刚竹属3种重要散生竹光系统Ⅰ基因（Lhca1）的克隆、序列分析和蛋白结构预测

唐文莉; 彭镇华; 高健

刚竹属3种重要散生竹光系统Ⅰ基因（Lhca1）的克隆、序列分析和蛋白结构预测

1 国际竹藤网络中心，国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室2 中国林业科学研究院林业研究所

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出版历程
- 收稿日期: 1899-12-31
- 修回日期: 1899-12-31
- 发布日期: 2008-07-29

Cloning and sequence analysis of the light harvesting complex Ⅰ gene（Lhca1） from three kinds of Phyllostachys and structure prediction of the protein

1 Key Laboratory of Bamboo and Rattan Science & Technology of State Forestry Administration, International Centre for Bamboo and Rattan, Beijing, 100102, P. R. China; 2 Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry,Beijing, 100091, P. R. China.

摘要

摘要: 光系统Ⅰ(PSⅠ)在植物光合系统中具有重要功能，Lhca1是编码PSⅠ复合物中最主要的捕光色素蛋白LHCⅠ的基因。该研究采用RT-PCR法，从毛竹中克隆了捕光叶绿素a/b结合蛋白基因Lhca-Pe01(GenBank EU035496)的全长，从红壳竹和角竹中克隆了长度分别为616、613 bp的捕光叶绿素a/b结合蛋白基因片段LhcaH01(GenBank EU513200、 LhcaJ01(GenBank EU513201)。运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列以及蛋白结构进行预测。结果表明，LhcaPe01基因序列从第39 bp开始到第779 bp含有1个开放阅读框和一个中止密码子，该基因全长1 051 bp，在5′端有38 bp的非编码区，在3′端含有242 bp的非编码区和Poly(A) 30 bp。对这3个基因的保守片段的序列分析表明，刚竹属3种竹种毛竹、红壳竹和角竹保守区内核酸序列同源性非常高，在禾本科内不同属之间毛竹与大麦序列同源性最高，玉米次之。编码的氨基酸序列同源性与核酸序列同源性一致，最高是毛竹与大麦，水稻次之。经推测LhcaPe01编码的蛋白质等电点和分子量分别为5.400 0和22 107.34 D。蛋白质结构预测表明，毛竹、大麦、水稻、玉米的LHCⅠ蛋白结构非常相似。
- 毛竹 /
- 红壳竹 /
- 角竹 /
- Lhca1 /
- 克隆 /
- 序列分析 /
- 结构预测
- Phyllostachys edulis /
- Phyllostachys iridescens /
- Phyllostachys fimbriligula /
- Lhca1 /
- genecloning /
- sequence analysis /
- structure prediction