Genetic evaluation of breeding resources of Pinus sylvestris var. mongolica from different improved generations
-
摘要: 当前樟子松遗传改良正处于升级换代的关键时期,但是不同地区育种资源调拨与交换频繁,导致了育种资源信息模糊、亲缘关系混乱,增加了樟子松遗传改良工作中近交衰退的风险,因此开展育种资源评价研究是樟子松优良单株利用的重要基础。本文以樟子松1、1.5、2代种子园224个无性系为研究对象,开展了基于SSR的遗传多样性和单株亲缘关系分析以及遗传差异分析。结果表明:按育种资源的来源分析,良种基地、头道桥、榆林1.5和泰来4个群体的遗传多样性水平较高,宝根园和榆林群体相对较低;按育种资源的世代分析,不同世代樟子松育种资源维持着较高的遗传多样性水平,高世代种子园的遗传多样性水平有所下降,2、1.5代种子园的期望杂合度He较1代种子园分别下降4.13%、1.31%。2代种子园群体的近交系数F值(0.173)较高,纯合子较多,显著偏离了哈迪-温伯格平衡。同种源、不同生境的樟子松育种资源没有发生明显的变异,主要的遗传变异存在于个体之间(96%);随着种子园世代的提高,无性系之间的亲缘关系聚类现象逐渐明显,2代种子园内存在两组完全一致的无性系(CH3、CH10组和TL1417、TL1411组)。研究结果完善了樟子松育种资源评价体系,确定了不同世代育种资源的亲缘关系,为樟子松高级遗传改良工作提供了材料和信息基础。Abstract: Nowadays, the genetic improvement of Pinus sylvestris var. mongolica is in a critical period of upgrading and updating. But the frequent allocation and exchange of breeding resources in different areas lead to unclear information of breeding resources and confusion of genetic relationship, which increases the risk of inbreeding depression during genetic improvement of Pinus sylvestris var. mongolica. Therefore, the evaluation of breeding resources is an important basis for the utilization of superior individuals of Pinus sylvestris var. mongolica. In this paper, 224 clones of Pinus sylvestris var. mongolica from the 1st, 1.5th and 2nd seed orchards were studied. Genetic diversity, phylogenetic relationship and genetic diversity were analyzed based on SSR, and the population of BaogenYuan and Yulin was relatively low according to breeding resource analysis; the genetic diversity of four populations of LiangZhongJiDi, TouDaoQiao, YuLin1.5 and TaiLai was higher.According to improved generation analysis, different generations of Pinus sylvestris var. mongolica breeding resources maintained a high level of genetic diversity; the genetic diversity of the high generation seed orchard decreased, and the expected heterozygosity (He) of the 2nd and 1.5th generation seed orchards decreased by 4.13% and 1.31% respectively compared with the 1st generation seed orchard; the 2nd generation seed orchard group had more higher inbreeding coefficient (the F-value was 0.173) and homozygote, which significantly deviated from Hardy-Weinberg equilibrium; Pinus sylvestris var. mongolica breeding resources in different habitats and the same source had no obvious variation, the genetic variation mainly existed among individuals (96%); with the generation seed orchard increased, phylogenetic relationship clustering phenomenon among clones gradually became obvious, two sets of breeding resource clones were identified completely genetic consistent in the 2nd generation seed orchard. The results of this research improve the breeding resource evaluation system of Pinus sylvestris var. mongolica, determine the genetic relationship of different generation breeding resources, and provide the material and information basis for the advanced genetic improvement work of Pinus sylvestris var. mongolica.
