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月季NBS-LRR-RGAs的分离与鉴定

张非亚 杜运鹏 刘瑞峰 袁晓娜 张冬梅 贾桂霞

张非亚, 杜运鹏, 刘瑞峰, 袁晓娜, 张冬梅, 贾桂霞. 月季NBS-LRR-RGAs的分离与鉴定[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(11): 89-96. doi: 10.13332/j.1000-1522.20160092
引用本文: 张非亚, 杜运鹏, 刘瑞峰, 袁晓娜, 张冬梅, 贾桂霞. 月季NBS-LRR-RGAs的分离与鉴定[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(11): 89-96. doi: 10.13332/j.1000-1522.20160092
ZHANG Fei-ya, DU Yun-peng, LIU Rui-feng, YUAN Xiao-na, ZHANG Dong-mei, JIA Gui-xia. Isolation and characterization of NBS-LRR resistance gene candidates in rose.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(11): 89-96. doi: 10.13332/j.1000-1522.20160092
Citation: ZHANG Fei-ya, DU Yun-peng, LIU Rui-feng, YUAN Xiao-na, ZHANG Dong-mei, JIA Gui-xia. Isolation and characterization of NBS-LRR resistance gene candidates in rose.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(11): 89-96. doi: 10.13332/j.1000-1522.20160092

月季NBS-LRR-RGAs的分离与鉴定

doi: 10.13332/j.1000-1522.20160092
基金项目: 

“863”国家高技术研究发展计划项目(2011AA100208)、 上海科委农业重点项目(13391900902)。

详细信息
    作者简介:

    张非亚。主要研究方向:月季遗传育种与抗病。Email: zhangfeiya0207@163.com 地址:100083 北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。   责任作者: 张冬梅,教授级高级工程师。主要研究方向:植物遗传育种。Email: zdm0512@sohu.com 地址:200232 上海市徐汇区龙吴路899号上海市园林科学规划研究院。贾桂霞,教授,博士生导师。主要研究方向:观赏植物种质资源与遗传育种。 Email: gxjia@bjfu.edu.cn 地址:100083 北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。

    张非亚。主要研究方向:月季遗传育种与抗病。Email: zhangfeiya0207@163.com 地址:100083 北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。   责任作者: 张冬梅,教授级高级工程师。主要研究方向:植物遗传育种。Email: zdm0512@sohu.com 地址:200232 上海市徐汇区龙吴路899号上海市园林科学规划研究院。贾桂霞,教授,博士生导师。主要研究方向:观赏植物种质资源与遗传育种。 Email: gxjia@bjfu.edu.cn 地址:100083 北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。

    张非亚。主要研究方向:月季遗传育种与抗病。Email: zhangfeiya0207@163.com 地址:100083 北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。   责任作者: 张冬梅,教授级高级工程师。主要研究方向:植物遗传育种。Email: zdm0512@sohu.com 地址:200232 上海市徐汇区龙吴路899号上海市园林科学规划研究院。贾桂霞,教授,博士生导师。主要研究方向:观赏植物种质资源与遗传育种。 Email: gxjia@bjfu.edu.cn 地址:100083 北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。

Isolation and characterization of NBS-LRR resistance gene candidates in rose.

  • 摘要: RGAs已经在很多植物中得到分离与克隆,它往往是R基因或者是R基因的一部分。为了分离与鉴定与月季抗黑斑病相关的RGAs,在转录组数据基础上,设计简并引物6对,从现代月季、疏花蔷薇、‘白玫瑰’上分离克隆了 NBS-LRR-RGAs,挑取750个克隆进行序列分析。从系统发育树可以看出:所克隆的RGAs与已克隆的其他植物的R基因具有较近的亲缘关系,分为non-TIR-NBS-RGAs和TIR-NBS-RGAs 2个大类,10个进化枝,其中所克隆得到的non-TIR-NBS-RGAs的比例远大于TIR-NBS-RGAs的比例;氨基酸序列比对发现所克隆的RGAs均含有完整的NBS结构域P-Loop、kinase-2、kinase-3a和GLPL;通过进化树对不同家族的6个 RGAs 的表达分析可看出,它们都不同程度、不同时间地参与了抗病反应。
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出版历程
  • 收稿日期:  2016-03-20
  • 刊出日期:  2016-11-30

