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基于近缘物种SSR引物和EST-SSR序列的梅花SSR引物开发

吴根松 孙丽丹 张启翔 潘会堂 蔡明

吴根松, 孙丽丹, 张启翔, 潘会堂, 蔡明. 基于近缘物种SSR引物和EST-SSR序列的梅花SSR引物开发[J]. 北京林业大学学报, 2011, 33(5): 103-108.
引用本文: 吴根松, 孙丽丹, 张启翔, 潘会堂, 蔡明. 基于近缘物种SSR引物和EST-SSR序列的梅花SSR引物开发[J]. 北京林业大学学报, 2011, 33(5): 103-108.
WU Gen-song, SUN Li-dan, ZHANG Qi-xiang, PAN Hui-tang, CAI Ming. Development of mei flowers SSR primers from closely related species SSR and EST-SSR[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2011, 33(5): 103-108.
Citation:

WU Gen-song, SUN Li-dan, ZHANG Qi-xiang, PAN Hui-tang, CAI Ming

. Development of mei flowers SSR primers from closely related species SSR and EST-SSR[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2011, 33(5): 103-108.

基于近缘物种SSR引物和EST-SSR序列的梅花SSR引物开发

Development of mei flowers SSR primers from closely related species SSR and EST-SSR

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出版历程
  • 收稿日期:  1900-01-01
  • 修回日期:  1900-01-01
  • 刊出日期:  2011-09-30

基于近缘物种SSR引物和EST-SSR序列的梅花SSR引物开发

摘要: 为获得更多的梅花SSR引物,本研究筛选了84对梅花近缘物种的引物,并从梅花EST数据库的序列中设计了23对EST-SSR引物,用12个梅花品种对这些引物进行了多态性检测。结果表明,近缘物种的引物有69对能扩增出条带,有效扩增率达82.1%,从中筛选的14对引物共得到85个等位基因,平均值为6个。有效等位基因数在2.072~5.539之间,平均值为4。PIC多态信息指数在0.483~0.786之间,平均值为0.695。Shannon指数的平均值为1.528。12个品种遗传相似系数在0.13~0.60之间,平均值为0.26。‘玉蝶龙游’梅和‘小玉蝶’相似系数最大,为0.60;‘美人’梅和‘黄金’梅相似系数最小,为0.13。设计的EST-SSR引物有22对能扩增出条带,有效扩增率达95.6%,其中有11对引物表现出多态性,占全部EST-SSR的47.8%。

English Abstract

吴根松, 孙丽丹, 张启翔, 潘会堂, 蔡明. 基于近缘物种SSR引物和EST-SSR序列的梅花SSR引物开发[J]. 北京林业大学学报, 2011, 33(5): 103-108.
引用本文: 吴根松, 孙丽丹, 张启翔, 潘会堂, 蔡明. 基于近缘物种SSR引物和EST-SSR序列的梅花SSR引物开发[J]. 北京林业大学学报, 2011, 33(5): 103-108.
WU Gen-song, SUN Li-dan, ZHANG Qi-xiang, PAN Hui-tang, CAI Ming. Development of mei flowers SSR primers from closely related species SSR and EST-SSR[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2011, 33(5): 103-108.
Citation:

WU Gen-song, SUN Li-dan, ZHANG Qi-xiang, PAN Hui-tang, CAI Ming

. Development of mei flowers SSR primers from closely related species SSR and EST-SSR[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2011, 33(5): 103-108.

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