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刚竹属3种重要散生竹光系统Ⅰ基因(Lhca1)的克隆、序列分析和蛋白结构预测

唐文莉 彭镇华 高健

唐文莉, 彭镇华, 高健, . 刚竹属3种重要散生竹光系统Ⅰ基因(Lhca1)的克隆、序列分析和蛋白结构预测[J]. 北京林业大学学报, 2008, 30(4): 109-115.
引用本文: 唐文莉, 彭镇华, 高健, . 刚竹属3种重要散生竹光系统Ⅰ基因(Lhca1)的克隆、序列分析和蛋白结构预测[J]. 北京林业大学学报, 2008, 30(4): 109-115.
TANG Wen-li, PENG Zhen-hua, , GAO Jian. Cloning and sequence analysis of the light harvesting complex Ⅰ gene(Lhca1) from three kinds of Phyllostachys and structure prediction of the protein[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2008, 30(4): 109-115.
Citation: TANG Wen-li, PENG Zhen-hua, , GAO Jian. Cloning and sequence analysis of the light harvesting complex Ⅰ gene(Lhca1) from three kinds of Phyllostachys and structure prediction of the protein[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2008, 30(4): 109-115.

刚竹属3种重要散生竹光系统Ⅰ基因(Lhca1)的克隆、序列分析和蛋白结构预测

Cloning and sequence analysis of the light harvesting complex Ⅰ gene(Lhca1) from three kinds of Phyllostachys and structure prediction of the protein

  • 摘要: 光系统Ⅰ(PSⅠ)在植物光合系统中具有重要功能,Lhca1是编码PSⅠ复合物中最主要的捕光色素蛋白LHCⅠ的基因。该研究采用RT-PCR法,从毛竹中克隆了捕光叶绿素a/b结合蛋白基因Lhca-Pe01(GenBank EU035496)的全长,从红壳竹和角竹中克隆了长度分别为616、613 bp的捕光叶绿素a/b结合蛋白基因片段LhcaH01(GenBank EU513200、 LhcaJ01(GenBank EU513201)。运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列以及蛋白结构进行预测。结果表明,LhcaPe01基因序列从第39 bp开始到第779 bp含有1个开放阅读框和一个中止密码子,该基因全长1 051 bp,在5′端有38 bp的非编码区,在3′端含有242 bp的非编码区和Poly(A) 30 bp。对这3个基因的保守片段的序列分析表明,刚竹属3种竹种毛竹、红壳竹和角竹保守区内核酸序列同源性非常高,在禾本科内不同属之间毛竹与大麦序列同源性最高,玉米次之。编码的氨基酸序列同源性与核酸序列同源性一致,最高是毛竹与大麦,水稻次之。经推测LhcaPe01编码的蛋白质等电点和分子量分别为5.400 0和22 107.34 D。蛋白质结构预测表明,毛竹、大麦、水稻、玉米的LHCⅠ蛋白结构非常相似。
  • [1] 王皓炜, 于志明, 张扬, 唐睿琳, 刘源松, 王晓倩, 黄思琪, 赵博识.  灰黄青霉生物染色对毛竹性能影响的研究 . 北京林业大学学报, 2020, 42(6): 149-156. doi: 10.12171/j.1000-1522.20200150
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出版历程
  • 收稿日期:  1900-01-01
  • 修回日期:  1900-01-01
  • 刊出日期:  2008-07-30

刚竹属3种重要散生竹光系统Ⅰ基因(Lhca1)的克隆、序列分析和蛋白结构预测

摘要: 光系统Ⅰ(PSⅠ)在植物光合系统中具有重要功能,Lhca1是编码PSⅠ复合物中最主要的捕光色素蛋白LHCⅠ的基因。该研究采用RT-PCR法,从毛竹中克隆了捕光叶绿素a/b结合蛋白基因Lhca-Pe01(GenBank EU035496)的全长,从红壳竹和角竹中克隆了长度分别为616、613 bp的捕光叶绿素a/b结合蛋白基因片段LhcaH01(GenBank EU513200、 LhcaJ01(GenBank EU513201)。运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列以及蛋白结构进行预测。结果表明,LhcaPe01基因序列从第39 bp开始到第779 bp含有1个开放阅读框和一个中止密码子,该基因全长1 051 bp,在5′端有38 bp的非编码区,在3′端含有242 bp的非编码区和Poly(A) 30 bp。对这3个基因的保守片段的序列分析表明,刚竹属3种竹种毛竹、红壳竹和角竹保守区内核酸序列同源性非常高,在禾本科内不同属之间毛竹与大麦序列同源性最高,玉米次之。编码的氨基酸序列同源性与核酸序列同源性一致,最高是毛竹与大麦,水稻次之。经推测LhcaPe01编码的蛋白质等电点和分子量分别为5.400 0和22 107.34 D。蛋白质结构预测表明,毛竹、大麦、水稻、玉米的LHCⅠ蛋白结构非常相似。

English Abstract

唐文莉, 彭镇华, 高健, . 刚竹属3种重要散生竹光系统Ⅰ基因(Lhca1)的克隆、序列分析和蛋白结构预测[J]. 北京林业大学学报, 2008, 30(4): 109-115.
引用本文: 唐文莉, 彭镇华, 高健, . 刚竹属3种重要散生竹光系统Ⅰ基因(Lhca1)的克隆、序列分析和蛋白结构预测[J]. 北京林业大学学报, 2008, 30(4): 109-115.
TANG Wen-li, PENG Zhen-hua, , GAO Jian. Cloning and sequence analysis of the light harvesting complex Ⅰ gene(Lhca1) from three kinds of Phyllostachys and structure prediction of the protein[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2008, 30(4): 109-115.
Citation: TANG Wen-li, PENG Zhen-hua, , GAO Jian. Cloning and sequence analysis of the light harvesting complex Ⅰ gene(Lhca1) from three kinds of Phyllostachys and structure prediction of the protein[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2008, 30(4): 109-115.

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