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基于SRAP分子标记的刨花润楠遗传多样性分析

周鹏,  林玮,  朱芹,  周祥斌,  吴林瑛,  陈晓阳

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周鹏, 林玮, 朱芹, 周祥斌, 吴林瑛, 陈晓阳. 基于SRAP分子标记的刨花润楠遗传多样性分析[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(9): 16-24. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150423
引用本文: 周鹏, 林玮, 朱芹, 周祥斌, 吴林瑛, 陈晓阳. 基于SRAP分子标记的刨花润楠遗传多样性分析[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(9): 16-24. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150423
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ZHOU Peng, LIN Wei, ZHU Qin, ZHOU Xiang-bin, WU Lin-ying, CHEN Xiao-yang. Genetic diversity of Machilus pauhoi assessed by SRAP markers.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(9): 16-24. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150423
Citation: ZHOU Peng, LIN Wei, ZHU Qin, ZHOU Xiang-bin, WU Lin-ying, CHEN Xiao-yang. Genetic diversity of Machilus pauhoi assessed by SRAP markers.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(9): 16-24. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150423
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基于SRAP分子标记的刨花润楠遗传多样性分析

doi: 10.13332/j.1000-1522.20150423
  • 1.

    1 华南农业大学林学与风景园林学院,广东省森林植物种质创新与利用重点实验室;

  • 2.

    2 广东生态工程职业学院;

  • 3.

    3 嘉应学院生命科学学院

基金项目: 

十二五国家科技支撑计划项目(2012BAD01B04)、广东省林业科技创新项目(2011KJCX002)。

详细信息
    作者简介:

    周鹏。主要研究方向:林木遗传育种。Email:zhoupeng_0119@163.com地址:510520广东省广州市天河区广东生态工程职业学院。责任作者:陈晓阳,教授,博士生导师。主要研究方向:林木良种选育与生物技术。Email:xychen@scau.edu.cn地址:510642广东省广州市天河区华南农业大学林学与风景园林学院。

    周鹏。主要研究方向:林木遗传育种。Email:zhoupeng_0119@163.com地址:510520广东省广州市天河区广东生态工程职业学院。责任作者:陈晓阳,教授,博士生导师。主要研究方向:林木良种选育与生物技术。Email:xychen@scau.edu.cn地址:510642广东省广州市天河区华南农业大学林学与风景园林学院。

Genetic diversity of Machilus pauhoi assessed by SRAP markers.

  • 1.

    1 College of Forestry and Landscape Architecture, South China Agricultural University,Guangdong Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Forest Plant Germplasm, Guangzhou, Guangdong, 510642, P.R. China;

  • 2.

    2 Guangdong Vocational College of Ecological Engineering, Guangzhou, Guangdong, 510520, P.R. China;

  • 3.

