高级检索

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

紫斑牡丹表型性状与SSR分子标记的关联分析

吴静 成仿云 庞利铮 钟原 蔡长福

吴静, 成仿云, 庞利铮, 钟原, 蔡长福. 紫斑牡丹表型性状与SSR分子标记的关联分析[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(8): 80-87. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150377
引用本文: 吴静, 成仿云, 庞利铮, 钟原, 蔡长福. 紫斑牡丹表型性状与SSR分子标记的关联分析[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(8): 80-87. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150377
WU Jing, CHENG Fang-yun, PANG Li-zheng, ZHONG Yuan, CAI Chang-fu.. Association analysis of phenotypic traits with SSR markers in Paeonia rockii.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(8): 80-87. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150377
Citation: WU Jing, CHENG Fang-yun, PANG Li-zheng, ZHONG Yuan, CAI Chang-fu.. Association analysis of phenotypic traits with SSR markers in Paeonia rockii.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(8): 80-87. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150377

紫斑牡丹表型性状与SSR分子标记的关联分析

doi: 10.13332/j.1000-1522.20150377
基金项目: 

“863”国家高技术研究发展计划项目(2011AA100207)。

详细信息
    作者简介:

    吴静,博士生。主要研究方向:园林花卉分子育种。Email:835642891@qq.com地址:100083北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。责任作者:成仿云,教授,博士生导师。主要研究方向:园林植物资源与育种。Email:chengfy8@263.com地址:同上。

    吴静,博士生。主要研究方向:园林花卉分子育种。Email:835642891@qq.com地址:100083北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。责任作者:成仿云,教授,博士生导师。主要研究方向:园林植物资源与育种。Email:chengfy8@263.com地址:同上。

Association analysis of phenotypic traits with SSR markers in Paeonia rockii.

