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利用荧光标记SSR绘制中国芍药品种分子身份证

张嘉 刘爱青 张淑玲 解莹然 刘燕

张嘉, 刘爱青, 张淑玲, 解莹然, 刘燕. 利用荧光标记SSR绘制中国芍药品种分子身份证[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(6): 101-109. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150349
引用本文: 张嘉, 刘爱青, 张淑玲, 解莹然, 刘燕. 利用荧光标记SSR绘制中国芍药品种分子身份证[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(6): 101-109. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150349
ZHANG Jia, LIU Ai-qing, ZHANG Shu-ling, XIE Ying-ran, LIU Yan. Using the SSR with fluorescent labeling to establish SSR molecular ID code for cultivars of the Chinese herbaceous peony[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(6): 101-109. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150349
Citation: ZHANG Jia, LIU Ai-qing, ZHANG Shu-ling, XIE Ying-ran, LIU Yan. Using the SSR with fluorescent labeling to establish SSR molecular ID code for cultivars of the Chinese herbaceous peony[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(6): 101-109. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150349

利用荧光标记SSR绘制中国芍药品种分子身份证

doi: 10.13332/j.1000-1522.20150349
基金项目: 

北京市科委计划项目(D161100001916004)

详细信息
    作者简介:

    张嘉。主要研究方向:园林植物资源与育种。Email:jzbjfu@163.com 地址:100083北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。

    责任作者:

    刘燕,教授,博士生导师。主要研究方向:园林植物资源与育种。Email:chbly@sohu.com 地址:同上。

Using the SSR with fluorescent labeling to establish SSR molecular ID code for cultivars of the Chinese herbaceous peony

  • 摘要: 为了开发芍药品种分子鉴定方法,本研究采用SSR标记技术,在目前芍药SSR引物开发较少的情况下,采用文献相关引物84对,并结合自行设计的27对引物,将6%非变性聚丙烯酰胺凝胶与四重荧光毛细管电泳技术相结合,从111对引物中筛选出29对扩增稳定、多态性高的核心引物;共检测到223个SSR等位位点,平均每对引物为7.69个,有效等位基因数(Ne)为3.658±0.328,Shannon多样性指数(I)为1.371±0.104,观测杂合度(Ho)为0.532±0.045,期望杂合度(He)为0.645±0.036,多态性信息含量PIC值介于0.20~0.84,平均0.60。基于最少引物鉴定最多种质的原则,按照PIC值由高到低顺序串联排序的方式,最终筛选出4对SSR引物(Pmg153、Knu73、Pmg209、J38)。结果表明:筛选出的4对SSR引物组合可以有效鉴定66个芍药品种;采用个位数字和大写英文字母结合对不同带型进行编码,成功绘制了66个中国传统芍药品种的分子身份证。本研究为芍药品种鉴定提供了一种快速、准确与高效的分子检测方法,也有助于中国传统芍药品种的遗传改良与芍药新品种保护。

     

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出版历程
  • 收稿日期:  2015-09-22
  • 修回日期:  2015-09-22
  • 刊出日期:  2016-06-30

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