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TSIT-PatchTST模型:一种净生态系统交换量(NEE)缺失值插补方法

齐建东, 石成城, 吴鹏

齐建东, 石成城, 吴鹏. TSIT-PatchTST模型:一种净生态系统交换量(NEE)缺失值插补方法[J]. 北京林业大学学报, 2025, 47(2): 105-118. DOI: 10.12171/j.1000-1522.20240187
引用本文: 齐建东, 石成城, 吴鹏. TSIT-PatchTST模型:一种净生态系统交换量(NEE)缺失值插补方法[J]. 北京林业大学学报, 2025, 47(2): 105-118. DOI: 10.12171/j.1000-1522.20240187
Qi Jiandong, Shi Chengcheng, Wu Peng. TSIT-PatchTST model: a missing value interpolation method for net ecosystem exchange (NEE)[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2025, 47(2): 105-118. DOI: 10.12171/j.1000-1522.20240187
Citation: Qi Jiandong, Shi Chengcheng, Wu Peng. TSIT-PatchTST model: a missing value interpolation method for net ecosystem exchange (NEE)[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2025, 47(2): 105-118. DOI: 10.12171/j.1000-1522.20240187

TSIT-PatchTST模型:一种净生态系统交换量(NEE)缺失值插补方法

基金项目: 国家自然科学基金项目(32071842),国家重点研发计划项目(2022YFD2200304)。
详细信息
    作者简介:

    齐建东,博士,教授。主要研究方向:生态信息学、智能信息处理。Email:qijd@bjfu.edu.cn 地址:100083北京市海淀区清华东路35号北京林业大学信息学院

  • 中图分类号: S718.5;TP181

TSIT-PatchTST model: a missing value interpolation method for net ecosystem exchange (NEE)

  • 摘要:
    目的 

    净生态系统交换量(NEE)是评估陆地生态系统在全球碳循环中作用的重要指标,NEE原始观测数据缺失值的插补精度会直接影响生态系统关键参数的可靠性和精确性。为提高不同植被NEE在长时间连续性数据缺失情景下的插补精度,提出一种融合时间序列表征向量的TSIT-PatchTST深度学习模型。

    方法 

    以全球长期通量观测网络站点的碳通量因子数据为研究对象,通过构造短缺失(1 d)、中缺失(7 d)、长缺失(30 d)3种随机连续数据缺失场景,评估边际分布采样法(MDS)、PatchTST模型、TS2Vec-PatchTST模型和TSIT-PatchTST模型在8种不同植被类型下NEE的插补结果。

    结果 

    在短缺失场景下,4种插补方法都表现出最优的性能。随着连续缺失天数的增多,MDS的插补精度逐渐下降,该方法在长缺失场景下已不能对NEE进行有效插补,而其他3种深度学习模型能够有效地插补NEE缺失数据。综合3种缺失场景,TSIT-PatchTST模型表现出最优的插补性能,尤其在长缺失场景下该模型具有较高的插补精度。长缺失场景下,TSIT-PatchTST模型对31个站点插补结果的平均均方误差(MSE)为0.942 μmol/(m2·s),平均绝对误差(MAE)为0.628 μmol/(m2·s),平均R2为0.457。与PatchTST模型的插补结果相比,TSIT-PatchTST模型平均MSE下降了53.3%, 平均MAE下降了39.7%,平均R2相持平。

    结论 

    综合8种植被类型和3种缺失场景的应用结果,得出TSIT-PatchTST模型的插补效果最佳,并具有适应性。TSIT-PatchTST模型可应用于时间序列数据缺失场景以提高数据插补精度。

    Abstract:
    Objective 

    Net ecosystem exchange (NEE) is an important indicator for evaluating the role of terrestrial ecosystems in the global carbon cycle. The accuracy of imputation of missing values in NEE raw observation data directly affects the reliability and precision of key ecosystem parameters. To enhance the imputation accuracy of NEE in scenarios of continuous long-term data gaps across different vegetation types, a TSIT-PatchTST model was proposed based on deep learning.

    Method 

    Using carbon flux factor data from sites within the global long-term flux observation network as the research object, three types of random continuous data gap scenarios were constructed, including short missing (1 d), medium missing (7 d), and long missing (30 d). The imputation results of marginal distribution sampling (MDS) method, PatchTST model, TS2Vec-PatchTST model, and TSIT-PatchTST model under eight different vegetation types were evaluated.

    Result 

    In the scenario of short missing, all imputation methods demonstrated optimal performance. As the number of consecutive missing days increased, the imputation accuracy of MDS method gradually declined, and it was no longer effective for imputing NEE in the long missing scenario. In contrast, the three deep learning models were capable of effectively imputing missing NEE data. Considering all three missing scenarios, the TSIT-PatchTST model exhibited the best imputation performance, particularly with a high accuracy in long missing scenarios. In the long missing scenario, the TSIT-PatchTST model achieved an average mean squared error (MSE) of 0.942 μmol/(m2·s), an average mean absolute error (MAE) of 0.628 μmol/(m2·s), and an average R2 of 0.457 across 31 sites. Compared with PatchTST model, the TSIT-PatchTST model reduced the average MSE by 53.3%, average MAE by 39.7% and the average R2 remained unchanged.

    Conclusion 

    Integrating the performance across eight vegetation types and three missing scenarios, the TSIT-PatchTST model demonstrates the best imputation effect and adaptability. It can be applied to the problem of missing data in time series to improve the accuracy of data imputation.