  • 摘要: 利用筛选出的11对多态性简单重复序列(SSR) 标记对99份紫斑牡丹材料进行多态性扫描,在分析其遗传多样性和群体结构的基础上,采用TASSEL2.1软件的一般线性模型(GLM)进行标记与32个观赏性状的关联分析。结果表明:11个多态性SSR标记共检测到94个等位变异,平均每个位点检测到等位变异8.5个;引物的多态性信息含量(PIC)变幅为0.146~0.850,平均值为0.593;遗传多样性变幅为0.152~0.862,平均为0.630。群体结构分析将供试材料划分为3个亚群;通过关联分析,发现5个标记位点与6个性状显著关联(P<0.01),各标记位点对表型变异的解释率为30.4%~55.8%,其中FJ024285和FJ024294标记与株高相关联,FE528073与顶小叶长、柱头颜色和房衣颜色相关联,FJ024287与柄叶比相关联,EU678295与色斑大小相关联。研究表明:所选紫斑牡丹种质资源群体的群体结构简单、遗传变异较为丰富,适用于紫斑牡丹目标性状的关联分析。关联分析能够有效地找到与紫斑牡丹表型性状紧密连锁的SSR标记,用于分子标记辅助育种。
  • [1] WU J, CHENG F Y, ZHANG D.Utilizing ‘High Noon’ in the crossing breeding of tree peonies and early identification of some hybrids by AFLP markers[J]. Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica, 2013, 33(8): 1551-1557.
    [2] CHENG F Y. Advances in the breeding of tree peonies and a cultivar system for the cultivar group[J]. International Journal of Plant Breeding, 2007, 1(2): 89-104.
    [3] YUAN J H, CHENG F Y, ZHOU S L. Hybrid origin of Paeonia × yananensis revealed by microsatellite markers, chloroplast gene sequences, and morphological characteristics[J]. International Journal of Plant Sciences, 2010, 171(4): 409-420.
    [4] LI R W, WANG C, DAI S L, et al. The association analysis of phenotypic traits with SRAP markers in Chrysanthemum[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2012, 45(7): 1355-1364.
    [5] YUAN J H, CHENG F Y, ZHOU S L. Genetic structure of the tree peony (Paeonia rockii) and the Qinling Mountains as a geographic barrier driving the fragmentation of a large population[J]. PloS One, 2012, 7(4): e34955.
    [6] LIU H M, ZHU Y T, CHE D D,et al. Association analysis of ornamental traits with RAPD markers in 18 portion materials of Spiraea L.[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2010, 37(7): 1125-1131.
    [7] CHENG F Y, LI J J, CHEN D Z, et al. Purple peony in China [M]. Beijing:China Forestry Publishing House, 2005: 77-84.
    [8] HAN X Y, WANG L S, SHU Q Y, et al. Molecular characterization of tree peony germplasm using sequence-related amplified polymorphism markers[J]. Biochemical Genetics, 2008, 46(3-4): 162-179.
    [9] PANG L Z, CHENG F Y, ZHONG Y, et al. Phenotypic analysis of association population for flare tree peony[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2012, 34(6): 115-120.
    [10] ZHANG J J, SHU Q Y, LIU Z A, et al. Two EST-derived marker systems for cultivar identification in tree peony[J]. Plant Cell Reports, 2012, 31(2): 299-310.
    [11] WU J, CAI C F, CHENG F Y, et al. Characterisation and development of EST-SSR markers in tree peony using transcriptome sequences[J]. Molecular Breeding, 2014, 34(4): 1853-1866.
    [12] YUAN J H. Studies on the origin of Paeonia rockii and P. yananensis[D]. Beijing: Beijing Forestry University, 2010.
    [13] LU H, ZHANG D, ZHANG L J, et al. Association analysis of five agronomic traits with SSR markers in Flammulina velutipes germplasm[J]. Journal of Agricultural Biotechnology, 2015, 23(1): 96-106.
