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赵铁珍, 汪杭军1, 韦艳葵, 段文霞, 刘剑锋, 刘鹏举, 王兰珍, 周传艳, 李国雷, 耿玉清, 薛康, 任强, 方升佐, 张冬梅, 王立海, HUALi_zhong, 李生宇, 党文杰, 朱小龙, 李雪华, 吴丽娟, 王旭, 李义良, 周亮, 李振基, 雷加强, 高岚, 余新晓, 刘勇, 刘勇, 黎明, 方陆明, 李建章, 韩士杰, 苏晓华, 尹光彩, JIANGXi_dian, 杨娅, 阎秀峰, 朱波, 周宇飞, 宋永明, 何茜, 崔同林, 周国逸, 杨慧敏, 周国逸, 柯水发, 赖志华, 徐新文, 王新杰, HEXiu_bin, 刘锐, 徐扬, 鹿振友, 王春林, 王清文, 唐小明, 虞木奎, 沈熙环, 孙向阳, 玲, 喻理飞, 张冰玉, 宗文君, 程云清, 李吉跃, 李晓兰, 陈实, 孙阁, 齐涛, 张志毅, 王伟宏, , 郭蓓, 国庆, 李丙文, 宋爱琴, 陈峻崎, 3, 茹广欣, 温亚利, 李俊清, 周晓梅, 陈培金, 王建林, 刘志明, 周玉平, 王晓静, 长山, 王旭, 姚永刚, 张可栋, 蒋德明, 唐旭利, 陈放, 王春林, 关少华, 宋湛谦, 赵双荣, 杨伟伟, 闫俊华, 郑凌峰. 油松SSR-PCR引物筛选及反应体系的建立[J]. 北京林业大学学报, 2007, 29(2): 13-17.
引用本文: 赵铁珍, 汪杭军1, 韦艳葵, 段文霞, 刘剑锋, 刘鹏举, 王兰珍, 周传艳, 李国雷, 耿玉清, 薛康, 任强, 方升佐, 张冬梅, 王立海, HUALi_zhong, 李生宇, 党文杰, 朱小龙, 李雪华, 吴丽娟, 王旭, 李义良, 周亮, 李振基, 雷加强, 高岚, 余新晓, 刘勇, 刘勇, 黎明, 方陆明, 李建章, 韩士杰, 苏晓华, 尹光彩, JIANGXi_dian, 杨娅, 阎秀峰, 朱波, 周宇飞, 宋永明, 何茜, 崔同林, 周国逸, 杨慧敏, 周国逸, 柯水发, 赖志华, 徐新文, 王新杰, HEXiu_bin, 刘锐, 徐扬, 鹿振友, 王春林, 王清文, 唐小明, 虞木奎, 沈熙环, 孙向阳, 玲, 喻理飞, 张冰玉, 宗文君, 程云清, 李吉跃, 李晓兰, 陈实, 孙阁, 齐涛, 张志毅, 王伟宏, , 郭蓓, 国庆, 李丙文, 宋爱琴, 陈峻崎, 3, 茹广欣, 温亚利, 李俊清, 周晓梅, 陈培金, 王建林, 刘志明, 周玉平, 王晓静, 长山, 王旭, 姚永刚, 张可栋, 蒋德明, 唐旭利, 陈放, 王春林, 关少华, 宋湛谦, 赵双荣, 杨伟伟, 闫俊华, 郑凌峰. 油松SSR-PCR引物筛选及反应体系的建立[J]. 北京林业大学学报, 2007, 29(2): 13-17.
WANG Lan-zhen, WANG Hang-jun, GAO Jin_hui, SONG Yan, YAN Jun-hua, TANG Jinnian, SONG Zi-juan, XU Xianying, JI Jin-jun, , LIU Yo, FANG Lu-ming, LI Shu-jun, ZHENG Ling_feng, WANG Dong_mei, , ZHU Lin-hong, YU Li-fei, ZHOU Guo-yi, YUAN Hai-jian, LIU Li-mei, ZHAO Liang, ZHANG Shi-ying, CHEN Pei-jin, SUN Ge, JIN Hongxi, , LIU Zhi-ming, TANG Xu-li, ZHANG Dun ming, WANG Duo_dong, SONG Zhan-qian, WANG Chun-lin, , . Selection of primers and establishment of SSRPCR reaction system on Pinus tabulaeformis Carr.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2007, 29(2): 13-17.
Citation:
WANG Lan-zhen,

WANG Hang-jun, GAO Jin_hui, SONG Yan, YAN Jun-hua, TANG Jinnian, SONG Zi-juan, XU Xianying, JI Jin-jun, , LIU Yo, FANG Lu-ming, LI Shu-jun, ZHENG Ling_feng, WANG Dong_mei, , ZHU Lin-hong, YU Li-fei, ZHOU Guo-yi, YUAN Hai-jian, LIU Li-mei, ZHAO Liang, ZHANG Shi-ying, CHEN Pei-jin, SUN Ge, JIN Hongxi,

, LIU Zhi-ming, TANG Xu-li, ZHANG Dun
ming, WANG Duo_dong, SONG Zhan-qian, WANG Chun-lin, , . Selection of primers and establishment of SSRPCR reaction system on Pinus tabulaeformis Carr.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2007, 29(2): 13-17.