    3 School of Life Science, Jiaying University, Meizhou, Guangdong, 514015, P.R. China.

  • 摘要: 采用相关序列扩增多态性分子标记方法,对7个省份23个种源的刨花润楠进行遗传多样性分析。结果表明:1)12对引物组合共扩增出157条带,其中115条为多态性条带,占总条带数的73.24%;2)12对引物的多态性指数介于0.406～0.502,平均值为0.476;3)通过分子方差分析发现,刨花润楠种源内差异占总差异的72.19%,种源间差异占总差异的27.81%,种源内差异为刨花润楠差异的主要来源;4)基于遗传距离的聚类分析显示,23个种源的刨花润楠可分为4类:第1类为湖南、广东、广西的所有参试种源和江西多数种源,第2类为浙江参试的3个种源,第3类为江西婺源和安徽黄山2个种源,第4类为福建参试的4个种源,分类结果表现出明显的地理趋势。本研究结果为刨花润楠种质资源的保存及良种选育提供了一定理论基础。
    Abstract: The sequence-related amplified polymorphism(SRAP)markers were used to assess the genetic diversity and relationship of 23 Machilus pauhoi Kanehira provenances from seven provinces. Twelve primers were screened out which were used for SRAP-PCR. The results showed that: 1) a total of 157 clear bands were amplified, and 115 bands were polymorphic (the percentage of polymorphic band, PPB=73.24%); 2) the polymorphism information content (PIC) values ranged from 0.406 to 0.502, with an average of 0.476; 3) the molecular variance analysis (AMOVA) revealed that genetic variation mainly existed within provenance (72.19%) and few among provenances (27.81%), showing that the variation of M. pauhoi within provenances was the major source of genetic diversity; 4) the cluster analysis results suggest that 23 provenances should be divided into four categories: provenances from Hunan, Guangdong, Guangxi and Jiangxi are clustered in the same group; all provenances from Zhejiang Province are together; Wuyuan and Huangshan provenances are classed together; and all provenances from Fujian Province are clustered into one group, The classification results reflect geographic trends significantly. The result of this study provides theoretical basis for germplasm resources preservation and breeding programs of M. pauhoi.
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    [17] 于寒颖, 宗世祥, 李贤军, 程丽莉, 刘智, 王志玲, 雷霆, 江泽慧, 张煜星, 施婷婷, 崔彬彬, 徐剑琦, 黄心渊, 周志强, 周国模, 雷相东, 陈伟, 张展羽, 程金新, 杜官本, 李国平, 曹伟, 肖化顺, 赵俊卉, 刘志军, 郭广猛, 刘童燕, 苏淑钗, 雷洪, 关德新, 张璧光, 曹金珍, 郝雨, 张璧光, 骆有庆, 苏里坦, 杨谦, 丁立建, 张贵, 王正, 李云, 张彩虹, 李云, 王海, 黄群策, 吴家森, 王正, 张则路, 张慧东, 黄晓丽, 陈晓光, 姜培坤, 秦岭, 许志春, 宋南, 刘彤, 贺宏奎, 张佳蕊, 李文军, 刘大鹏, 吴家兵, 张大红, 张国华, 方群, 周晓燕, 王勇, 金晓洁], 张书香, 秦广雍, 常亮, 张金桐, 蔡学理, 李延军, 高黎, 张弥, 于兴华, 姜静, 刘海龙, 陈燕, 刘建立, 姜金仲, 苏晓华, 冯慧, 陈绪和, 王安志, 朱彩霞, 周梅, 王德国, 张冰玉, 尹伟伦, 王谦, 成小芳, 张勤, 张连生, 亢新刚, 金昌杰, 陈建伟3, 聂立水, 冯大领, 韩士杰, 崔国发, 梁树军, 胡君艳, 姚国龙.  光皮桦天然群体遗传多样性研究 . 北京林业大学学报, 2006, 28(6): 28-34.
    [18] 刘震, 李景文, 符韵林, 熊瑾, 殷亚方, 饶良懿, 杜华强, 
    王保平, 杨晓晖, 黄国胜, 宋小双, 侯亚南, 李景文, 龙玲, 詹亚光, 张一平, 杨海龙, 张秋英, 李全发, 王明枝, 李慧, 李梅, 马文辉, 秦瑶, 徐峰, 王洁瑛, 韩海荣, 窦军霞, 李发东, 吕建雄, 李妮亚, 陈晓阳, 李俊清, 范文义, 李俊清, 李吉跃, 朱金兆, 刘文耀, 耿晓东, 赵敏, 王雪军, 梁机, 尹立辉, 朱金兆, 张克斌, 陆熙娴, 赵宪文, 刘雪梅, 刘桂丰, 康峰峰, 倪春, 李云, 陈素文, 唐黎明, 乔杰, 于贵瑞, 孙玉军, 欧国强, 陈晓阳, 沈有信, 李凤兰, 李黎, 秦素玲, 慈龙骏, 毕华兴, 齐实, 韦广绥, 黎昌琼, 赵双菊, 魏建祥, 宋献方, 张桂芹, 朱国平, 王玉成, 李伟, 刘伦辉, 任海青, 李伟, 蒋建平, 王雪, 马钦彦, 文瑞钧, 周海江, 丁霞, , 孙涛, 杨谦, 宋清海, 张万军, 李慧, 孙晓敏, 孙志强, 刘莹, 李宗然, 
    , .  欧亚大陆水青冈种群遗传多样性对比分析 . 北京林业大学学报, 2005, 27(5): 1-9.
    [19] 高莉萍, 李红, 周存宇, 孙仁山, 程广有, 包仁艳, 贺康宁, 吕建雄, 王继强, 王跃思, 李利平, 谢力生, 赵东, 高峰, 李吉跃, 姜春宁, 邢韶华, 李世荣, 向仕龙, 殷亚方, 周国逸, 包满珠, 高林, 于志明, 李文彬, 孙扬, 赵勃, 曹全军, 郑彩霞, 王迎红, 史常青, 赵有科, 葛春华, 刘娟娟, 田勇臣, 孙磊, 丁坤善, 张德强, 王清春, 姜笑梅, 唐晓杰, 高亦珂, 孙艳玲, 华丽, 周心澄, 崔国发, 刘世忠, 张启翔, .  四川省珍稀濒危植物延龄草遗传多样性分析 . 北京林业大学学报, 2005, 27(4): 0-6.
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    王保平, 杨海龙, 李景文, 李全发, 熊瑾, 王明枝, 宋小双, 窦军霞, 秦瑶, 朱金兆, 陆熙娴, 范文义, 吕建雄, 徐峰, 张克斌, 尹立辉, 耿晓东, 李俊清, 韩海荣, 朱金兆, 陈晓阳, 李俊清, 王洁瑛, 梁机, 刘文耀, 王雪军, 李吉跃, 李发东, 赵敏, 李妮亚, 孙玉军, 毕华兴, 沈有信, 慈龙骏, 赵宪文, 陈晓阳, 乔杰, 齐实, 倪春, 李云, 欧国强, 唐黎明, 陈素文, 康峰峰, 李凤兰, 刘雪梅, 刘桂丰, 李黎, 于贵瑞, 秦素玲, 李伟, 刘伦辉, 文瑞钧, 张桂芹, 任海青, 黎昌琼, 朱国平, 魏建祥, 马钦彦, 王玉成, 李伟, 赵双菊, 蒋建平, 王雪, 宋献方, 韦广绥, 李慧, , 宋清海, 周海江, 丁霞, 孙涛, 张万军, 杨谦, 孙志强, 孙晓敏, 刘莹, 李宗然, 
    .  欧亚大陆水青冈种群遗传多样性对比分析 . 北京林业大学学报, 2005, 27(4): 1-9.
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出版历程
  • 收稿日期:  2015-11-21
  • 刊出日期:  2016-09-30