    [14] YU H P, CHENG F Y, ZHONG Y, et al. Development of simple sequence repeat (SSR) markers from Paeonia ostii to study the genetic relationships among tree peonies (Paeoniaceae)[J]. Scientia Horticulturae, 2013, 164: 58-64.
    [15] GAO Y, LUO S X, WANG Y H, et al. Association analysis of bolting and flowering time with SSR and InDel markers in Chinese cabbage[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2012, 39(6): 1081-1089.
    [16] 吴静, 成仿云, 张栋.‘正午’牡丹的杂交利用及部分杂种AFLP鉴定[J]. 西北植物学报, 2013, 33(8): 1551-1557.
    [17] HAO Q, LIU Z A, SHU Q Y, et al. Studies on Paeonia cultivars and hybrids identification based on SRAP analysis[J]. Hereditas, 2008, 145(1): 38-47.
    [18] FLINT-GARCIA S A, THORNSBERRY J M, BUCKLER E S. Structure of linkage disequilibrium in plants[J]. Annual Review of Plant Biology, 2003, 54: 357-374.
    [19] THORNSBERRY J M, GOODMAN M M, DOEBLEY J, et al. Dwarf polymorphisms associate with variation in flowering time[J]. Nature Genetics, 2001, 28(3): 286-289.
    [20] BORDES J, GOUDEMAND E, DUCHALAIS L, et al. Genome-wide association mapping of three important traits using bread wheat elite breeding populations[J]. Molecular Breeding, 2014, 33(4): 755-768.
    [21] EDAE E A, BYRNE P F, HALEY S D, et al. Genome-wide association mapping of yield and yield components of spring wheat under contrasting moisture regimes[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2014, 127(4): 791-807.
    [22] SUKUMARAN S, DREISIGACKER S, LOPES M, et al. Genome-wide association study for grain yield and related traits in an elite spring wheat population grown in temperate irrigated environments[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2015, 128(2): 353-363.
    [23] WANG C, YANG Y, YUAN X, et al. Genome-wide association study of blast resistance in indica rice[J]. BMC Plant Biology, 2014, 14(1): 311.
    [24] GOWDA M, DAS B, MAKUMBI D, et al. Genome-wide association and genomic prediction of resistance to maize lethal necrosis disease in tropical maize germplasm[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2015, 128(10): 1957-1968.
    [25] PACE J, GARDNER C, ROMAY C, et al. Genome-wide association analysis of seedling root development in maize (Zea mays L.)[J]. BMC Genomics, 2015, 16(1): 47.
    [26] SUWARNO W B, PIXLEY K V, PALACIOS-ROJAS N, et al. Genome-wide association analysis reveals new targets for carotenoid biofortification in maize[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2015, 128(5): 851-864.
    [27] WEN Z, TAN R, YUAN J, et al. Genome-wide association mapping of quantitative resistance to sudden death syndrome in soybean[J]. BMC Genomics, 2014, 15(1): 809.
    [28] ZHANG J, SONG Q, CREGAN P B, et al. Genome-wide association study for flowering time, maturity dates and plant height in early maturing soybean (Glycine max) germplasm[J]. BMC Genomics, 2015, 16(1): 217.