  • 板栗(Castanea mollissima)属于壳斗科(Fagaceae)栗属(Castanea)植物,是我国重要的木本粮食树种之一,其果实营养价值高,除富含淀粉外,还有蛋白质、脂肪、矿物质和维生素等营养物质,深受消费者喜爱,具有较高的经济价值[1]。目前我国板栗种植规模和总产量均居世界第一,但由于板栗喜光,枝条顶端优势强,结果部位外移快且自交不亲和,其结实率低,效益低下[2]。因此,培育具有优质、高产、短枝型等优良性状的板栗新品种具有重要的现实意义。

    现阶段分子辅助育种已被广泛应用到植物育种工作中,但板栗新品种的培育仍以杂交育种为主[3],如:新品种‘明丰2号’(C. mollissima ‘Mingfeng 2’)是以‘燕明’(C. mollissima ‘Yanming’)为母本、‘燕山早丰’(C. mollissima ‘Yanshanzaofeng’)为父本杂交培育而来[4];‘南垂5号’(C. mollissima ‘Nanchui5’)则是以母本‘垂枝’(C. mollissima ‘Chuizhi’)与父本‘南沟1号’(C. mollissima ‘Nangou1’)杂交培育得来[5]。在杂交授粉过程中,如何提高成功率,以获取丰富的杂种资源是板栗育种亟待解决的问题。较高活性的花粉和柱头是授粉成功的关键[6],准确掌握花粉与柱头活性检测方法,探明其日变化规律,明确最适杂交授粉时间,可有效提高板栗杂交育种成功率。

    目前,植物花粉活力检测方法多样,如2,3,5-三苯基氯化四氮唑(TTC)染色法、碘–碘化钾(I2-KI)法、MTT染色法、离体萌发法、墨水染色法等[79]。在柱头可授性检测方面,多数学者采用联苯胺–过氧化氢法[1011]检测柱头可授性,部分研究采用MTT染色法[12]、直接授粉法等[13]。前期板栗花粉活力研究发现,不同板栗品种采用不同花粉活力测定方法,结果存在较大差异。陈可可[14]采用TTC染色法检测5个板栗品种花粉活力发现,‘泰安薄壳栗’(C. mollissima ‘Taianbaoke’)花粉活力最高可达72.18%;覃腾[15]以广西4个板栗品种为研究对象,采用离体萌发法检测其花粉活力,发现‘封开2号’(C. mollissima ‘Fengkai2’)萌发率最高,但仅为15.76%。在板栗柱头可授性研究方面,王倩[16]采用联苯胺–过氧化氢法检测了不同时期燕山板栗柱头可授性,发现盛花期柱头可授性最强;周晶[17]采用联苯胺–过氧化氢法检测板栗‘燕山红’(C. mollissima ‘Yanshanhong’)柱头可授性发现,柱头可授性高峰值出现于盛花期单日08:00—12:00。以上研究对花粉活力和柱头可授性的测定方法和日变化规律进行了初步探索,但并未将花粉活力、柱头可授性日变化规律与其坐果率、结实率、空苞率等进行综合分析。

    为准确把握板栗最适授粉时间,提高板栗杂交育种成功率,为后期的良种培育提供充足的杂种资源,本研究首次以河北省迁西县主栽国审板栗品种‘燕山早丰’(果肉质地细腻、味香甜、熟食品质上等、丰产、质感效应较强)为母本[1819],父本选择具有多粒、矮化等特异性状的‘王钱大栗’(C. mollissima ‘Wangqiandali’)、‘短枝芽变’(C. mollissima ‘Duanzhiyabian’)、‘三屯红栗’(C. mollissima ‘Santunhongli’),采用联苯胺–过氧化氢法、MTT法检测母本柱头可授性,采用TTC染色法、I2-KI法、醋酸洋红染色法、离体萌发法等检测花粉活力,通过研究盛花期花粉活力、柱头可授性、不同时间授粉对结实情况的影响,筛选‘燕山早丰’柱头可授性和杂交花粉活力的适宜检测方法,探明两者的日变化规律,筛选出最适杂交授粉时间。研究结果将为板栗人工杂交育种的成功提供理论指导,同时对解析板栗生殖生物学特性及繁殖机制具有重要意义。

    试验地位于河北省唐山市迁西县北京林业大学经济林(板栗)育种与栽培试验实践基地(40°18′ N,118°54′ E),属暖温带大陆性季风气候,年平均气温10.1 ℃,最低月平均气温−6.5 ℃,最高月平均气温25.4 ℃。年平均降水量817 mm,其中5—10月降雨量657.6 mm,占全年降水量的88%。年平均相对湿度59%,年平均无霜期176 d,全年日照2 581.5 h,日照充足。该地属于低山丘陵区,土壤质地为沙壤土,pH 6.44,有机质含量2.89 mg/g,土壤肥力为中等水平[20]

    材料为11 年生板栗品种‘燕山早丰’‘王钱大栗’‘短枝芽变’‘三屯红栗’,长势优良,无病虫害,株行距4 m × 3 m,平均树高4.3 m,冠幅4.0 m × 4.5 m,树体为三主枝,开张角度 > 60°,树形为自然开心形。

    参照周晶[17]研究结果,选择盛花期进行人工授粉。选取长势一致且健壮的板栗试验树60株,包括‘燕山早丰’45株,‘王钱大栗’‘短枝芽变’‘三屯红栗’各5株。40株‘燕山早丰’作为母本进行柱头可授性检测与授粉试验,5株‘燕山早丰’用于花粉活力检测;‘王钱大栗’‘短枝芽变’‘三屯红栗为父本,用于花粉活力日变化规律研究与授粉试验。各杂交授粉组合为 ‘燕山早丰’♀ × ‘王钱大栗’、‘燕山早丰’♀ × ‘短枝芽变’、‘燕山早丰’♀ × ‘三屯红栗’和1个自交组合‘燕山早丰’♀ × ‘燕山早丰’