-
从古至今,木材作为一种天然可再生的环保型材料,以其独特的性能和优良的环境学特性深受人们喜爱,并广泛应用于生产生活的各个方面。随着现代科学技术的突飞猛进、人类学理论的不断发展,考古木材作为进行植物考古学和环境考古学研究的一种典型生物材料,正成为专家学者的研究热点,国内外考古作业挖掘出大量的木质文物[1-2],例如:“Riksapplet号”沉船[3]、“小白礁Ⅰ号”沉船[4]、“南海Ⅰ号”船木[5]等为出土考古木材的研究提供了丰富的材料。
Crestini等[6]运用X射线衍射和扫描电镜的方法对埃及古代棺木进行研究,研究发现:考古木材中纤维素、半纤维素、木质素均产生不同程度的降解,小分子化合物发生改变,使考古木材变得脆弱而柔软。Łucejko等[7]运用热裂解气相色谱–质谱联用法对取自比萨圣罗索雷古船的木材样品进行了主成分分析,样品木质素中愈创木基和紫丁香基的去甲基化表明考古木材中多糖产生了流失。卢芸[8]指出大多木质文物纤维素结晶区被严重破坏,葡聚糖侧链的乙酰基消失,多糖类物质遭到严重降解,木质素相对含量明显增加。
考古木材微观结构的变化,将在很大程度上影响其水分吸着行为,因而可利用等温吸附曲线和水分吸着理论对考古木材与吸着水分子的相互作用进行分析,如Guggenheim-Anderson-de Boer模型[9]、Hailwood-Horrobin模型[10]等。Guo等[11]利用Guggenheim-Anderson-de Boer模型计算得到每千克古代润楠木(Machilus pingii Cheng ex Yang)样品的最大单层吸水量为7.388 kg,而相同树种现代木材的最大单层吸水量仅为4.602 kg,考古木材的最大单层吸水量比现代木材增加了61%。
木材的水分吸着过程必然伴随着热量或能量的变化[12],因此基于吸附热力学考察水分吸着机理,有助于从本质上获得考古木材与水分相互作用方面的信息。曹金珍[13]发现西藏云杉(Picea spinulosa)在水分吸着过程中微分吸着热、微分吸着熵值随吸湿过程不断增大。Simón 等[14]研究了在吸湿和解吸平衡态下辐射松(Pinus radiata)的微分吸着熵值随含水率的变化曲线,结果显示在相同平衡含水率下辐射松解吸的微分吸着熵值大于吸湿值。
在以往的研究中,研究者多从成分、结构角度对考古木材水分吸着行为进行研究,且取得了一定进展,而对考古木材的吸附热力学研究较少,而且对各种热力学量变化的系统分析也很欠缺。本研究将聚焦考古木材在吸湿和解吸平衡状态下微分吸着热、自由能变化及微分吸着熵三大热力学量的研究,并分别利用电子显微镜(scanning electron microscope,SEM)、傅里叶红外光谱(Fourier transform infrared spectroscopy,FTIR)分析考古木材的细胞壁结构和化学成分变化,从而建立考古木材微观结构与其水分吸着行为间的构效关系,探究考古木材与现代木材在水分吸附热力学方面的差异及其原因,为从能量角度解析考古木材与水分之间的相互作用机制奠定理论基础,同时也可为我国木质文物的保护提供科学依据,以减少出土饱水木质文物与环境中水分的相互作用,提高木质文物的尺寸稳定性。
1. 材料与方法
1.1 材 料
本研究所用考古木材取自成都文物考古研究院发掘出土的南宋木棺残片,由研究院提供的材料和信息确定为考古柏木,并采集四川产柏木(Cupressus sp.)作为现代对照材。
1.2 细胞壁微观形貌表征
利用滑动切片机(REM-710,Yamato Kohki industrial Co.,Ltd,Japan)制得尺寸为1 mm(轴向) × 2 mm(弦向) × 2 mm(径向)的柏木考古木材与现代木材薄片试样(试样重复数为3),用于SEM观察。在80 ℃的鼓风干燥箱中将试样干燥至质量恒定后进行喷金处理,设置SEM(S-3400,Hitachi,日本)加速电压为3 kV,对柏木试样的细胞结构进行观察,初步了解考古木材的降解、腐朽情况。
1.3 化学成分表征
利用研磨机将考古木材与现代木材样品加工成100目以下的木粉,并在80 ℃的真空干燥箱中干燥至质量恒定,之后将木粉与溴化钾充分混合研磨压制成透明薄片,利用红外光谱仪(BRUKER vertex 70 V,德国)对试样进行检测分析,扫描范围设为400 ~ 4 000 cm−1,分辨率为4 cm−1,每个试样扫描次数为32次。重复测试3次,取平均值。
1.4 吸附热力学量测定
将柏木考古木材、现代木材样品加工为20 mg左右木片,并分别置于(103 ± 2)℃下干燥至质量恒定,用于动态水分吸附分析(dynamic vapor sorption,DVS)实验。将各组试样放入DVS中,分别预设恒定温度为25和50 ℃,相对湿度以10%为梯度从0%增加到90%,继续增加至95%,然后降回至90%,再以10%为梯度从90%降低到0%,试样在每个相对湿度下逐渐达到吸湿/解吸平衡后(当样品质量变化速率连续在10 min内小于0.000 1%/min,则认为样品达到吸湿/解吸平衡),仪器自动进入下一个相对湿度梯度。仪器每隔1 min记录样品质量、温度和相对湿度等数据,得到考古木材和现代木材的吸湿和解吸平衡的等温吸附曲线。
利用Hailwood-Horrobin水分吸着理论[10]分析所获得的等温吸附曲线,木材在不同相对湿度条件下达到的平衡含水率可表达为
M=Mh+Md=18m(KhKdH1+KhKdH+KdH1−KdH) (1) 式中:M为试样平衡含水率(%);Mh为水合水质量分数(%);Md为溶解水质量分数(%);m为单位摩尔数吸着位点的绝干木材质量(g/mol);Kh为水合水与溶解水之间的平衡常数;Kd为溶解水与环境温湿度之间的平衡常数;H为相对湿度(%)。
将式(1)整理成多项式,具体为
HM=A+BH−CH2 (2) 式中:A、B、C为多项式的拟合参数,A、B、C与Kh、Kd、m的关系为
A=m18×1Kd(Kh+1) (3) B=m18×Kh−1Kh+1 (4) C=m18×KhKdKh+1 (5) 通过不同相对湿度环境试样的等温吸湿曲线数据分析可得到拟合参数A、B、C的值,进而可以求解m、Kh和Kd的值,公式中
m18 的倒数18m 表示木材中有效吸着基团被水合水饱和时的含水率,间接表达了水分吸着位点的数量。利用各组试样的DVS数据拟合等温吸附曲线,进一步通过Clausius-Clapeyron公式[15]分别计算考古木材与现代木材的微分吸着热QS、自由能变化ΔG和微分吸着熵ΔS,分析考古木材与现代木材在吸附热力学量间的差异,各热力学量的计算公式如下。
QS=0.254d(ln1H)/d(ln1H)d(1T)d(1T) (6) ΔG=−RT18lnH (7) ΔS=QS−ΔG/T (8) 式中:T为温度(K);R为气体常数。