基于SRAP分子标记的刨花润楠遗传多样性分析

doi: 10.13332/j.1000-1522.20150423
  • 1. 1 华南农业大学林学与风景园林学院,广东省森林植物种质创新与利用重点实验室;
  • 2.  2 广东生态工程职业学院;
  • 3.  3 嘉应学院生命科学学院
    • 基金项目:

    十二五国家科技支撑计划项目(2012BAD01B04)、广东省林业科技创新项目(2011KJCX002)。

    作者简介:

    周鹏。主要研究方向:林木遗传育种。Email:zhoupeng_0119@163.com地址:510520广东省广州市天河区广东生态工程职业学院。责任作者:陈晓阳,教授,博士生导师。主要研究方向:林木良种选育与生物技术。Email:xychen@scau.edu.cn地址:510642广东省广州市天河区华南农业大学林学与风景园林学院。

    周鹏。主要研究方向:林木遗传育种。Email:zhoupeng_0119@163.com地址:510520广东省广州市天河区广东生态工程职业学院。责任作者:陈晓阳,教授,博士生导师。主要研究方向:林木良种选育与生物技术。Email:xychen@scau.edu.cn地址:510642广东省广州市天河区华南农业大学林学与风景园林学院。

  • 收稿日期: 2015-11-21
  • 刊出日期: 2016-09-30

摘要: 采用相关序列扩增多态性分子标记方法,对7个省份23个种源的刨花润楠进行遗传多样性分析。结果表明:1)12对引物组合共扩增出157条带,其中115条为多态性条带,占总条带数的73.24%;2)12对引物的多态性指数介于0.406～0.502,平均值为0.476;3)通过分子方差分析发现,刨花润楠种源内差异占总差异的72.19%,种源间差异占总差异的27.81%,种源内差异为刨花润楠差异的主要来源;4)基于遗传距离的聚类分析显示,23个种源的刨花润楠可分为4类:第1类为湖南、广东、广西的所有参试种源和江西多数种源,第2类为浙江参试的3个种源,第3类为江西婺源和安徽黄山2个种源,第4类为福建参试的4个种源,分类结果表现出明显的地理趋势。本研究结果为刨花润楠种质资源的保存及良种选育提供了一定理论基础。

English Abstract

周鹏, 林玮, 朱芹, 周祥斌, 吴林瑛, 陈晓阳. 基于SRAP分子标记的刨花润楠遗传多样性分析[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(9): 16-24. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150423
引用本文: 周鹏, 林玮, 朱芹, 周祥斌, 吴林瑛, 陈晓阳. 基于SRAP分子标记的刨花润楠遗传多样性分析[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(9): 16-24. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150423
shu
ZHOU Peng, LIN Wei, ZHU Qin, ZHOU Xiang-bin, WU Lin-ying, CHEN Xiao-yang. Genetic diversity of Machilus pauhoi assessed by SRAP markers.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(9): 16-24. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150423
Citation: ZHOU Peng, LIN Wei, ZHU Qin, ZHOU Xiang-bin, WU Lin-ying, CHEN Xiao-yang. Genetic diversity of Machilus pauhoi assessed by SRAP markers.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(9): 16-24. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150423
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