    每授粉组合选择10株母树,每棵母树去雄套袋后,于盛花期单日08:00—18:00每隔2 h进行杂交授粉。采用随机区组设计,以单株为试验小区,共10个重复。各授粉组合每株母树每授粉时段在冠层中部东、南、西、北4个方向外围各均匀选取3个长势相近且健壮的雌花簇,1个授粉时段每母株共选取12个雌花簇,每个授粉组合每时段授粉120个雌花簇,4个组合共选取2 400个雌花簇。授粉时去掉套袋,用毛笔蘸取花粉轻轻点涂雌花柱头上,授粉完成后立即套袋。

    在上午08:00—10:00,采集‘燕山早丰’雄花盛花期的雄花序,每株树均从东、南、西、北4个方向取样,混合后分别采用TTC染色法[21]、醋酸洋红染色法[22]、I2-KI染色法[23]、离体萌发培养法[24]测定花粉活力,并以清水作为对照,筛选板栗花粉活力适宜检测方法。

    在08:00—18:00每隔2 h采集‘燕山早丰’‘王钱大栗’‘短枝芽变’‘三屯红栗’的雄花盛花期的花粉,选择1.3.3筛选出的花粉活力检测方法进行花粉活力日变化规律研究。

    从40株‘燕山早丰’授粉母株中随机选取15株,在雌花盛花期每株树冠层中部东、南、西、北4个方向各均匀选取3个雌花簇,在上午08:00—10:00采集柱头,分别利用联苯胺–过氧化氢法[25]和MTT染色法[26]测定柱头可授性,并以清水作为对照,筛选板栗柱头可授性适宜检测方法。联苯胺–过氧化氢法判定标准:若柱头周围产生气泡数量多且体积较大,则柱头可授性很强(+++);若柱头周围产生大量小气泡,则柱头可授性较强(++);若柱头周围产生少量气泡,则柱头可授性较弱(+);若柱头无气泡产生,则柱头无可授性(−)。MTT染色法判定标准:若柱头具有可授性,则柱头被染成深蓝色或黑色,颜色由浅变深,柱头可授性由弱变强;若没有可授性,则柱头没有颜色反应。

    在08:00—18:00每隔2 h采集‘燕山早丰’盛花期的柱头,选择1.3.5筛选出的柱头可授性检测方法进行柱头可授性日变化规律研究。

    授粉20 d后去除纸袋,使球苞自然生长,统计坐果率、落果率,9月上旬果实成熟后,计算结实率、空苞率。坐果率为未凋落雌花簇数与授粉雌花簇数的比值,落果率为凋落雌花簇数与授粉雌花簇数的比值,空苞率为空苞数与授粉雌花簇数的比值,结实率为果实成熟时的结实苞数与授粉雌花簇数的比值[15]

    试验数据采用Excel软件进行整理,SPSS 26.0进行方差分析。

    花粉在清水处理的情况下,颜色均为淡黄色,接近半透明,分为形状规则的卵圆形与形状不规则两种形态(图1a)。0.5%和2%的TTC染色法的染色效果均不明显,延长染色时间后花粉依旧呈淡黄色(图1b1c),故此方法不适合板栗花粉活力检测。醋酸洋红染色法效果明显,有活力的花粉呈鲜红色,形状呈规则的卵圆形,而无活力花粉未着色,体积小且形状不规则(图1d);该方法操作简单,染色时间短,效果好,有活力花粉与无活力花粉较易辨别,可作为板栗花粉活力检测方法。I2-KI染色法染色效果明显,有活力花粉颜色呈深棕色,无活力花粉不着色,但两者之间存在色浅、黄褐色的花粉,花粉活力较难判别,故此方法也不适合板栗花粉活力检测(图1e)。离体萌发培养法可以直接观察到花粉的萌发情况(图1f),可判断花粉是否具有活力,但花粉离体培养耗时较长,且培养条件较为严苛,易染菌,需要在无菌且温度恒定的环境下培养,花粉整体萌发率较低。

    图  1  不同方法测定‘燕山早丰’花粉活力效果
    a. 清水对照;b. 0.5%TTC染色法;c. 2%TTC染色法;d. 醋酸洋红染色法;e. I2-KI染色法;f. 离体萌发法
    Figure  1.  Effects of different methods on measuring pollen viability of ‘Yanshanzaofeng’

    综合反应条件、反应时间、判断标准等方面,发现醋酸洋红染色法更适合进行板栗盛花期单日花粉活力规律研究。

    采用醋酸洋红染色法测定不同板栗品种单日内花粉活力变化规律,结果如表1所示。各品种盛花期单日内花粉活力均保持在75%以上,但不同品种板栗花粉在单日内不同时间活力存在差异。‘短枝芽变’和‘三屯红栗’单日内花粉活力波动较小,最高值均出现在10:00—12:00。‘燕山早丰’‘王钱大栗’单日内花粉活力波动相对较大,但花粉活力最高值也出现在10:00—12:00,最低值出现时段存在差异。其中,‘燕山早丰’10:00—12:00花粉活力显著高于16:00—18:00,‘王钱大栗’10:00—12:00花粉活力显著高于其余时间花粉活力。综上,以这4个品种为父本时,应该选择上午10:00—12:00采集花粉,此时花粉活力最高。

