暗处理时期呈现高表达。说明该基因的表达具有明显的时空差异性和生物钟 调节特性,推测ApCOL 在百子莲成花过程中以及花发育过程中发挥着一定的作用。

English Abstract

石玉波, 张荻, 申晓辉, 王玲, 卓丽环. 百子莲CONSTANS 同源基因的克隆及表达分析[J]. 北京林业大学学报, 2014, 36(4): 113-120. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.04.021
引用本文: 石玉波, 张荻, 申晓辉, 王玲, 卓丽环. 百子莲CONSTANS 同源基因的克隆及表达分析[J]. 北京林业大学学报, 2014, 36(4): 113-120. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.04.021
SHI Yu-bo, ZHANG Di, SHEN Xiao-hui, WANG Ling, ZHUO Li-huan. Molecular cloning and expression pattern analysis of a CONSTANS homolog from Agapanthus praecox ssp. orientalis.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2014, 36(4): 113-120. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.04.021
Citation: SHI Yu-bo, ZHANG Di, SHEN Xiao-hui, WANG Ling, ZHUO Li-huan. Molecular cloning and expression pattern analysis of a CONSTANS homolog from Agapanthus praecox ssp. orientalis.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2014, 36(4): 113-120. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.04.021

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