月季NBS-LRR-RGAs的分离与鉴定

doi: 10.13332/j.1000-1522.20160092
    基金项目:

    “863”国家高技术研究发展计划项目(2011AA100208)、 上海科委农业重点项目(13391900902)。

    作者简介:

    张非亚。主要研究方向:月季遗传育种与抗病。Email: zhangfeiya0207@163.com 地址:100083 北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。   责任作者: 张冬梅,教授级高级工程师。主要研究方向:植物遗传育种。Email: zdm0512@sohu.com 地址:200232 上海市徐汇区龙吴路899号上海市园林科学规划研究院。贾桂霞,教授,博士生导师。主要研究方向:观赏植物种质资源与遗传育种。 Email: gxjia@bjfu.edu.cn 地址:100083 北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。

    张非亚。主要研究方向:月季遗传育种与抗病。Email: zhangfeiya0207@163.com 地址:100083 北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。   责任作者: 张冬梅,教授级高级工程师。主要研究方向:植物遗传育种。Email: zdm0512@sohu.com 地址:200232 上海市徐汇区龙吴路899号上海市园林科学规划研究院。贾桂霞,教授,博士生导师。主要研究方向:观赏植物种质资源与遗传育种。 Email: gxjia@bjfu.edu.cn 地址:100083 北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。

    张非亚。主要研究方向:月季遗传育种与抗病。Email: zhangfeiya0207@163.com 地址:100083 北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。   责任作者: 张冬梅,教授级高级工程师。主要研究方向:植物遗传育种。Email: zdm0512@sohu.com 地址:200232 上海市徐汇区龙吴路899号上海市园林科学规划研究院。贾桂霞,教授,博士生导师。主要研究方向:观赏植物种质资源与遗传育种。 Email: gxjia@bjfu.edu.cn 地址:100083 北京市海淀区清华东路35号北京林业大学园林学院。

摘要: RGAs已经在很多植物中得到分离与克隆,它往往是R基因或者是R基因的一部分。为了分离与鉴定与月季抗黑斑病相关的RGAs,在转录组数据基础上,设计简并引物6对,从现代月季、疏花蔷薇、‘白玫瑰’上分离克隆了 NBS-LRR-RGAs,挑取750个克隆进行序列分析。从系统发育树可以看出:所克隆的RGAs与已克隆的其他植物的R基因具有较近的亲缘关系,分为non-TIR-NBS-RGAs和TIR-NBS-RGAs 2个大类,10个进化枝,其中所克隆得到的non-TIR-NBS-RGAs的比例远大于TIR-NBS-RGAs的比例;氨基酸序列比对发现所克隆的RGAs均含有完整的NBS结构域P-Loop、kinase-2、kinase-3a和GLPL;通过进化树对不同家族的6个 RGAs 的表达分析可看出,它们都不同程度、不同时间地参与了抗病反应。

English Abstract

张非亚, 杜运鹏, 刘瑞峰, 袁晓娜, 张冬梅, 贾桂霞. 月季NBS-LRR-RGAs的分离与鉴定[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(11): 89-96. doi: 10.13332/j.1000-1522.20160092
引用本文: 张非亚, 杜运鹏, 刘瑞峰, 袁晓娜, 张冬梅, 贾桂霞. 月季NBS-LRR-RGAs的分离与鉴定[J]. 北京林业大学学报, 2016, 38(11): 89-96. doi: 10.13332/j.1000-1522.20160092
ZHANG Fei-ya, DU Yun-peng, LIU Rui-feng, YUAN Xiao-na, ZHANG Dong-mei, JIA Gui-xia. Isolation and characterization of NBS-LRR resistance gene candidates in rose.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(11): 89-96. doi: 10.13332/j.1000-1522.20160092
Citation: ZHANG Fei-ya, DU Yun-peng, LIU Rui-feng, YUAN Xiao-na, ZHANG Dong-mei, JIA Gui-xia. Isolation and characterization of NBS-LRR resistance gene candidates in rose.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2016, 38(11): 89-96. doi: 10.13332/j.1000-1522.20160092
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