    表  1  不同板栗品种盛花期花粉活力变化
    Table  1.  Changes in pollen viability of different chestnut cultivars at full flowering stage %
    时段 ‘燕山早丰’ ‘短枝芽变’ ‘王钱大栗’ ‘三屯红栗’
    08:00—10:00 84.78ab 90.47a 83.71b 88.58a
    10:00—12:00 90.71a 91.32a 87.26a 88.97a
    12:00—14:00 80.65ab 88.93a 75.34c 82.23a
    14:00—16:00 81.14ab 90.63a 79.49c 83.76a
    16:00—18:00 78.63b 86.89a 78.26c 80.53a
    注:不同小写字母表示同一品种单日内不同时间花粉活力存在显著差异(P < 0.05)。下同。
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    采用联苯胺–过氧化氢法检测‘燕山早丰’柱头可授性,由于板栗柱头形状结构限制,染色效果不佳,仅有柱头尖端可观察到轻微蓝色反应;但其表面气泡反应明显,区分度较高。柱头表面只产生少量气泡,且气泡体积较小,柱头可授性较弱,标记为+,记1分(图2a-1);柱头表面产生较多小气泡,柱头可授性较强,标记为++,记2分(图2a-2);柱头表面迅速产生大量气泡,且均匀附着整个柱头,柱头可授性最强,标记为+++,记3分(图2a-3)。

    图  2  联苯胺–过氧化氢法(a)和MTT染色法(b)检测‘燕山早丰’柱头可授性
    Figure  2.  Detecting stigma receptivity of ‘Yanshanzaofeng’ according to benzidine hydrogen peroxide method (a) and MTT method (b)

    采用MTT染色法检测柱头可授性,短时间内柱头表面无明显颜色变化,避光染色1 h后,染色情况较为明显,有活力的柱头顶部变为黑色,且随着柱头可授性增强,染色长度逐渐增大。具体而言,仅有柱头尖端部分染色,染色面积微小,呈点状,此柱头可授性较弱(图2b-1);柱头尖端面积染色面积增大,其柱头底部也部分染色,即柱头可授性较强(图2b-2);柱头尖端染色部分延伸至柱头中部,且花柱上端也有部分染色,此柱头可授性极强(图2b-3)。

    综上,联苯胺–过氧化氢法和MTT染色法都可以判断板栗柱头可授性强弱。综合考虑染色时长、可操作性等因素,在实际生产中,采用联苯胺–过氧化氢法检测板栗柱头可授性更适宜。因而,选择联苯胺–过氧化氢法进行板栗盛花期单日柱头可授性变化规律研究。

    表2显示:‘燕山早丰’盛花期单日内不同时段柱头均具有可授性,整体呈现出“上升—下降—上升—下降”的变化趋势。上午08:00—10:00柱头就已经具有较强可授性,10:00—12:00可授性达到最高,柱头表面具有大量气泡;随后急剧下降,12:00—14:00可授性要明显低于其他时段,之后可授性又重新升高,于14:00—16:00达到日变化第2个高峰,16:00—18:00可授性降低(图3)。

    表  2  联苯胺–过氧化氢法检测‘燕山早丰’盛花期单日不同时间柱头可授性
    Table  2.  Detecting single day stigma receptivity during full flowering period of ‘Yanshanzaofeng’ by benzidine-hydrogen peroxide method
    时段柱头反应柱头可授性
    08:00—10:00浸泡在溶液中3 ~ 5 min后,柱头表面出现大量气泡,且体积较大+++
    10:00—12:00浸泡溶液3 min左右,柱头表面出现大量气泡,气泡密集且体积较大+++
    12:00—14:00浸泡溶液5 min后,柱头表面出现少量气泡,体积较小+
    14:00—16:00浸泡溶液5 min后,柱头表面出现气泡,气泡密集+++
    16:00—18:00浸泡溶液5 min后,柱头表面出现大体积气泡,但数量较少++
    注:+++. 柱头可授性极强;++. 柱头可授性较强;+. 柱头具可授性。
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    图  3  联苯胺–过氧化氢法检测‘燕山早丰’盛花期单日柱头可授性
    a. 08:00—10:00;b. 10:00—12:00;c. 12:00—14:00;d. 14:00—16:00;e. 16:00—18:00
    Figure  3.  Detecting single day stigma receptivity during blooming period of ‘Yanshanzaofeng’ by benzidine-hydrogen peroxide method

    各杂交组合中,不同时间授粉落果率与坐果率均无显著差异,但结实率与空苞率在不同授粉时间存在显著差异(图4)。 ‘燕山早丰’ × ‘王钱大栗’杂交组合在盛花期08:00—10:00与10:00—12:00时段授粉,其结实率分别高达79.30%与80.36%,显著高于12:00—14:00与16:00—18:00两个授粉时段(图4);且在10:00—12:00时段授粉,3粒坚果球苞结实率相较于其他授粉时段最高,达55.10%(表3);空苞率在10:00—12:00授粉时段最低,仅为14.74%,而16:00—18:00授粉时段的空苞率高达37.88%,二者差异达到显著水平。