    [29] DU Q, PAN W, XU B, et al. Polymorphic simple sequence repeat (SSR) loci within cellulose synthase (PtoCesA) genes are associated with growth and wood properties in Populus tomentosa[J]. New Phytologist, 2013, 197(3): 763-776.
    [30] PORTH I, KLAPTE J, SKYBA O, et al. Genome-wide association mapping for wood characteristics in Populus identifies an array of candidate single nucleotide polymorphisms[J]. New Phytologist, 2013, 200(3): 710-726.
    [31] HUSSEY S G, MIZRACHI E, GROOVER A, et al. Genome-wide mapping of histone H3 lysine 4 trimethylation in Eucalyptus grandis developing xylem[J]. BMC Plant Biology, 2015, 15(1): 117.
    [32] ECKERT A J, WEGRZYN J L, CUMBIE W P, et al. Association genetics of the loblolly pine (Pinus taeda, Pinaceae) metabolome[J]. New Phytologist, 2012, 193(4): 890-902.
    [33] PALLE S R, SEEVE C M, ECKERT A J, et al. Association of loblolly pine xylem development gene expression with single-nucleotide polymorphisms[J]. Tree Physiology, 2013, 33(7): 763-774.
    [34] GAWENDA I, SCHRDER-LORENZ A, DEBENER T. Markers for ornamental traits in Phalaenopsis orchids: population structure, linkage disequilibrium and association mapping[J]. Molecular Breeding, 2012, 30(1): 305-316.
    [35] 李仁伟, 王 晨, 戴思兰, 等. 菊花品种表型性状与SRAP分子标记的关联分析[J]. 中国农业科学, 2012, 45(7): 1355-1364.
    [36] 刘慧民, 朱玉涛, 车代弟, 等. 绣线菊18份材料观赏性状与RAPD标记的关联分析[J]. 园艺学报, 2010, 37(7): 1125-1131.
    [37] 成仿云,李嘉珏,陈德忠, 等. 中国紫斑牡丹[M]. 北京:中国林业出版社, 2005: 77-84.
    [38] 庞利铮, 成仿云, 钟原, 等. 紫斑牡丹关联分析群体的表型分析[J]. 北京林业大学学报, 2012, 34(6): 115-120.
    [39] HOMOLKA A, BERENYI M, BURG K, et al. Microsatellite markers in the tree peony, Paeonia suffruticosa (Paeoniaceae) [J]. American Journal of Botany, 2010, 97(6): e42-e44.
    [40] HOU X G, GUO D L, CHENG S P, et al. Development of thirty new polymorphic microsatellite primers for Paeonia suffruticosa [J]. Biologia Plantarum, 2011, 55(4): 708-710.
    [41] HOU X G, GUO D L, WANG J. Development and characterization of EST-SSR markers in Paeonia suffruticosa (Paeoniaceae) [J]. American Journal of Botany, 2011,98(11): e303-e305
    [42] LI L, CHENG F, ZANG Q. Microsatellite markers for the Chinese herbaceous peony Paeonia lactiflora (Paeoniaceae) [J]. American Journal of Botany, 2011, 98(2): e16-e18.
    [43] SUN J, YUAN J, WANG B, et al. Development and characterization of 10 microsatellite loci in Paeonia lactiflora (Paeoniaceae) [J]. American Journal of Botany, 2011, 98(9): e242-e243.
    [44] LIU K, MUSE S V. PowerMarker: an integrated analysis environment for genetic marker analysis[J]. Bioinformatics, 2005, 21(9): 2128-2129.
    [45] PRITCHARD J K,STEPHENS M,DONNELLY P. Inference of population structure from multilocus genotype data [J]. Genetics, 2000, 155: 945-959.
    [46] EVANNO G, REGNAUT S, GOUDET J. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study [J]. Molecular Ecology, 2005, 14(8): 2611-2620.
