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均匀设计优化杨属的SRAP-PCR反应体系

郭丽琴 卫尊征 张金凤 王欢 李贤 郭军

郭丽琴, 卫尊征, 张金凤, 王欢, 李贤, 郭军, . 均匀设计优化杨属的SRAP-PCR反应体系[J]. 北京林业大学学报, 2010, 32(2): 34-38.
引用本文: 郭丽琴, 卫尊征, 张金凤, 王欢, 李贤, 郭军, . 均匀设计优化杨属的SRAP-PCR反应体系[J]. 北京林业大学学报, 2010, 32(2): 34-38.
GUO Li-qin, WEI Zun-zheng, ZHANG Jin-feng, WANG Huan, LI Xian, GUO Jun, . Optimization of SRAP-PCR amplification system for Populus by uniform design[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2010, 32(2): 34-38.
Citation: GUO Li-qin, WEI Zun-zheng, ZHANG Jin-feng, WANG Huan, LI Xian, GUO Jun, . Optimization of SRAP-PCR amplification system for Populus by uniform design[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2010, 32(2): 34-38.

均匀设计优化杨属的SRAP-PCR反应体系

Optimization of SRAP-PCR amplification system for Populus by uniform design

  • 摘要: 采用均匀设计方法,对影响杨属SRAP-PCR体系的MgCl 2、dNTPs、引物、TaqDNA聚合酶和模板浓度等因素分别进行了U16(45 )和 U12(35 )两轮优化,建立了适用于杨属的SRAP-PCR反应体系。在25 μL反应体系中,MgCl 2 3.5 mmol/L、dNTPs 0.20 mmol/L、引物0.44 μmol/L、TaqDNA聚合酶1.50 U、模板浓度28 ng/L为最适条件。在此基础上又对退火温度进行了摸索,结果发现,扩增结果对退火温度变化不敏感。最后运用优化体系对杨属3派10个种共16个单株的DNA进行扩增验证,结果获得的DNA条带清晰,多态性比较丰富。说明这一优化的SRAP-PCR反应体系可用于杨属不同种间亲缘关系、系统进化和遗传多样性等方面的研究。
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    ZHAOGuang-jie, 刘金福, 李吉跃, 刘常富, 邹大林, 常德龙, 郑凌凌, 鲁绍伟, 温俊宝, 徐文铎, 李雪萍, 白陈祥, 吴斌, 李增元, 李吉跃, 洪伟, 吴庆利, 韩烈保, 何兴元, 翟洪波, 赵广杰, 温俊宝, 何正权, 何友均, 王玉杰, 宋湛谦, 张树文, 余新晓, 何承忠, 韩士杰, 朱天辉, 张路平, 张建国, LUOWen-sheng, 刘凤芹, 李俊清, 骆有庆, 陈发菊, 骆有庆, 何静, 黄文豪, 匡秋明, 张养贞, 陈尔学, 张志毅, 姜伟, 郭忠玲, ]陈玮, FurunoTakeshi, 林秦文, ]魏晓霞, 童书振, 梁小红, 安新民, 庞勇, 张振明, 梁宏伟, 李颖, 许志春, 张军, 胡伟华, 崔国发, 张璧光, 郑兴波, 许志春, RENQian, 赵桂玲, 曾会明, PaulWolfgang, 刘君, 宋国正, 雷渊才, 曹川健, 侯伟, 李福海, 杨凯, 郑杰, 李凤兰, 赵广亮, 姚永刚, 董建生, 张全来, 张有慧, 李考学, 田桂芳, 李永波, 赫万成, 李长明, 张世玺.  毛白杨ISSR反应体系的建立及优化 . 北京林业大学学报, 2006, 28(3): 61-65.
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出版历程
  • 收稿日期:  1900-01-01
  • 修回日期:  1900-01-01
  • 刊出日期:  2010-03-30

均匀设计优化杨属的SRAP-PCR反应体系

摘要: 采用均匀设计方法,对影响杨属SRAP-PCR体系的MgCl 2、dNTPs、引物、TaqDNA聚合酶和模板浓度等因素分别进行了U16(45 )和 U12(35 )两轮优化,建立了适用于杨属的SRAP-PCR反应体系。在25 μL反应体系中,MgCl 2 3.5 mmol/L、dNTPs 0.20 mmol/L、引物0.44 μmol/L、TaqDNA聚合酶1.50 U、模板浓度28 ng/L为最适条件。在此基础上又对退火温度进行了摸索,结果发现,扩增结果对退火温度变化不敏感。最后运用优化体系对杨属3派10个种共16个单株的DNA进行扩增验证,结果获得的DNA条带清晰,多态性比较丰富。说明这一优化的SRAP-PCR反应体系可用于杨属不同种间亲缘关系、系统进化和遗传多样性等方面的研究。

English Abstract

郭丽琴, 卫尊征, 张金凤, 王欢, 李贤, 郭军, . 均匀设计优化杨属的SRAP-PCR反应体系[J]. 北京林业大学学报, 2010, 32(2): 34-38.
引用本文: 郭丽琴, 卫尊征, 张金凤, 王欢, 李贤, 郭军, . 均匀设计优化杨属的SRAP-PCR反应体系[J]. 北京林业大学学报, 2010, 32(2): 34-38.
GUO Li-qin, WEI Zun-zheng, ZHANG Jin-feng, WANG Huan, LI Xian, GUO Jun, . Optimization of SRAP-PCR amplification system for Populus by uniform design[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2010, 32(2): 34-38.
Citation: GUO Li-qin, WEI Zun-zheng, ZHANG Jin-feng, WANG Huan, LI Xian, GUO Jun, . Optimization of SRAP-PCR amplification system for Populus by uniform design[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2010, 32(2): 34-38.

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