    图  4  各授粉组合盛花期单日不同时段授粉结果
    a.‘燕山早丰’♀ × ‘王钱大栗’♂;b.‘燕山早丰’♀ × ‘短枝芽变’♂;c.‘燕山早丰’♀ × ‘三屯红栗’♂;d.‘燕山早丰’♀ × ‘燕山早丰’♂。不同小写字母表示同一授粉组合单日内不同时间授粉后结实情况存在显著差异(P < 0.05)。
    Figure  4.  Pollination results of different combinations at varied times in a single day during blooming period
    表  3  各授粉组合盛花期单日不同时间授粉结实情况
    Table  3.  Pollination and seed setting at different times of a single day during blooming period of each pollination combination
    授粉组合 授粉时段 结实率(1粒)/% 结实率(2粒)/% 结实率(3粒)/% 总结实率/%
    ‘燕山早丰’♀ × ‘王钱大栗’ 08:00—10:00 10.76a 14.71a 53.83a 79.30a
    10:00—12:00 9.64a 15.62a 55.10a 80.36a
    12:00—14:00 12.24a 17.78a 30.58b 60.60bc
    14:00—16:00 5.21a 20.96a 44.24ab 70.42ab
    16:00—18:00 12.35a 12.92a 29.86b 55.12c
    ‘燕山早丰’♀ × ‘短枝芽变’ 08:00—10:00 10.59a 8.07ab 40.69a 59.35a
    10:00—12:00 4.98a 7.40ab 43.72a 56.10a
    12:00—14:00 7.13a 3.25b 26.20ab 36.59b
    14:00—16:00 5.67a 12.61a 34.56a 52.85a
    16:00—18:00 7.28a 8.01ab 23.62ab 38.90ab
    ‘燕山早丰’♀ × ‘三屯红栗’ 08:00—10:00 3.25b 19.76a 53.41a 76.42a
    10:00—12:00 10.60a 17.28ab 50.98a 78.86a
    12:00—14:00 14.65a 17.31ab 29.02b 60.98ab
    14:00—16:00 13.82a 17.32ab 39.06ab 70.20ab
    16:00—18:00 11.38a 16.50b 29.02b 56.91b
    ‘燕山早丰’♀ × ‘燕山早丰’ 08:00—10:00 23.80a 4.70a 2.82a 31.32a
    10:00—12:00 21.12a 4.17ab 2.50ab 27.79ab
    12:00—14:00 17.63a 3.25ab 1.95ab 22.83ab
    14:00—16:00 20.07a 3.96ab 2.38ab 26.40ab
    16:00—18:00 16.84a 2.73b 1.64b 21.21b
    注:不同小写字母表示同一授粉组合单日内不同时段授粉后结实情况存在显著差异(P < 0.05)。
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    在‘燕山早丰’ × ‘短枝芽变’杂交组合中,结实率在08:00—10:00授粉时段最高(59.35%),10:00—12:00时段的结实率与08:00—10:00时段相比略有下降(56.10%),并显著高于12:00—14:00授粉时段(图4);3粒坚果球苞结实率以10:00—12:00时段最高(43.72%)(表3);空苞率则以10:00—12:00授粉时段最低(27.64%),12:00—14:00与16:00—18:00的空苞率则高达46.34%与44.59%,均显著高于10:00—12:00(图4)。

    在‘燕山早丰’ × ‘三屯红栗’杂交组合中,08:00—10:00、10:00—12:00授粉时段的结实率较高,达76.42%、78.86%,16:00—18:00结实率最低(56.91%),与上午差异达到显著水平(图4);3粒坚果球苞结实率以08:00—10:00时段最高(53.41%),10:00—12:00时段略有下降(50.98%)(表3);空苞率则在10:00—12:00授粉时段最低(8.94%),显著低于12:00—14:00和16:00—18:00授粉时段。

    在‘燕山早丰’ × ‘燕山早丰’自交组合中,结实率均在30%左右(图4)。在08:00—10:00授粉时段,结实率最高(31.32%),空苞率最低(30.38%);在16:00—18:00授粉时段结实率最低(21.21%)(图4)。结实的球苞大多只含有1粒坚果,2粒坚果球苞与3粒坚果球苞结实率均以08:00—10:00最高,16:00—18:00最低;空苞率则以12:00—14:00最高,达53.54%(表3)。相比其他杂交组合,自交组合中的结实率较低,落果率与空苞率较高;但是结实率最高值出现在上午授粉时段,这与其他杂交组合相同(图4)。

    综合不同板栗品种授粉组合在不同时时段授粉后的结实指标可以得出,结实率和3粒坚果球苞结实率最高值均出现在上午。因此,为提高板栗杂交授粉结实率,应选择上午进行板栗杂交授粉。

    前人系统研究花粉活力发现,不同植物有不同的适宜检测方法。如:花生(Arachis hypogaea)花粉活力的最适检测方法为离体萌发法与红墨水染色法[7],薄壳山核桃(Carya illinoinensis)的花粉采用MTT染色法着色效果最佳[8],多花黄精(Polygonatum cyrtonema)的花粉活力最适检测方法为TTC染色法[27]。TTC试剂是依靠呼吸作用产生的NADH2或NADPH2对花粉进行染色。本试验中TTC试剂无法使板栗花粉着色,这可能是由于板栗自身呼吸作用产生的脱氢酶较少,无法达到理想的染色状态。此外,利用I2-KI对花粉进行染色时,染色效果会因直链淀粉与支链淀粉的比例不同而产生差异[28]。当花粉直链淀粉含量高时,会被试剂染为蓝色,如芝麻(Sesamum indicum[23]、油茶(Camellia oleifera[29];反之则为紫红色,如花生[7]、百合(Lilium lancifolium[30]等。醋酸洋红染液则是根据花粉内物质积累量对花粉进行染色,正常花粉物质积累较多,对醋酸洋红的吸附作用与亲和力强,易被染为深红色,反正,呈淡红色或无色,如油菜(Brassica campestris[31]。本研究中,醋酸洋红染色法、I2-KI染色法均可将‘燕山早丰’花粉成功染色,但是醋酸洋红染色法操作简单,染色快速,有活力花粉与无活力花粉易辨别,结果准确;而I2-KI染色法中存在浅色、黄褐色的介于有活力和无活力之间的花粉,活力界定具有主观性,花粉活力较难准确判别。因而,建议生产上使用醋酸洋红染色法检测‘燕山早丰’花粉活力。

