中国五针松疱锈菌遗传多样性的RAMS分析
Genetic diversity of fiveneedle pine blister rusts detected by random amplified microsatellite (RAMS) in China.
-
摘要: 为阐明来自不同寄主的五针松疱锈病菌的关系,了解其遗传多样性水平,并为今后研究该菌内的遗传变异和流行监控提供依据,该文采用RAMS (Random Amplified Microsatellite)标记对吉林、辽宁红松疱锈菌的4个居群和云南、四川华山松疱锈菌3个居群的遗传多样性进行了研究。从18条引物中筛选出5条对全部菌株进行了扩增,共检测到42个可重复的有效位点, 其中多态位点有25个,多态位点比率为59.52%,Nei’s基因多样度指数H=0.252 4,Shannon多样性信息指数Hsp=0.362 7,基因流Nm=0.136 5。分析结果表明:不同寄主来源疱锈菌群的遗传多样性高于同一寄主来源疱锈菌群;同一寄主来源的疱锈菌居群间存在遗传差异,但程度小于居群内。基于遗传距离,用NJ法对各居群间进行聚类分析的系统树显示,来自红松和华山松的疱锈菌形成独立的分支,相互间的遗传距离很大,说明两者在遗传上有显著的异质性。