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杨树14--3--3基因家族的分子进化及表达模式研究

刘妍婧 王彩玲 陆海 杨海灵

刘妍婧, 王彩玲, 陆海, 杨海灵. 杨树14--3--3基因家族的分子进化及表达模式研究[J]. 北京林业大学学报, 2010, 32(3): 1-7.
引用本文: 刘妍婧, 王彩玲, 陆海, 杨海灵. 杨树14--3--3基因家族的分子进化及表达模式研究[J]. 北京林业大学学报, 2010, 32(3): 1-7.
LIU Yan-|jing, WANG Cai-ling, LU Hai, YANG Hai-ling. Molecular evolution and expression pattern of the Populus 14-3-3 gene family[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2010, 32(3): 1-7.
Citation: LIU Yan-|jing, WANG Cai-ling, LU Hai, YANG Hai-ling. Molecular evolution and expression pattern of the Populus 14-3-3 gene family[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2010, 32(3): 1-7.

杨树14--3--3基因家族的分子进化及表达模式研究

Molecular evolution and expression pattern of the Populus 14-3-3 gene family

  • 摘要: 14-3-3蛋白在植物细胞信号传导中发挥重要的作用,探索木本植物14-3-3蛋白家族的进化模式对深入理解该基因家族的功能有重要的指导意义。本文采用生物信息学的方法,在基因组水平上搜索和鉴定了12个杨树14-3-3蛋白基因,其中ε类有7个,非ε类有5个。通过对杨树14-3-3基因家族的系统进化、序列相似性、基因结构和染色体位置分析,发现杨树14-3-3基因的扩张主要是通过最近的一次全基因组加倍事件产生的。在全基因组加倍事件中共产生5对重复基因对,Ka/Ks分析显示这5对重复基因对处于较强的净化选择压力。RT-PCR分析显示在杨树12个14-3-3基因中有8个在不同组织中均表达,另外4个基因的表达部位发生了变异。因此,杨树14-3-3基因家族的分子进化及表达模式的研究结果预示着基因重复后其功能发生了分化。
  • [1] 曾明, 何书航, 李文海, 冯军, 赵媛媛, 郑彩霞.  胡杨异形叶差异表达miRNA及其靶基因功能分析 . 北京林业大学学报, 2020, 42(6): 1-13. doi: 10.12171/j.1000-1522.20190464
    [2] 高基朋, 秦岭, 曹庆芹, 房克凤, 田晔林.  北京山区3种栎属植物居群遗传结构与基因渐渗研究 . 北京林业大学学报, 2020, 42(7): 58-67. doi: 10.12171/j.1000-1522.20190402
    [3] 姜晶, 李晓媛, 王楚, 王芳, 姜静.  白桦BpCHS3转基因植株耐盐性分析 . 北京林业大学学报, 2019, 41(4): 1-7. doi: 10.13332/j.1000-1522.20180224
    [4] 李劲宇, 高原, 张琴, 刘小敏, 高宏波.  拟南芥叶绿体分裂突变体x17-3和pd50的基因鉴定与分析 . 北京林业大学学报, 2018, 40(4): 86-95. doi: 10.13332/j.1000-1522.20170433
    [5] 崔永耀, 程玉祥.  基于Cas9/gRNA创制毛果杨COBRA3基因突变体 . 北京林业大学学报, 2018, 40(4): 10-15. doi: 10.13332/j.1000-1522.20170421
    [6] 遇文婧, 宋小双, 邓勋, 平晓帆, 周琦, 刘志华.  刺激植物响应蛋白基因Epl1克隆、原核表达及功能初探 . 北京林业大学学报, 2018, 40(1): 17-26. doi: 10.13332/j.1000-1522.20170249
    [7] 孙延爽, 邢宝月, 杨光, 刘桂丰.  NaHCO3胁迫对转TaLEA基因山新杨生长及光合、叶绿素荧光特性的影响 . 北京林业大学学报, 2017, 39(10): 33-41. doi: 10.13332/j.1000-1522.20170099
    [8] 唐贤礼, 张月, 张盾, 夏新莉, 尹伟伦.  毛果杨基因PtNRT2.7的功能初步鉴定与分析 . 北京林业大学学报, 2016, 38(8): 18-27. doi: 10.13332/j.1000-1522.20160041
    [9] 牛春阳, 王峰, 李丹蕾, 陈俏丽, 张瑞芝.  C14 族R2R3鄄MYB 基因调控杨树抗锈菌过敏性反应 . 北京林业大学学报, 2016, 38(7): 25-32. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150499
    [10] 张晓菲, 路信, 段卉, 练从龙, 夏新莉, 尹伟伦.  胡杨NAC转录因子PeNAC045基因的克隆及功能分析 . 北京林业大学学报, 2015, 37(6): 1-10. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150066
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    [12] 张运城, 周长虹, 钮世辉, 李伟.  针叶树GID1同源基因分离鉴定与功能预测 . 北京林业大学学报, 2015, 37(5): 40-48. doi: 10.13332/j.1000-1522.20140255
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出版历程
  • 收稿日期:  1900-01-01
  • 修回日期:  1900-01-01
  • 刊出日期:  2010-05-30

杨树14--3--3基因家族的分子进化及表达模式研究

摘要: 14-3-3蛋白在植物细胞信号传导中发挥重要的作用,探索木本植物14-3-3蛋白家族的进化模式对深入理解该基因家族的功能有重要的指导意义。本文采用生物信息学的方法,在基因组水平上搜索和鉴定了12个杨树14-3-3蛋白基因,其中ε类有7个,非ε类有5个。通过对杨树14-3-3基因家族的系统进化、序列相似性、基因结构和染色体位置分析,发现杨树14-3-3基因的扩张主要是通过最近的一次全基因组加倍事件产生的。在全基因组加倍事件中共产生5对重复基因对,Ka/Ks分析显示这5对重复基因对处于较强的净化选择压力。RT-PCR分析显示在杨树12个14-3-3基因中有8个在不同组织中均表达,另外4个基因的表达部位发生了变异。因此,杨树14-3-3基因家族的分子进化及表达模式的研究结果预示着基因重复后其功能发生了分化。

English Abstract

刘妍婧, 王彩玲, 陆海, 杨海灵. 杨树14--3--3基因家族的分子进化及表达模式研究[J]. 北京林业大学学报, 2010, 32(3): 1-7.
引用本文: 刘妍婧, 王彩玲, 陆海, 杨海灵. 杨树14--3--3基因家族的分子进化及表达模式研究[J]. 北京林业大学学报, 2010, 32(3): 1-7.
LIU Yan-|jing, WANG Cai-ling, LU Hai, YANG Hai-ling. Molecular evolution and expression pattern of the Populus 14-3-3 gene family[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2010, 32(3): 1-7.
Citation: LIU Yan-|jing, WANG Cai-ling, LU Hai, YANG Hai-ling. Molecular evolution and expression pattern of the Populus 14-3-3 gene family[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2010, 32(3): 1-7.

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