    利用联苯胺–过氧化氢法检测柱头可授性,主要是依靠柱头表面有活力的过氧化氢酶,试剂中的过氧化氢在酶的作用下产生强氧化性的原子氧,将联苯胺氧化变色,并产生气泡。故当柱头表面气泡体积较大,数量较多时,柱头具有较强可授性,反之则柱头可授性较弱。此方法已广泛用于植物柱头可授性检验,如川贝母(Fritillaria cirrhosa[32]、兜兰(Paphiopedilum[33]等。MTT染色法检测柱头可授性主要依据柱头表面活性酶与试剂反应变色原理,可授性较强的柱头被染为深色,且染色面积较大,反之柱头颜色较浅[3435]。本试验采用联苯胺–过氧化氢法和MTT染色法检验‘燕山早丰’的柱头可授性,其反应结果与其他植物基本相同,但MTT染色法检验板栗柱头可授性耗时较长,可能导致错过最适授粉时间。因此,在生产上可选取联苯胺–过氧化氢法快速检测柱头可授性,为杂交授粉提供指导。

    花粉活力是决定授粉成功的重要因素,柱头是植物承接花粉的部位,二者对于准确把握植物授粉时间有重要意义,共同决定植物育种成功率[36]。不同植物的花粉活力与柱头可授性变化规律不同[23,37],因此,植物育种授粉前,应准确掌握花粉活力和柱头的变化规律,由此得到最适授粉时间,提高育种成功率。

    本研究发现,上午08:00—12:00柱头可授性与花粉活力均较强,而在正午12:00—14:00柱头可授性较弱,且此时花粉活力显著降低,这可能与空气温度、湿度变化有关。板栗柱头为针状形,在雌花成熟过程中可观察到柱头尖端有蛋白质、脂类、多糖等分泌物溢出[38],中午温度升高,空气湿度降低,导致柱头分泌物内酶活性降低,柱头可授性降低。这与温度对甜樱桃(Prunus avium)柱头可授性的影响结果[39]相一致。此外,正午高温导致板栗花粉活力降低,这与辣椒(Capsicum annuum)的研究结果[40]相似。正午过后,气温降低,日照强度减弱,柱头内酶活性增强,柱头可授性与花粉活力回升;傍晚气温继续下降导致柱头可授性与花粉活力又重新降低。本研究得出的柱头可授性变化规律与周晶[17]对板栗柱头可授性的研究结果基本一致,且本研究中板栗花粉活力检测方法和变化规律方面的内容也弥补了板栗相关研究的缺失。

    授粉时间显著影响授粉受精完成情况,如周建辉等[41]对厚皮甜瓜(Cucumis melo)进行不同时间杂交授粉,发现06:00—12:00授粉种子发芽率较高。对西瓜(Citrullus lanatus[42]、西葫芦(Cucurbita pepo[43]的研究也证实上午授粉比下午效果好,主要表现为坐果率较高,结籽数量多。此外,对玉米(Zea mays)进行不同时间授粉处理,发现不同自交系均在09:00—11:00和16:00—18:00授粉果穗的结实性状较好[44]。这与本研究得到的板栗08:00—12:00与14:00—16:00杂交授粉结实情况较好的结果相似,即最适授粉时间均避开了正午时段。除可以根据授粉结实情况筛选植物授粉时间外,也可根据柱头可授性和花粉活力筛选植物的适宜授粉时间。对青杨派树种进行柱头可授性检测,发现最佳授粉期为花序顶部露出芽鳞84 ~ 96 h[45]。本研究中,上午10:00—12:00进行授粉结实效果优良,这与前期柱头可授性与花粉活力变化规律的结果相符合,进一步验证了此时段为板栗最适杂交授粉时间。

    通过将3个杂交授粉组合与自交授粉结实情况相对比,可以看出‘燕山早丰’存在明显的自交不亲和现象,其自交落果率与空苞率均较高,而结实率较低。不同杂交授粉组合间结实情况也存在差异,以‘王钱大栗’‘三屯红栗’为父本的授粉组合的结实率和3粒坚果球苞结实率与以‘短枝芽变’为父本的授粉组合存在较大差距,即存在明显的花粉直感效应,这与前人的研究结果[19]一致。后续在进行板栗杂交育种和种质优化时,宜选取性状优良的品种为父本,以丰富子代板栗优良性状。

    本研究首次以国审板栗品种‘燕山早丰’为试验对象,筛选其柱头可授性与花粉活力的高效便捷检测方法,并在此基础上以其为母本进行了多组合的分时段授粉,从而筛选出板栗适宜的杂交授粉时段。研究得到以下主要结论。

    (1)板栗‘燕山早丰’柱头可授性最适检测方法为联苯胺–过氧化氢法,花粉活力最适检测方法为醋酸洋红染色法。

    (2)盛花期单日内柱头可授性呈“上升—下降—上升—下降”趋势,且以10:00—12:00时间段柱头可授性最强,此时段不同父本板栗品种的花粉活力也最高。

    (3)不同杂交组合中,总结实率与3粒坚果球苞结实率最高值均出现在08:00—12:00。

    综合上述结果,实际生产中建议在上午10:00—12:00对‘燕山早丰’杂交授粉。研究结果不仅为优化板栗人工杂交授粉技术,提高板栗杂交授粉成功率,以获得充足的杂种资源提供了理论指导,同时有助于丰富板栗生殖生物学内容,揭示其繁殖机制。本研究设置的授粉试验时间梯度为2 h,在后续研究中可将时间梯度细化,以期筛选出更加精确的最适授粉时间,从而获得更理想的结实效果。