    [47] BRADBURY P J, ZHANG Z, KROON D E, et al. TASSEL: software for association mapping of complex traits in diverse samples [J]. Bioinformatics, 2007, 23(19): 2633-2635.
    [48] 袁军辉. 紫斑牡丹及延安牡丹起源研究[D].北京: 北京林业大学, 2010.
    [49] BOTSTEIN D, WHITE R L, SKOLNICK M, et al. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms[J]. American Journal of Human Genetics, 1980, 32(3):314-331.
    [50] 陆欢, 张丹, 章炉军, 等. 金针菇种质资源5个农艺性状与SSR 标记的关联分析[J]. 农业生物技术学报, 2015, 23(1): 96-106.
    [51] PALLE S R, SEEVE C M, ECKERT A J, et al. Association of loblolly pine xylem development gene expression with single-nucleotide polymorphisms[J]. Tree Physiology, 2013, 33(7): 763-774.
    [52] HANSEN M, KRAFT T, GANESTAM S, et al. Linkage disequilibrium mapping of the bolting gene in sea beet using AFLP markers[J]. Genetics Research, 2001, 77(1): 61-66.
    [53] 高颖, 罗双霞, 王彦华, 等. 大白菜抽薹开花时间与SSR和InDel标记的关联分析[J]. 园艺学报, 2012, 39(6): 1081-1089.
    [54] ARANZANA M J, KIM S, ZHAO K, et al. Genome-wide association mapping in Arabidopsis identifies previously known flowering time and pathogen resistance genes[J]. PLoS Genetics, 2005, 1(5): 531-539.
  • [1] 贺快快, 武文斌, 张子杰, 胡现铬, 韩方旭, 钮世辉, 李悦.  北京油松人工林遗传结构变异及与山西山系种群差异分析 . 北京林业大学学报, 2020, 42(6): 33-42. doi: 10.12171/j.1000-1522.20190399
    [2] 张妹, 何正权, 马江, 桑子阳, 朱仲龙, 张德春, 马履一, 陈发菊.  基于SSR和SRAP标记的红花玉兰品种遗传关系分析及分子鉴定 . 北京林业大学学报, 2019, 41(9): 69-80. doi: 10.13332/j.1000-1522.20190204
    [3] 李秀宇, 郭琪, 董黎, 孙宇涵, 牛东升, 刘佳平, 王红生, 李云.  山西省吉县刺槐无性系种质遗传多样性的EST-SSR分析 . 北京林业大学学报, 2019, 41(7): 39-48. doi: 10.13332/j.1000-1522.20190108
    [4] 姚俊修, 毛秀红, 李善文, 刘学良, 吴德军.  基于荧光SSR标记的白杨派种质资源遗传多样性研究 . 北京林业大学学报, 2018, 40(6): 92-100. doi: 10.13332/j.1000-1522.20170429
    [5] 武文斌, 贺快快, 狄皓, 钮世辉, 马彦光, 张子杰, 李悦.  基于SSR标记的山西省油松山脉地理种群遗传结构与地理系统 . 北京林业大学学报, 2018, 40(10): 51-59. doi: 10.13332/j.1000-1522.20180057
    [6] 周鹏, 林玮, 朱芹, 周祥斌, 吴林瑛, 陈晓阳.  基于SRAP分子标记的刨花润楠遗传多样性分析 . 北京林业大学学报, 2016, 38(9): 16-24. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150423
    [7] 李田, 郭俊娥, 郑成淑, 孙霞, 孙宪芝.  菊花品种的遗传多样性分析及CDDP指纹图谱构建 . 北京林业大学学报, 2014, 36(4): 94-101. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.04.018
    [8] 陈凌娜, 马庆国, 张俊佩, 周贝贝, 裴东.  核桃BES-SSR 的开发及在遗传多样性分析中的应用 . 北京林业大学学报, 2014, 36(6): 24-29. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.06.008
    [9] 李义良, 赵奋成, 胡燕菲, 蔡坚, 吴惠姗, 张应中, 郭文冰.  非洲桃花心木不同地理群体遗传多样性分析 . 北京林业大学学报, 2014, 36(5): 82-86. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.05.022
    [10] 秦英英, 韩海荣, 康峰峰, 赵琦.  基于SSR 标记的山西省辽东栎自然居群遗传多样性分析 . 北京林业大学学报, 2012, 34(2): 61-65.
    [11] 庞利铮, 成仿云, 钟原, 蔡长福, 崔虎亮.  紫斑牡丹关联分析群体的表型分析 . 北京林业大学学报, 2012, 34(6): 115-120.
    [12] 赵雪梅, 成仿云, 唐立红, 朱月, 袁军辉, 鞠志新.  赤峰地区紫斑牡丹的引种与抗寒性研究 . 北京林业大学学报, 2011, 33(2): 84-90.
    [13] 王国霞, 曹福亮, 方炎明.  古银杏雄株的ISSR遗传多样性分析 . 北京林业大学学报, 2010, 32(2): 39-45.
    [14] 廖卉荣, 顾万春, 明军.  紫丁香天然群体的等位酶遗传多样性分析 . 北京林业大学学报, 2009, 31(5): 84-89.
    [15] 李伦光, 贺萍, 贺伟, .  中国五针松疱锈菌遗传多样性的RAMS分析 . 北京林业大学学报, 2008, 30(6): 112-118.