T和H的值均由DVS实验的拟合数据获取,然后分别通过公式(6)、(7)计算得到QS和ΔG的值,进一步计算得到ΔS。
2. 结果与讨论
2.1 细胞壁结构
图1为考古木材与现代木材横切面、纵切面的SEM图片。对比考古木材与现代木材图像,可以发现在经历长时间的饱水腐朽下,考古木材除复合胞间层、细胞角隅保存相对完整外[16-17],其细胞壁结构发生了明显的变化,与现代木材完整有序的细胞排列相比(图1b),考古木材由于长时间遭受微生物降解,细胞结构发生破坏,细胞壁产生腐朽。
具体而言,考古木材细胞壁上出现少量圆形孔洞(图1a),除此之外,从考古木材纵切面可见纹孔膜腐朽细节(图1c),并有菌丝体的存在(图1d),该菌丝体是导致考古木材在所处环境中受到降解的各类真菌的聚集体。Guo等[11]通过氮气吸附法和压汞法对山桐子(Idesia polycarpa)考古木材多孔结构的研究结果表明,考古木材的中孔隙的总孔体积比现代木材样品增加了471%,这也进一步证明了本研究中考古木材孔洞增多的事实。
2.2 化学成分变化
对等量考古木材与现代木材样品的红外光谱进行归一化处理后,可用吸收峰高度半定量表示吸收峰所代表基团的含量[18],通过对比考古木材与现代木材试样红外光谱(图2)的特征吸收峰位置变化及消失情况,结合各特征吸收峰所代表的化学基团,研究得到考古木材3种主要化学成分(纤维素、半纤维素、木质素)的含量变化情况及极性基团−OH、−COOH类型和含量的变化情况。
3 337 ~ 3 401 cm−1范围内的吸收峰代表极性基团−OH(O−H伸缩振动),考古木材在此处的吸收峰高度小于现代木材,证明考古木材中−OH含量减少。选取1 742 cm−1(半纤维素C=O伸缩振动)、1 231 cm−1(半纤维素酰氧键−COO伸缩振动)为半纤维素的代表特征峰,与现代木材相比,柏木考古木材的红外吸收光谱在1 742、1 231 cm−1处吸光度变小,特别是在1 742 cm−1处吸收峰几乎完全消失,证明考古木材细胞壁结构中的半纤维素降解严重;另一方面,1 231 cm−1吸收峰代表半纤维素酰氧键−COO,考古木材在1 231 cm−1处的吸收峰高度明显小于现代木材,证明考古木材半纤维素上的−COOH含量减少。
此外,由于考古木材纤维素结晶区中纤维素链的氢键网络的部分断裂,导致892 cm−1处的峰几乎消失,而该处波峰代表C−H弯曲振动,并且对氢键系统的性质敏感,因此该峰几乎消失表明,在考古木材试样中形成更稳定氢键的羟基数量减少,同时这也表明考古木材中无论是无定形区还是结晶区中的纤维素链都发生部分降解[19]。
指纹区吸收光谱峰数多、较为复杂,包含了更多能反映分子结构细微变化的信息[20]。为了提供更多的信息,将FTIR光谱图分析细化至3个指纹区域(1 550 ~ 1 800 cm−1、1 200 ~ 1 550 cm−1和850 ~ 1 200 cm−1),在这个范围内通过直接的红外光谱分析考古木材和现代木材仍存在一定局限性,因为指纹区往往存在高度重叠的峰,难以分辨和解析。为此,通过对考古木材和现代木材指纹区光谱进行分峰拟合处理,得到分峰拟合曲线,可以更直观地分析考古木材化学成分的变化。
通过对比考古木材和现代木材FTIR在1 550 ~ 1 800 cm−1波数范围内的分峰拟合曲线(图3a)可以发现,考古木材在1 654 cm−1(木质素中共轭C=O伸缩振动)处吸收峰吸光度值较高,这说明考古木材木质素相对含量升高。通过对比考古木材和现代木材FTIR在1 200 ~ 1 550 cm−1波数范围内的分峰拟合曲线(图3b)可以发现,考古木材在1 418 cm−1(木质素甲基中C−H弯曲振动)处吸收峰强度变大,代表考古木材木质素相对含量升高。通过对比分析考古木材和现代木材FTIR在850 ~ 1 200 cm–1波数范围内的分峰拟合曲线(图3c)可以得到:考古木材在892 cm–1(纤维素C−H弯曲振动)处峰几乎消失,这表明在考古木材中形成更稳定氢键的羟基数目减少;1 159 cm–1(综纤维素C−O−C变形振动)处,考古木材吸收峰吸光度值很低,这表明综纤维素也有一定程度的降解。
综上可以发现,考古木材与现代木材相比,半纤维素、纤维素降解严重,纤维素骨架结构受到破坏,因此在SEM下可观察到细胞壁产生腐朽,这种化学成分和化学结构的变化进一步导致了细胞壁孔洞的出现,从化学成分变化角度解释了SEM中观察到考古木材出现孔洞等腐朽现象的原因。通过Xia等[21]的研究,考古木材木质素的化学结构也发生了变化,木质素仍会有降解,但考古木材中多糖类物质(纤维素、半纤维素)比芳环类物质(木质素)降解程度更高,因而木质素相对含量总体有升高趋势[22-23]。除纤维素、半纤维素含量降低及木质素相对含量升高的变化外,考古木材中极性基团−OH、−COOH含量均减少,导致考古木材对水分的吸着减少。
2.3 吸附热力学分析
2.3.1 Hailwood-Horrobin模型拟合
通过Hailwood-Horrobin模型拟合等温吸附曲线,不仅可以得到给定温度下木材吸湿和解吸任意平衡含水率状态下的相对湿度,更可以通过研究考古木材与现代木材的曲线差异,帮助理解考古木材水分吸附行为的差异本质。
根据Hailwood-Horrobin模型分别拟合出在25和50 ℃下考古木材、现代木材的等温吸附曲线(图4)。从中可以看出各等温吸附曲线的拟合度R2值均高于0.99,即Hailwood-Horrobin模型能够较好地描述考古木材及现代木材的等温吸附曲线。所有的等温吸附曲线均呈现“S”形,这说明无论考古木材还是现代木材都属于Ⅱ类等温吸附曲线,具备多孔材料的吸附特征[24-25]。在给定温度的每一个相对湿度条件下,考古木材的平衡含水率均高于现代木材,以温度为50 ℃,相对湿度为0.6时为例,考古木材平衡含水率为7.94%,现代木材为7.46%,考古木材是现代木材的1.1倍。这是因为图1a的 SEM图像显示考古木材物理环境遭到改变,细胞壁孔洞增多,即木材降解程度越大,木材细胞壁内孔隙越多,对水分的容纳空间增加,含水率越高,所以考古木材在经历长时间的降解后平衡含水率高于现代木材。
图5为50 ℃下考古木材吸湿和解吸平衡状态的等温吸附曲线,图5显示考古木材的解吸曲线始终位于吸湿之上,即出现了水分吸湿滞后现象。表1总结了在不同相对湿度条件下,考古木材、现代木材分别在25、50 ℃下的滞后率。从表1可以看出:随着温度或相对湿度的升高,考古木材和现代木材的滞后率均增大,即水分吸湿滞后均减小,这与以往研究结果一致[13];另一方面,考古木材与现代木材的水分吸湿滞后大小差异不大。
2.3.2 吸湿平衡状态下的热力学量分析
2.3.2.1 微分吸着热