  • 图  1   TSIT-PatchTST模型结构

    Figure  1.   TSIT-PatchTST model structure

    图  2   短缺失泰勒图

    Figure  2.   Short missing Taylor diagram

    图  3   中缺失泰勒图

    Figure  3.   Middle missing Taylor diagram

    图  4   长缺失泰勒图

    Figure  4.   Long missing Taylor diagram

    图  5   TSIT-PatchTST模型插补效果折线图

    稀树草原以AU-Cpr站点为例,落叶阔叶林以DE-Lnf站点为例,常绿针叶林以US-GLE站点为例,草地以US-SRG站点为例,开放灌木地以US-Whs站点为例,农田以DE-Geb站点为例,混合林以US-Syv站点为例,木本灌草丛以US-Ton站点为例。

    Figure  5.   Effect line chart of TSIT-PatchTST model interpolation

    表  1   站点数据集植被分类

    Table  1   Vegetation classification of site dataset

    站点纬度经度时间区间(年月日时刻)数据量/条植被类型
    罗林斯 US-GLE41°21′59″N106°14′24″W201205241430 − 20140622153036 435常绿针叶林
    梅托利乌斯 US-Me244°27′08″N121°33′27″W200401181300 − 20060104153034 422常绿针叶林
    尼沃特岭 US-NR140°01′58″N105°32′47″W201009281530 − 20120810190032 744常绿针叶林
    内华达 US-Var38°24′48″N120°57′03″W201303280000 − 20140707003022 370草地
    埃尔福特 DE-Geb51°05′59″N10°54′53″E201202171030 − 20130314113018 771农田
    波特科尔伯恩 CA-TP342°42′25″N80°20′54″W200512160530 − 20061226093018 009常绿针叶林
    科奇斯 US-SRG31°47′22″N110°49′40″W201101270030 − 20120116030016 998草地
    坦普斯通 US-Whs31°44′38″N110°03′08″W201007281300 − 20110608113015 118开放灌木地
    埃森纳赫 DE-Hai51°04′45″N10°27′08″E200602280300 − 20061224023014 352落叶阔叶林
    默里桥 AU-Lox34°28′14″S140°39′18″E200808191630 − 20090609100014 100落叶阔叶林
    诺福克 CA-TP142°39′39″N80°33′34″W200512311330 − 20061013123013 727常绿针叶林
    库特韦克 NL-Loo52°09′59″N5°44′37″E200205220830 − 20030303123013 689常绿针叶林
    内珀维尔 US-IB241°50′26″N88°14′28″W200508221300 − 20060531020013 515草地
    韦兰德 CA-TP442°42′37″N80°21′27″W200207201400 − 20030427190013 499常绿针叶林
    斯普林斯 AU-TTE22°17′13″S133°38′24″E201305220130 − 20140118023011 571草地
    先锋市 US-Ton38°25′51″N120°57′58″W201305081200 − 20131231220011 397木本灌草丛
    沙欣尼 US-LWW34°57′38″N97°58′44″W199802181030 − 19981004000010 924草地
    罗尔斯顿 AU-Emr23°51′31″S148°28′29″E201202062100 − 20120919150010 837草地
    巴梅拉 AU-Cpr34°00′08″S140°35′21″E201206020930 − 20130104110010 372稀树草原
    鲍威 US-Wkg31°44′12″N109°56′31″W200506171000 − 20060117023010 258草地
    科菲维尔 US-Goo34°15′17″N89°52′25″W200510170000 − 20060516103010 150草地
    埃尔奥拜德 SD-Dem13°16′58″N30°28′42″E200810141400 − 2009050314009 649稀树草原
    拉龙日 CA-SF154°29′06″N105°49′04″W200603130130 − 2006092021009 208常绿针叶林
    诺德豪森 DE-Lnf51°19′42″N10°22′04″E200302221030 − 2003083110309 121落叶阔叶林
    凯瑟琳 AU-DaS14°09′34″S131°23′17″E201104081600 − 2011101422309 086稀树草原
    西姆科 CA-TP242°46′28″N80°27′32″W200505171330 − 2005111907308 917常绿针叶林
    西斯特斯 US-Me444°29′57″N121°37′21″W200006081300 − 2000120706308 724常绿针叶林
    伍德拉夫 US-Syv46°14′31″N89°20′52″W200305310000 − 2003112419308 536混合林
    塞拉维斯塔 US-SRM31°49′17″N110°51′58″W200910211530 − 2010041313008 348木本灌草丛
    纽伦比 AU-DaP14°03′48″S131°19′05″E200905081630 − 2009102721008 266草地
    比格里弗 CA-SF354°05′30″N106°00′20″W200405051330 − 2004102308308 199开放灌木地
    注:混合林由树木主导,覆盖百分比超过60%,高度超过2 m。包括交错混合或其他4种森林类型的树木,且任何一种植被类型都不超过60%。
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    表  2   NEE响应因子字段

    Table  2   NEE response factor field

    字段名称中文名称单位
    SW_IN_F短波辐射W/m2
    VPD_F_MDS饱和水汽压差hPa
    TA_F_MDS空气温度
    NETRAD净辐射能量W/m2
    WS风速m/s
    WD风向
    G_F_MDS土壤热通量
    TS_F_MDS土壤温度
    RH相对湿度%
    SWC_F_MDS土壤含水量%
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    表  3   模型主要超参数设置

    Table  3   Primary hyper-parameter setting of models

    超参数含义设定值
    top_k准确率5
    layers2
    dmin, dmax深度范围(64, 128)
    batch_size批量大小1500
    learning_rate学习率0.001
    epoch迭代次数10
    注:因长缺失场景需要制造连续1 440条数据缺失,故模型批量大小设置为1 500;上述超参数设置可以满足模型对NEE缺失数据插补的需要。
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    表  4   数据插补结果

