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利用ITS序列探讨谷精草属5个种的系统发育

张志翔 林善枝 薛娴

张志翔, 林善枝, 薛娴. 利用ITS序列探讨谷精草属5个种的系统发育[J]. 北京林业大学学报, 2007, 29(5): 1-6.
引用本文: 张志翔, 林善枝, 薛娴. 利用ITS序列探讨谷精草属5个种的系统发育[J]. 北京林业大学学报, 2007, 29(5): 1-6.
ZHANG Zhi-xiang, LIN Shan-zhi, XUE Xian. Phylogenetical relationship of five Ericaulon species based on the ITS sequences[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2007, 29(5): 1-6.
Citation: ZHANG Zhi-xiang, LIN Shan-zhi, XUE Xian. Phylogenetical relationship of five Ericaulon species based on the ITS sequences[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2007, 29(5): 1-6.

利用ITS序列探讨谷精草属5个种的系统发育

Phylogenetical relationship of five Ericaulon species based on the ITS sequences

  • 摘要: 以谷精草属(Eriocaulon)的尼泊尔谷精草(Eriocaulon nepalense)、白药谷精草(E. cinereum)、高山谷精草(E. alperstre)、华南谷精草(E. sexangulare)、南亚谷精草(E. oryzetorum)等5个种为研究对象,通过PCR扩增技术获得了谷精草属5个种的内转录间隔区序列,并对ITS序列进行分析. 结果发现,供试谷精草属植物的ITS区长度并不完全一致,其ITS1的长度范围为171~306 bp,G+C含量为38.24%~55.04%;ITS2的长度范围为184~288 bp,G+C含量为 36.46%~57.02%. 在此基础上,采用Clustal W version 1.7对所得的ITS序列进行排序与分析,以灯心草属(Juncus)的一个种J. dregeanus为外类群,并使用PAUP 4.0 10 b软件采用最大简约法分析获得最简约的系统发育树. 结果表明,在检测的ITS序列的738个位点中稳定位点174个、变异位点564个 (包括276个信息位点). 另外,从发育树上平行分出两个大的总分支,其中E. nepalense、E. oryzetorum、E. alpestre和E. cinereum(云南宣威)为一支;E. sexangulare为一支. 上述二个分支与外类群聚在一起,bootstrap值为100%.

     

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出版历程
  • 收稿日期:  2006-12-07
  • 修回日期:  1900-01-01
  • 刊出日期:  2007-09-30

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