    [16] 郎璞玫, 于海霞, 周艳萍, 于文吉, 焦雯珺, 许景伟, 陆平, 李黎, 宋先亮, 刘足根, 雷妮娅, 奚如春, 索安宁, 高克昌, 马玲, 武林, 张志山, 周睿, 郑景明, 邵杰, 孙志蓉, 张春晓, 吕文华, 张建军, 吴家兵, 金则新, 李俊, 饶兴权, 蔡锡安, 张小由, 葛剑平, 郑红娟, 余养伦, 戴伟, 毕华兴, 朱教君, 陈勇, 关德新, 习宝田, 赵广杰, 赵文喆, 李传荣, 韦方强, 李钧敏, Kwei-NamLaw, 朱清科, 于志明, 赵秀海, 陈少良, 马履一, 盖颖, 翟明普, 纳磊, 王文全, 贾桂霞, 王天明, 张宇清, 方家强, 赵平, 曾小平, 李俊清, 杨永福, 朱艳燕, 张弥, 张春雨, 马履一, 樊敏, 李笑吟, 李增鸿, 夏良放, 王瑞刚, 崔鹏, 袁小兰, 于波, ClaudeDaneault, 江泽慧, 谭会娟, 殷宁, 韩士杰, 何明珠, 郭孟霞, 袁飞, 唐晓军, 陈雪梅, 刘丽娟, 王卫东, 李庆卫, 吴秀芹, 王贺新, 邓宗付, 张欣荣, 贺润平, 李丽萍, 毛志宏, 王旭琴, 于贵瑞, 熊颖, 王娜, 蒋湘宁, 吴记贵, 王月海, 刘鑫, 孔俊杰, 郑敬刚, 江杰, 李新荣, 王贵霞, 葛剑平, 聂立水, 王瑞辉, 林靓靓, 孙晓敏, 郭超颖, 董治良.  浙江仙居长叶榧自然居群遗传多样性的ISSR分析 . 北京林业大学学报, 2007, 29(1): 53-59.
    [17] 魏潇潇, 郑小贤, 杨平, 颜绍馗, 王芳, 周永学, 李瑞, 邓小文, 张洪江, 秦爱光, 胡胜华, 张莉俊, 王费新, 吴彩燕, 张璧光, 袁怀文, 胡万良, 何亚平, 白岗栓, 黄荣凤, 殷亚方, 高黎, 毛俊娟, 刘杏娥, 罗晓芳, 王兆印, 李猛, 赵天忠, 费世民, 樊军锋, 王小青, 王胜华, 谭学仁, 孙向阳, 崔赛华, NagaoHirofumi, 杜社妮, 汪思龙, 王晓欢, 张克斌, 常旭, 刘燕, 张岩, 王正, 乔建平, 戴思兰, 张双保, 王海燕, 刘云芳, 龚月桦, 李华, 高荣孚, 张占雄, 徐嘉, 李昀, 张旭, 江玉林, 江泽慧, 范冰, KatoHideo, , 陈放, 孔祥文, 韩士杰, 陈秀明, 陈宗伟, 侯喜录, 任海青, IdoHirofumi, 刘秀英, 李媛良, 杨培华, 常亮, 李晓峰, 丁磊, , 郭树花, 李考学, 薛岩, 张桂兰, 高建社, , 张代贵, 徐庆祥, 陈学平, , 费本华, 蒋俊明, 涂代伦, 王晓东, 李雪峰, 续九如, 金鑫, 刘永红, , , , 丁国权, 张红丽, .  利用ISSR标记对天麻的贵州种群遗传多样性分析 . 北京林业大学学报, 2007, 29(6): 35-40.
    [18] 于寒颖, 宗世祥, 李贤军, 程丽莉, 刘智, 王志玲, 雷霆, 江泽慧, 张煜星, 施婷婷, 崔彬彬, 徐剑琦, 黄心渊, 周志强, 周国模, 雷相东, 陈伟, 张展羽, 程金新, 杜官本, 李国平, 曹伟, 肖化顺, 赵俊卉, 刘志军, 郭广猛, 刘童燕, 苏淑钗, 雷洪, 关德新, 张璧光, 曹金珍, 郝雨, 张璧光, 骆有庆, 苏里坦, 杨谦, 丁立建, 张贵, 王正, 李云, 张彩虹, 李云, 王海, 黄群策, 吴家森, 王正, 张则路, 张慧东, 黄晓丽, 陈晓光, 姜培坤, 秦岭, 许志春, 宋南, 刘彤, 贺宏奎, 张佳蕊, 李文军, 刘大鹏, 吴家兵, 张大红, 张国华, 方群, 周晓燕, 王勇, 金晓洁], 张书香, 秦广雍, 常亮, 张金桐, 蔡学理, 李延军, 高黎, 张弥, 于兴华, 姜静, 刘海龙, 陈燕, 刘建立, 姜金仲, 苏晓华, 冯慧, 陈绪和, 王安志, 朱彩霞, 周梅, 王德国, 张冰玉, 尹伟伦, 王谦, 成小芳, 张勤, 张连生, 亢新刚, 金昌杰, 陈建伟3, 聂立水, 冯大领, 韩士杰, 崔国发, 梁树军, 胡君艳, 姚国龙.  光皮桦天然群体遗传多样性研究 . 北京林业大学学报, 2006, 28(6): 28-34.
    [19] 刘震, 李景文, 符韵林, 熊瑾, 殷亚方, 饶良懿, 杜华强, 
    王保平, 杨晓晖, 黄国胜, 宋小双, 侯亚南, 李景文, 龙玲, 詹亚光, 张一平, 杨海龙, 张秋英, 李全发, 王明枝, 李慧, 李梅, 马文辉, 秦瑶, 徐峰, 王洁瑛, 韩海荣, 窦军霞, 李发东, 吕建雄, 李妮亚, 陈晓阳, 李俊清, 范文义, 李俊清, 李吉跃, 朱金兆, 刘文耀, 耿晓东, 赵敏, 王雪军, 梁机, 尹立辉, 朱金兆, 张克斌, 陆熙娴, 赵宪文, 刘雪梅, 刘桂丰, 康峰峰, 倪春, 李云, 陈素文, 唐黎明, 乔杰, 于贵瑞, 孙玉军, 欧国强, 陈晓阳, 沈有信, 李凤兰, 李黎, 秦素玲, 慈龙骏, 毕华兴, 齐实, 韦广绥, 黎昌琼, 赵双菊, 魏建祥, 宋献方, 张桂芹, 朱国平, 王玉成, 李伟, 刘伦辉, 任海青, 李伟, 蒋建平, 王雪, 马钦彦, 文瑞钧, 周海江, 丁霞, , 孙涛, 杨谦, 宋清海, 张万军, 李慧, 孙晓敏, 孙志强, 刘莹, 李宗然, 
    , .  欧亚大陆水青冈种群遗传多样性对比分析 . 北京林业大学学报, 2005, 27(5): 1-9.
    [20] 黄国胜, 杜华强, 龙玲, 李梅, 殷亚方, 侯亚南, 张一平, 饶良懿, 刘震, 李慧, 杨晓晖, 马文辉, 符韵林, 詹亚光, 张秋英, 李景文, 
    王保平, 杨海龙, 李景文, 李全发, 熊瑾, 王明枝, 宋小双, 窦军霞, 秦瑶, 朱金兆, 陆熙娴, 范文义, 吕建雄, 徐峰, 张克斌, 尹立辉, 耿晓东, 李俊清, 韩海荣, 朱金兆, 陈晓阳, 李俊清, 王洁瑛, 梁机, 刘文耀, 王雪军, 李吉跃, 李发东, 赵敏, 李妮亚, 孙玉军, 毕华兴, 沈有信, 慈龙骏, 赵宪文, 陈晓阳, 乔杰, 齐实, 倪春, 李云, 欧国强, 唐黎明, 陈素文, 康峰峰, 李凤兰, 刘雪梅, 刘桂丰, 李黎, 于贵瑞, 秦素玲, 李伟, 刘伦辉, 文瑞钧, 张桂芹, 任海青, 黎昌琼, 朱国平, 魏建祥, 马钦彦, 王玉成, 李伟, 赵双菊, 蒋建平, 王雪, 宋献方, 韦广绥, 李慧, , 宋清海, 周海江, 丁霞, 孙涛, 张万军, 杨谦, 孙志强, 孙晓敏, 刘莹, 李宗然, 
    欧亚大陆水青冈种群遗传多样性对比分析 . 北京林业大学学报, 2005, 27(4): 1-9.
  • 加载中
计量
  • 文章访问数:  552
  • HTML全文浏览量:  67
  • PDF下载量:  11
  • 被引次数: 0
出版历程
  • 收稿日期:  2015-11-02
  • 刊出日期:  2016-08-31