图6是吸湿平衡状态下考古木材与现代木材中水分的微分吸着热(QS)随含水率(moisture content,MC)的变化曲线,QS值越大表示木材中水分子与周围分子之间的结合力越强[13]。与以往研究结果略有不同的是,在MC为5%处产生一明显拐点。根据曲线变化趋势,可以将曲线分为两个阶段,当MC小于 5%的低含水率状态下时,QS值逐渐增大直至达到最大值,这表明水分子和木材之间的氢键结合首先表现为单层分子之间的相互结合,且随MC增大,单个水分子和木材中的−OH形成了更多的氢键结合,相互作用更强,形成的键能更高[18]。当含水率大于5%时,QS值随MC的增大而减小,此时单分子层吸着水几乎达到饱和,吸着水分子与木材实质之间形成的氢键结合作用变弱,键能降低[13]。
表 1 考古木材、现代木材在25、50 ℃下不同相对湿度下的吸湿滞后Table 1. Moisture sorption hysteresis of archaeological wood and recent wood under different relative humidities at 25 and 50 ℃相对湿度
Relative humidity滞后率 Hysteresis rate 25 ℃考古木材
25 ℃-archaeological wood50 ℃考古木材
50 ℃-archaeological wood25 ℃现代木材
25 ℃-recent wood50 ℃现代木材
50 ℃-recent wood0.1 0.62 0.74 0.63 0.71 0.2 0.63 0.72 0.64 0.73 0.3 0.64 0.72 0.65 0.74 0.4 0.66 0.73 0.67 0.76 0.5 0.68 0.75 0.70 0.78 0.6 0.71 0.77 0.73 0.81 0.7 0.76 0.81 0.77 0.84 0.8 0.82 0.86 0.84 0.89 0.9 0.91 0.94 0.93 0.95 考古木材与现代木材相比,整体曲线形状基本相同,但考古木材的QS值随MC的变化曲线位于现代木材之下。根据上文FTIR分析,考古木材化学成分中纤维素、半纤维素大量降解,因此外界水分子可结合−OH、−COOH位点数量减少,这种化学环境的改变导致吸着水与木材分子之间的结合减少,QS值降低[26]。
2.3.2.2 自由能变化
水分的自由能变化的物理意义是水分子润胀木材并切断木材分子相互间氢键结合,裸露木材吸着点所需做的功[13]。基于图7所示吸湿平衡状态下考古木材与现代木材中水分的自由能变化ΔG值随MC的变化曲线,可以发现考古木材与现代木材的ΔG值均随MC的增大而减小。ΔG值与MC变化呈负相关可以解释为,MC升高使木材可塑性增大,吸着水分子与木材实质分子的协同运动加剧,因此裸露木材吸着点所需做的功减少。
其次,无论是考古木材或是现代木材,50 ℃相较于25 ℃的ΔG值都有一定程度的减小,这是因为温度升高吸着水分子能量增加,活动加剧,所需做的功减小。
2.3.2.3 微分吸着熵
微分吸着熵(ΔS)体现了木材中吸着的水分子与液态水分子相比排列规则上的差异,ΔS > 0代表木材中水分子排列更有规律[13]。根据吸湿平衡状态下考古木材与现代木材中水分的ΔS值随MC的变化曲线(图8)可知:ΔS值与QS值随MC的变化曲线在MC小于5%呈现相似的变化趋势,都随MC的增大而增大。在MC小于5%的低含水率阶段,ΔS < 0表明木材中吸着的水分子比液态水分子更无序,这是因为此时木材中吸着的水分子主要为单分子层吸着水,它们比处于液体状态的水分子显示出更无序的状态;在经过5%的拐点之后,ΔS值随MC变化不明显。而随着MC的增大,ΔS值经历了由负到正、由无序到有序的变化,这说明吸着在木材中的水分子排列越来越规则。
进一步分析考古木材与现代木材的曲线差异,考古木材ΔS值低于现代木材,这是因为考古木材在经历长期酸碱环境下软腐菌等真菌的降解后[27],细胞壁出现的孔洞分布是随机的,且与水结合的−OH分布也十分不均匀,造成考古木材中吸着的水分子排列更无序。
2.3.3 水分吸湿与解吸的比较
以50 ℃考古木材为例,分别绘制QS、ΔG、ΔS三大热力学量随MC的变化曲线,每张图包含吸湿和解吸平衡态下的两条曲线(图9)。发现吸湿和解吸变化曲线形状基本一致,但解吸的QS、ΔG和ΔS值均大于吸湿的值[14],对应于水分吸湿滞后(图5),这个现象即为“热力学吸湿滞后”,其表征在吸湿与解吸平衡态下,每一个吸着水分子与木材吸着点之间的氢键结合平均数的差异[13]。
热力学吸湿滞后同样可以用水分吸湿滞后的“有效羟基说”[28]解释,即在干燥状态下,部分木材吸着点之间形成氢键结合,当木材从干燥状态开始吸湿时,由于这部分已经形成的氢键结合的影响,处于游离状态能够吸着水分子的吸着点的数量减少,每个吸着水分子与木材吸着点之间的氢键结合平均数减少,从而吸湿的热力学量也低于解吸过程。
3. 结 论
为探究考古木材的水分吸着行为与现代木材的差异机理,本研究从考古木材与现代木材微观结构与吸附热力学两个层面进行了研究。
考古木材三大主要成分(纤维素、半纤维素、木质素)均发生不同程度的降解,且考古木材中极性基团−OH、−COOH含量均减少,导致考古木材对水分的吸着减少。其中半纤维素、纤维素降解程度更大,因此在SEM中可观察到细胞壁产生腐朽,且可见孔洞分布;而考古木材中多糖类物质(纤维素、半纤维素)比芳环类物质(木质素)降解程度更高,因而木质素相对含量升高。
在吸附热力学研究中,通过DVS等温吸附实验并利用Hailwood-Horrobin模型拟合等温吸附曲线,在给定温度条件下考古木材的平衡含水率高于现代木材。结合Clausius-Clapeyron公式计算考古木材与现代木材的QS、ΔG和ΔS三大热力学量。考古木材因纤维素、半纤维素降解导致−OH、−COOH数量减小,QS值低于现代木材;考古木材与现代木材的ΔG值差异不大,且随温度升高而减小;考古木材的细胞壁孔洞、−OH分布不均匀,所以ΔS值低于现代木材;在MC小于5%,考古木材QS值和ΔS值随MC的变化曲线趋势相似,在此范围内木材中吸着的水分子主要为单分子层吸着水,随后在5%处产生一拐点,此时单分子层吸着水达到饱和,此后木材中吸着的水分子以多分子层吸着水占主导。最后,通过对比吸湿和解吸过程的热力学量(吸湿 < 解吸),发现考古木材存在热力学吸湿滞后现象。
基于以上对于考古木材水分吸着行为差异的研究,考古木材的吸湿性在经历长时间的泡水、腐朽下发生了较大变化,因此在出土饱水木质文物的保护工作中,建议采用各种物理、化学手段减少木质文物与环境中水分的相互作用,如涂覆防水涂层、浸渍脱水材料等,从而提高木质文物的尺寸稳定性[29],为我国出土饱水木质文物的保护提供理论支撑。
-
表 1 实验材料信息
Table 1 Experimental material information
种子园
Seed orchard材料来源
Material source数量