    Table  4   Data imputation results

    缺失情况 植被类型 PatchTST TS2Vec-PatchTST TSIT-PatchTST 边际分布采样法 MDS
    MSE/
    (μmol·m−2·s−1)
    MAE/
    (μmol·m−2·s−1)
    R2 MSE/
    (μmol·m−2·s−1)
    MAE/
    (μmol·m−2·s−1)
    R2 MSE/
    (μmol·m−2·s−1)
    MAE/
    (μmol·m−2·s−1)
    R2 MSE/
    (μmol·m−2·s−1)
    MAE/
    (μmol·m−2·s−1)
    R2
    短缺失 农田 1.547 0.950 0.886 0.736 0.570 0.641 0.191 0.230 0.879 0.233 0.293 0.002
    落叶阔叶林 1.550 0.936 0.611 0.824 0.657 0.450 0.457 0.465 0.596 2.201 0.813 0.014
    常绿针叶林 1.208 0.865 0.448 0.913 0.690 0.323 0.617 0.518 0.439 4.792 1.014 0.045
    草地 2.057 1.046 0.329 1.804 0.935 0.247 1.428 0.798 0.309 17.340 1.542 0.039
    混合林 2.596 1.223 0.834 1.176 0.771 0.591 0.377 0.392 0.847 2.307 0.677 0.064
    开放灌木地 1.116 0.856 0.423 1.007 0.745 0.304 0.750 0.592 0.439 1.114 0.521 0.025
    稀树草原 2.232 1.175 0.388 2.043 1.085 0.284 1.534 0.895 0.409 3.551 0.864 0.032
    木本灌草丛 3.853 1.289 0.531 2.141 1.026 0.391 1.149 0.726 0.536 18.586 1.816 0.023
    中缺失 农田 1.501 0.939 0.875 0.903 0.607 0.633 0.237 0.224 0.874 0.810 0.529 0.026
    落叶阔叶林 1.577 0.942 0.647 0.738 0.621 0.476 0.403 0.426 0.652 5.777 1.308 0.034
    常绿针叶林 1.198 0.862 0.475 0.910 0.683 0.351 0.588 0.502 0.475 14.790 1.574 0.119
    草地 2.046 1.044 0.313 1.888 0.954 0.218 1.452 0.796 0.316 16.691 1.547 0.102
    混合林 2.610 1.223 0.850 1.178 0.757 0.604 0.371 0.355 0.844 2.370 0.684 0.087
    开放灌木地 1.084 0.844 0.612 0.967 0.718 0.399 0.590 0.486 0.601 1.027 0.516 0.045
    稀树草原 2.159 1.160 0.403 2.277 1.136 0.293 1.615 0.914 0.394 2.804 0.755 0.091
    木本灌草丛 3.927 1.290 0.529 2.078 1.026 0.372 1.141 0.732 0.528 14.882 2.472 0.055
    长缺失 农田 1.538 0.948 0.901 0.835 0.598 0.648 0.177 0.209 0.903 1.248 0.733 0.008
    落叶阔叶林 1.559 0.939 0.603 0.695 0.607 0.447 0.398 0.436 0.607 6.709 1.539 0.013
    常绿针叶林 1.206 0.864 0.442 0.912 0.690 0.323 0.610 0.518 0.439 20.316 2.492 0.047
    草地 2.052 1.046 0.292 1.877 0.954 0.204 1.458 0.801 0.297 38.533 2.238 0.041
    混合林 2.603 1.223 0.851 1.136 0.778 0.615 0.354 0.401 0.850 4.565 1.006 0.065
    开放灌木地 1.106 0.852 0.589 1.028 0.745 0.389 0.640 0.506 0.579 2.098 0.699 0.021
    稀树草原 2.205 1.170 0.423 2.290 1.138 0.310 1.593 0.907 0.422 8.449 1.237 0.031
    木本灌草丛 3.878 1.290 0.548 2.006 1.014 0.385 1.092 0.714 0.544 37.945 2.534 0.013
    注:加粗字体表示在同一植被类型下插补效果最佳方法。下同。
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    表  5   长缺失下数据插补结果的平均R2对比

    Table  5   Comparison of average R2 of data imputation results under long missing

    插补方法 农田 落叶阔叶林 常绿针叶林 草地 混合林 开放灌木地 稀树草原 木本灌草丛
    TSIT-PatchTST 0.903 0.607 0.439 0.297 0.850 0.579 0.422 0.544
    RFR10[20] 0.700 0.623 0.547 0.638 0.689 0.397 0.784 0.437
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    表  6   US-GLE站点日间与夜间NEE插补结果

    Table  6   Daytime and nighttime NEE imputation results of US-GLE station

    时间段 评价指标 短缺失 中缺失 长缺失
    日间 MSE 0.509 0.635 0.709
    MAE 0.429 0.514 0.502
    R2 0.479 0.285 0.321
    夜间 MSE 0.448 0.537 0.498
    MAE 0.387 0.418 0.404
    R2 0.439 0.386 0.429
    注:日间时间段为上午10点至下午16点,夜间时间段为下午16点至次日上午10点。
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    表  7   US-GLE站点生长季与非生长季NEE插补结果

    Table  7   NEE imputation results during growing and non-growing seasons of US-GLE station

    时期 评价指标 短缺失 中缺失 长缺失
    生长季  MSE 0.424 0.429 0.451
    MAE 0.402 0.411 0.416
    R2 0.486 0.398 0.392
    非生长季 MSE 1.005 0.913 0.647
    MAE 0.552 0.578 0.480
    R2 0.191 0.105 0.204
    注:生长季为4月到10月,非生长季为10月到次年4月。
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图(5)  /  表(7)
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出版历程
  • 收稿日期:  2024-06-10
  • 修回日期:  2024-12-28
  • 录用日期:  2024-12-30
  • 网络出版日期:  2025-01-03
  • 刊出日期:  2025-02-24

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