紫斑牡丹表型性状与SSR分子标记的关联分析

doi: 10.13332/j.1000-1522.20150377
    基金项目:

    “863”国家高技术研究发展计划项目(2011AA100207)。

    作者简介:

    吴静,博士生。主要研究方向:园林花卉分子育种。Email:835642891@qq.com地址:100083北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。责任作者:成仿云,教授,博士生导师。主要研究方向:园林植物资源与育种。Email:chengfy8@263.com地址:同上。

    吴静,博士生。主要研究方向:园林花卉分子育种。Email:835642891@qq.com地址:100083北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。责任作者:成仿云,教授,博士生导师。主要研究方向:园林植物资源与育种。Email:chengfy8@263.com地址:同上。

摘要: 利用筛选出的11对多态性简单重复序列(SSR) 标记对99份紫斑牡丹材料进行多态性扫描,在分析其遗传多样性和群体结构的基础上,采用TASSEL2.1软件的一般线性模型(GLM)进行标记与32个观赏性状的关联分析。结果表明:11个多态性SSR标记共检测到94个等位变异,平均每个位点检测到等位变异8.5个;引物的多态性信息含量(PIC)变幅为0.146~0.850,平均值为0.593;遗传多样性变幅为0.152~0.862,平均为0.630。群体结构分析将供试材料划分为3个亚群;通过关联分析,发现5个标记位点与6个性状显著关联(P<0.01),各标记位点对表型变异的解释率为30.4%~55.8%,其中FJ024285和FJ024294标记与株高相关联,FE528073与顶小叶长、柱头颜色和房衣颜色相关联,FJ024287与柄叶比相关联,EU678295与色斑大小相关联。研究表明:所选紫斑牡丹种质资源群体的群体结构简单、遗传变异较为丰富,适用于紫斑牡丹目标性状的关联分析。关联分析能够有效地找到与紫斑牡丹表型性状紧密连锁的SSR标记,用于分子标记辅助育种。

English Abstract

吴静, 成仿云, 庞利铮, 钟原, 蔡长福. 紫斑牡丹表型性状与SSR分子标记的关联分析[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(8): 80-87. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150377
引用本文: 吴静, 成仿云, 庞利铮, 钟原, 蔡长福. 紫斑牡丹表型性状与SSR分子标记的关联分析[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(8): 80-87. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150377
WU Jing, CHENG Fang-yun, PANG Li-zheng, ZHONG Yuan, CAI Chang-fu.. Association analysis of phenotypic traits with SSR markers in Paeonia rockii.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(8): 80-87. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150377
Citation: WU Jing, CHENG Fang-yun, PANG Li-zheng, ZHONG Yuan, CAI Chang-fu.. Association analysis of phenotypic traits with SSR markers in Paeonia rockii.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(8): 80-87. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150377
参考文献 (54)

目录

    /

    返回文章
    返回