Quantity1st 良种基地LiangZhongJiDi(LZJD) 57 头道桥TouDaoQiao(TOU) 15 宝根园BaoGenYuan(BAO) 11 巴日图BaRiTu(BA) 11 红林场HongLinChang(HONG) 14 1.5th 榆林YuLin1.5(YL1.5) 28 2nd 错海CuoHai(CH) 34 泰来TaiLai(TL) 33 榆林YuLin2(YL2) 21 表 2 樟子松SSR多态性引物
Table 2 Polymorphic SSR primers of Pinus sylvestris var. mongolica
编号
NO.位点
Locus引物序列
Primer sequence (5′ -3′)退火温度
Annealing
temperature/℃重复基元
Repeat motif片段大小
Fragment
size/bp多态信息含量
Polymorphism information
content (PIC)1 lw_isotig05123 F:TGTGCGTATAGGAGGTGGAG
R:ATGAAAGGTGACAAAGCGGT55 (GAG)6 180~186 0.184 2 lw_isotig07383 F:CAAACAAAAAACAGTCTGCA R:ATCGTCATCATCATCGTCAC 55 (GAT)8 198~216 0.555 3 lw_isotig26230 F:GGGCATTACATAAACACGGG R:TGCCCTTGAGCATTTGATTA 55 (TA)10 263~291 0.393 4 lw_isotig02138 F:ATGCATCTTGTCCTCTCT
R:TTCCTGATTCACACTCCC42 (AG)6 135~143 0.200 5 lw_isotig01420 F:TCCGTGACCCTATTACGT R:CGATTAGTTGCTTGCCTT 50 (CTG)5 184~196 0.520 6 lw_isotig04306 F:GCCATTTTTTTCTTCTCTCCT R:GGTCGGTTTCTGAATTTCTAA 55 (TCC)7 197~215 0.555 7 lw_isotig04204 F:CTCCGTTTGGGTTGTGTTTG R:ATCCTTGCCGCCAGATTTGT 55 (CGGCT)5 243~263 0.291 8 lw_isotig11166 F:ACACACACTGAGCTCCAATTT R:AGTCCCACCTCTGCTGATACA 55 (TA)7 160~170 0.715 9 lw_isotig10603 F:CAAAATCGTCTACTTCTCCCCC R:CAAAGCAAAAGAACTCCAACGA 55 (CAG)7 208~223 0.443 10 lw_isotig21953 F:ATGGTGTGTTTGAAGCGGAA R:ATTGCAGCCACTGGTGTCTT 55 (ATGGG)7 217~309 0.831 11 lw_isotig20215 F:AGAGGTGATCGCAGTCAAAGA
CAAAAAGACCAAACCGTAG55 (TA)7 194~212 0.665 表 3 不同地区樟子松群体遗传多样性水平
Table 3 Genetic diversity level of Pinus sylvestris var. mongolica populations in different regions
种子园
Seed orchard群体
Population观测等位基因
Observe number of
allele (Na)有效等位基因
Effectivenumber
of allele (Ne)Shannon多样性指数
Shannon’s
diversity
index (I)观测杂合度
Nei’s observed
heterozygosity
(Ho)期望杂合度
Nei’sexpected
heterozygosity
(He)LZJD 4.909 2.519 0.995 0.453 0.528 TOU 4.091 2.705 1.002 0.505 0.533 1st BAO 3.636 2.549 0.890 0.417 0.470 BA 3.636 2.376 0.910 0.455 0.498 HONG 4.000 2.576 0.975 0.536 0.522 1.5th YL1.5 4.818 2.600 1.000 0.488 0.511 CH 4.636 2.446 0.963 0.425 0.499 2nd TL 4.364 2.611 0.995 0.484 0.534 YL2 3.818 2.312 0.879 0.388 0.467 表 4 不同世代樟子松种子园遗传多样性
Table 4 Genetic diversity of seed orchards in different generations of Pinus sylvestris var. mongolica
位点
编号
Locus
No.观测等位基因
Observe number of
allele (Na)有效等位基因
Effective number
of allele (Ne)基因型数
Number of genotype观测杂合度
Nei’s observed
heterozygosity (Ho)期望杂合度
Nei’s expected
heterozygosity (He)Shannon多样性指数
Shannon’s
diversity
index (I)多态信息含量
Polymorphism
information content(PIC)近交系数
Inbreeding
coefficient (F)1 3/3/3 1.182/1.241/1.342 4/3/4 0.130/0.214/0.273 0.154/0.195/0.255 0.316/0.389/0.459 0.145/0.181/0.228 0.159/-0.102/-0.064 2 5/5/7 2.218/2.387/2.531 11/5/13 0.463/0.321/0.409 0.549/0.581/0.605 1.072/1.123/1.286 0.509/0.530/0.576 0.157/0.447/0.329 3 3/3/3 1.991/2.013/1.923 5/5/4 0.287/0.357/0.125 0.498/0.503/0.480 0.771/0.815/0.715 0.399/0.420/0.375 0.423/0.290/0.742 4 4/2/2 1.379/1.074/1.174 7/2/2 0.292/0.071/0.161 0.275/0.069/0.148 0.511/0.154/0.280 0.274/0.067/0.137 -0.064/-0.037/-0.082 5 5/5/4 2.337/2.644/2.245 9/7/7 0.639/0.643/0.625 0.572/0.622/0.555 1.032/1.144/0.992 0.513/0.555/0.500 -0.117/-0.034/-0.121 6 6/5/4 2.477/2.469/2.849 10/7/9 0.611/0.821/0.659 0.596/0.595/0.649 1.093/1.052/1.183 0.528/0.511/0.591 -0.025/-0.380/-0.01 7 2/2/2 1.693/1.280/1.453 2/2/2 0.574/0.250/0.386 0.409/0.219/0.312 0.599/0.377/0.491 0.326/0.195/0.263 -0.403/-0.143/-0.234 8 6/6/6 3.807/4.000/4.260 17/12/16 0.519/0.679/0.648 0.737/0.750/0.765 1.498/1.522/1.564 0.696/0.712/0.727 0.297/0.095/0.159 9 5/4/4 2.192/2.253/2.088 7/6/7 0.593/0.464/0.523 0.544/0.556/0.521 0.900/0.939/0.858 0.446/0.465/0.430 -0.090/0.165/0.002 10 11/10/14 6.487/5.809/6.156 37/17/33 0.704/0.778/0.779 0.846/0.828/0.838 2.043/1.959/2.071 0.828/0.808/0.819 0.168/0.060/0.076 11 10/8/8 3.113/3.431/2.967 24/11/16 0.340/0.333/0.232 0.679/0.709/0.663 1.536/1.439/1.346 0.690/0.664/0.610 0.499/0.530/0.654 总计
Total5.455/4.818/5.182 2.625/2.600/2.635 12.091/7.000/10.273 0.468/0.448/0.438 0.533/0.511/0.526 1.034/1.000/1.022 0.487/0.464/0.478 0.091/0.081/0.173 注:“/”左边、中间、右边分别代表:1、1.5、2代园的遗传参数。Notes:the genetic parameters of the1st, 1.5th and 2nd seed orchards were on the left, middle and right. 表 5 樟子松分子方差分析与固定指数
Table 5 Analysis of molecular variance and fixation index of Pinus sylvestris var. mongolica
种子园Seed orchard 变异来源Source of variation 自由度Degree of freedom 方差Variance 均方差Mean variance 估计方差Est. Var. 变异系数Coefficient of variation/% 固定指数Fixation index(Fst) 1st 群体间Among populations 4 51.633 3.908 0.015 0 群体内个体间Among individuals within population 103 347.849 3.377 0.408 14 0.041 群体间个体间Among individuals between populations 108 276.500 2.560 2.560 86 总计Total 215 639.981 2.983 100 2nd 群体间Among populations 2 22.060 11.030 0.134 4 群体内个体间Among individuals within population 85 282.713 3.326 0.467 16 0.045 群体间个体间Among individuals between populations 88 210.500 2.392 2.392 80 总计Total 175 515.273 2.993 100 -
[1] 郑万钧.中国树木志:第4卷[M].北京:中国林业出版社, 2004. ZHENG W J.Flora of China: fourth volumes[M]. Beijing:China Forestry Publishing House, 2004.
[2] 焦树仁.章古台固沙林生态系统的结构与功能[M].沈阳:辽宁科学技术出版社, 1989:39-49. JIAO S R.Structure and functions of sand fixation forest ecosystem in Zhanggutai[M].Shenyang:Liaoning Science & Technology Press, 1989:39-49.
[3] 康宏樟, 朱教君, 李智辉, 等.沙地樟子松天然分布与引种栽培[J].生态学杂志, 2004, 23(5):134-139. doi: 10.3321/j.issn:1000-4890.2004.05.026 KANG H Z, ZHU J J, LI Z H, et al.Natural distribution of Pinus sylvestris var. mongolica on sandy land and its cultivation as an exotic species[J]. Chinese Journal of Ecology, 2004, 23(5):134-139. doi: 10.3321/j.issn:1000-4890.2004.05.026
[4] 赵兴梁, 李万英.樟子松[M].北京:农业出版社, 1963. ZHAO X L, LI W Y. Mogolica pine[M]. Beijing: Agricultural Press, 1963.
[5] 朱教君, 曾德慧, 康宏樟, 等.沙地樟子松人工林衰退机制[M].北京:中国农业出版社, 2005:5. ZHU J J, ZENG D H, KANG H Z, et al. Decline of Pinus sylvestris var. mongolica Plantations on sandy land[M].Beijing:China Forestry Publishing House, 2005:5.
[6] 刘桂丰, 杨传平, 杨书文, 等.樟子松引种适生范围的研究[J].东北林业大学学报, 1990, 18(增刊2):122-128. http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTOTAL-DBLY1990S2018.htm LIU G F, YANG C P, YANG S W, et al. The adaptative range of Pinus sylvestris var. mongolica as exotic species[J]. Journal of Northeast Forestry University, 1990, 18(Suppl.2):122-128. http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTOTAL-DBLY1990S2018.htm
[7] 毛玉琪, 张景林, 刘录, 等.樟子松初级种子园子代测定及早期增益研究[J].防护林科技, 1991(2):18-24. http://www.wanfangdata.com.cn/details/detail.do?_type=perio&id=HY000002512478 MAO Y Q, ZHANG J L, LIU L, et al. Study on progeny test and early gain of Pinus sylvestris var.mongolica preliminary seed orchard[J]. Protection Forest Science and Technology, 1991(2):18-24. http://www.wanfangdata.com.cn/details/detail.do?_type=perio&id=HY000002512478
[8] 王新星, 赵国平, 史社强, 等.陕西榆林樟子松细根分布特征[J].东北林业大学学报, 2014, 42(10):16-19. doi: 10.3969/j.issn.1000-5382.2014.10.004 WANG X X, ZHAO G P, SHI S Q, et al. Distribution characteristics of Pinus sylvestris var.mongolica fine roots in Yulin City, Shaanxi Province[J]. Journal of Northeast Forestry University, 2014, 42(10):16-19. doi: 10.3969/j.issn.1000-5382.2014.10.004
[9] 刘国权, 张晓光, 张力华.河北坝上地区樟子松人工林天然更新与人工促进措施研究[J].河北林业科技, 2009, 37(4):22-23. doi: 10.3969/j.issn.1002-3356.2009.04.011 LIU G Q, ZHANG X G, ZHANG L H. Study on natural regeneration and artificial promotion measures of Pinus sylvestris var. mongolica plantation in Hebei Dam[J]. The Journal of Hebei Forestry Science and Technology, 2009, 37(4):22-23. doi: 10.3969/j.issn.1002-3356.2009.04.011
[10] 徐炳芳, 张凯鹏, 徐云峰, 等.净月潭国家级森林公园樟子松生长状况的调查与分析[J].吉林林业科技, 2014, 43(4):19-23. doi: 10.3969/j.issn.1005-7129.2014.04.007 XU B F, ZHANG K P, XU Y F, et al. Investigation and analysis of growth condition of Pinus sylvestris var.mongolica in Jingyuetan National Forest Park[J].Journal of Jilin Forestry Science and Technology, 2014, 43(4):19-23. doi: 10.3969/j.issn.1005-7129.2014.04.007
[11] 李文荣.山西省北部地区樟子松引种情况的调查[J].山西林业科技, 1983, 13(2):26-32. http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTOTAL-SXNY198302008.htm LI W R.Investigation of the introduction of Pinus sylvestris var. mongolica in northern Shanxi Province[J]. Shanxi Forestry Science and Technology, 1983, 13(2):26-32. http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTOTAL-SXNY198302008.htm
[12] 张树根, 张泽宁, 聂向东.樟子松遗传改良研究现状及育种策略[J].林业调查规划, 2008, 33(5):116-119. doi: 10.3969/j.issn.1671-3168.2008.05.031 ZHANG S G, ZHANG Z N, NIE X D. Discussion on current situation and breeding tactics of genetic improvement of Pinus sylvestris var. mongolica[J]. Forest Inventory and Planning, 2008, 33(5):116-119. doi: 10.3969/j.issn.1671-3168.2008.05.031
[13] 刘录, 张景林, 毛玉琪, 等.樟子松杂交亲本及杂交组合选择阶段研究[J].林业实用技术, 1997, 40(5):10-13. http://www.wanfangdata.com.cn/details/detail.do?_type=perio&id=QK199700375808 LIU L, ZHANG J L, MAO Y Q, et al.Study on the selection stage of hybrids and hybrid combinations of Pinus sylvestris var. mongolica[J]. Practical Forestry Technology, 1997, 40(5):10-13. http://www.wanfangdata.com.cn/details/detail.do?_type=perio&id=QK199700375808
[14] 金小红, 金志明, 张连才, 等.白城市林科所试验林中形成的樟子松×长白松和樟子松×黑松天然杂种选择[J].吉林林业科技, 1999, 28(1):1-318. http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTOTAL-JLLK199901000.htm JIN X H, JIN Z M, ZHANG L C, et al.Selection of natural hybrid of Pinus sylvestris var. mongolica×Pinus syluestriformis and Pinus sylvestris var. mongolica×Pinus thunbergii in Baicheng Forestry Institute[J]. Journal of Jilin Forestry Science and Technology, 1999, 28(1):1-318 http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTOTAL-JLLK199901000.htm
[15] 文亚峰, 韩文军, 吴顺.植物遗传多样性及其影响因素[J].中南林业科技大学学报, 2010, 30(12):80-87. doi: 10.3969/j.issn.1673-923X.2010.12.016 WEN Y F, HAN W J, WU S. Plant genetic diversity and its influencing factors[J]. Journal of Central South University of Forestry & Technology, 2010, 30(12):80-87. doi: 10.3969/j.issn.1673-923X.2010.12.016
[16] BOOY G, HENDRIKS R J J, SMULDERS M J M, et al.Genetic diversity and the survival of populations[J]. Plant Biology, 2000, 2(4):379-395. doi: 10.1055/s-2000-5958
[17] GRIFFINA R, LINDGREN D. Effect of inbreeding on production of filled seed in Pinus radiata: experimental results and a model of gene action[J]. Theoretical and Applied Genetics, 1985, 71(2):334-343. doi: 10.1007/BF00252077
[18] FORD G A, MCKEAND S E, JETT J B, et al. Effects of inbreeding on growth and quality traits in loblolly pine[J]. Forest Science, 2015, 61(3):579-585. doi: 10.5849/forsci.13-185
[19] KÄRKKÄINEN K, KOSKI V, SAVOLAINEN O.Geographical variation in the inbreeding depression of Scots pine[J].Society for the Study of Evolution, 1996, 50(1):111-119. http://cn.bing.com/academic/profile?id=ebe8cf758c2af51a117015ace745dc6b&encoded=0&v=paper_preview&mkt=zh-cn
[20] DUREL C E, BERTIN P, KREMER A. Relationship between inbreeding depression and inbreeding coefficient in maritime pine (Pinus pinaster)[J]. Theoretical and Applied Genetics, 1996, 92(3):347-356. http://d.old.wanfangdata.com.cn/NSTLQK/NSTL_QKJJ0215059532/
[21] BOWERA D, AITKEN S N. Mating system and inbreeding depression in whitebark pine (Pinus albicaulis Engelm.)[J]. Tree Genetics & Genomes, 2007, 3(4):379-388.
[22] POREBSKI S, BAILEY L G, BAUM B R. Modification of a CTAB DNA extraction protocol for plants containing high polysaccharide and polyphenol components[J]. Plant Molecular Biology Reporter, 1997, 15(1):8-15. doi: 10.1007/BF02772108
[23] FANG P, NIU S H, YUAN H W, et al.Development and characterization of 25 EST-SSR markers in Pinus sylvestris var. mongolica (Pinaceae)[J]. Applications in Plantsciences, 2014, 2(1):1841-1843. http://www.wanfangdata.com.cn/details/detail.do?_type=perio&id=Doaj000003745632
[24] TEMPLETONA R. Introduction to conservation genetics[M]. Cambridge:Cambridge University Press, 2010:56.
[25] FRANKHAM R, BALLOU J D, BRISCOE D A, et al.Genetic variation, mating patterns and gene flow in a Pinus pinaster Aiton clonal seed orchard[J]. Annals of Forest Science, 2008, 65(7):706. doi: 10.1051/forest:2008049
[26] 袁虎威, 梁胜发, 符学军, 等.山西油松第二代种子园亲本选择与配置设计[J].北京林业大学学报, 2016, 38(3):47-54. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/bjlydxxb201603006 YUAN H W, LIANG S F, FU X J, et al. Parental selection and deployment design in the second-generation seed orchard of Chinese pine in Shanxi Province[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(3):47-54. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/bjlydxxb201603006
[27] 袁虎威, 王晓飞, 杜清平, 等.基于BWB的油松初级种子园混合子代优树选择与配置设计[J].北京林业大学学报, 2017, 39(11):28-34. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/bjlydxxb201711004 YUAN H W, WANG X F, DU Q P, et al. BWB-assisted plus tree selection and deployment design for bulked progenies of the first-cycle Chinese pine seed orchard[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2017, 39(11):28-34. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/bjlydxxb201711004
[28] 于大德, 袁定昌, 张登荣, 等.华北落叶松种子园不同世代间遗传多样性变化[J].植物遗传资源学报, 2014, 15(5):940-947. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/zwyczyxb201405004 YU D D, YUAN D C, ZHANG D R, et al. Genetic diversity of Larix principis-rupprechtii Mayr. seed orchard among generations[J]. Journal of Plant Genetic Resources, 2014, 15(5):940-947. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/zwyczyxb201405004
[29] 谭小梅, 周志春, 金国庆, 等.马尾松二代无性系种子园遗传多样性和交配系统分析[J].林业科学, 2012, 48(2):69-74. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/lykx201202010 TAN X M, ZHOU Z C, JIN G Q, et al. Genetic diversity and mating system analysis of Pinus massoniana in a second-generation clonal seed orchard[J]. Scientia Silvae Sinicae, 2012, 48(2):69-74. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/lykx201202010
[30] NAMKOONG G. Inbreeding effects on estimation of genetic additive variance[J].Forest Science, 1966, 12(1):8-13.
[31] HODGE G R, WHITE T L. Advanced-generation wind-pollinated seed orchard design[J].New Forests, 1993, 7(3):213-236. doi: 10.1007/BF00127387
-
期刊类型引用(6)
1. 冯林艳,周火艳,赵晓迪. 乌兰布和沙漠两种植物的分布格局及其变化. 南京林业大学学报(自然科学版). 2024(01): 155-160 . 百度学术
2. 曾红,徐永艳,邵琳亚,闻永慧,夏小丽,汪琼. 4种植物叶片浸提液成分分析及其对珊瑚樱种子萌发的影响. 西南林业大学学报(自然科学). 2023(04): 39-46 . 百度学术
3. 马光宗,徐高峰,杨韶松,杨云海,张付斗,温丽娜,陶琼,申时才,叶敏. 甘薯提取物对3种杂草种子萌发和幼苗生长的化感作用. 西南农业学报. 2022(06): 1295-1302 . 百度学术
4. 路文杰,佛芒芒,肖毅,王永新,杜利霞,钟华,赵祥,董宽虎. 草地植物凋落物浸提液对根际微生物碳源利用的影响. 中国草地学报. 2021(06): 35-42 . 百度学术
5. 张林媚,刘姝玲,郭彩云. 立地条件对榆林沙区樟子松嫁接红松生长的影响. 林业科技通讯. 2021(11): 32-37 . 百度学术
6. 王方琳,尉秋实,柴成武,王理德,张德魁,王昱淇,王飞,胡小柯. 沙蒿(Artemisia desertorum)浸提液对自身种子萌发与幼苗生长的化感作用. 中国沙漠. 2021(06): 21-28 . 百度学术
其他类型引用(3)