油松SSR-PCR引物筛选及反应体系的建立

Selection of primers and establishment of SSRPCR reaction system on Pinus tabulaeformis Carr.

  • 摘要: 油松是我国特有的重要乡土针叶树种,开发合适的油松PCR-SSR引物并建立优化的反应体系,是开展油松天然群体和种子园人工群体遗传研究的基础.该研究以油松总DNA为材料,分析了Taq聚合酶、样本浓度、Mg2+浓度、dNTP浓度以及引物浓度对PCRSSR扩增结果的影响,筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SSR引物12对,建立了稳定的、可重复的油松PCR-SSR最佳反应体系及PCR扩增参数.研究结果表明:在15 μL SSR-PCR反应体系中,样本最适宜浓度为30 ng,Mg2+的最适浓度为0.25 mmol/L,dNTP最适浓度为0.2 mmol/L,单引物的最适浓度均为250 nmol/L;Taq聚合酶在15 μL反应体系中宜加入0.375 U.统计利用所选12对引物,对辽宁兴城油松种子园内49个建园无性系进行了SSR-PCR反应,通过6%的变性聚丙稀酰胺凝胶电泳检测,每对引物扩增产物在100~250 bp之间的等位谱带数最大为10,最小为5,不同无性系间DNA谱带多态性丰富.油松SSR-PCR引物筛选及反应体系的建立,为今后利用SSR标记技术开展油松种子园的父本分析及选择性受精研究提供了一个标准化程序和强有力的工具.
  • [1] 吴夏雷, 韩超, 孙宇涵, 曹森, 胡瑞阳, 徐金良, 郑会全, 李云.  杉木体细胞胚胎发生胚性愈伤组织诱导条件的优化 . 北京林业大学学报, 2020, 42(2): 79-86. doi: 10.12171/j.1000-1522.20190196
    [2] 贺快快, 武文斌, 张子杰, 胡现铬, 韩方旭, 钮世辉, 李悦.  北京油松人工林遗传结构变异及与山西山系种群差异分析 . 北京林业大学学报, 2020, 42(6): 33-42. doi: 10.12171/j.1000-1522.20190399
    [3] 李介文, 杜运鹏, 贾桂霞, 张冬梅.  我国部分百合野生资源的亲缘关系及其分布特点 . 北京林业大学学报, 2019, 41(10): 74-82. doi: 10.13332/j.1000-1522.20180345
    [4] 李亦轩, 赵健, 付双彬, 董明亮, 杨硕, 李珊珊, KongLisheng, 张金凤.  气动生物反应器油松胚性愈伤增殖体系的建立研究 . 北京林业大学学报, 2019, 41(11): 37-43. doi: 10.13332/j.1000-1522.20190221
    [5] 王世杰, 王雪婷, 杜向前, 陈洪刚, 张会恰, 杨敏生.  基于SSR标记的杨树新品种鉴定及核心引物筛选 . 北京林业大学学报, 2019, 41(7): 101-110. doi: 10.13332/j.1000-1522.20190110
    [6] 武文斌, 贺快快, 狄皓, 钮世辉, 马彦光, 张子杰, 李悦.  基于SSR标记的山西省油松山脉地理种群遗传结构与地理系统 . 北京林业大学学报, 2018, 40(10): 51-59. doi: 10.13332/j.1000-1522.20180057
    [7] 张敏, 张唯, 宫再欣, 郑彩霞.  油松大孢子叶球发生发育的形态与解剖学观察 . 北京林业大学学报, 2017, 39(6): 1-12. doi: 10.13332/j.1000-1522.20160411
    [8] 高琼, 王维有, 孟景祥, 刘灏, 邢震, 毛建丰, 王晓茹, 李悦.  油松×云南松杂种与亲本种和高山松的光合特性比较 . 北京林业大学学报, 2016, 38(2): 37-43. doi: 10.13332/j.1000-1522.20140477
    [9] 白雪琪, 张晓丽, 张, 凝, 张连生, 马云波.  基于高光谱遥感的油松毛虫危害程度监测模型 . 北京林业大学学报, 2016, 38(11): 16-22. doi: 10.13332/j.1000-1522.20160139
    [10] 安俊, 郑彩霞, 姚阳, 陈彬丽.  油松胚珠转录组微卫星特征分析 . 北京林业大学学报, 2016, 38(5): 77-83. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150033
    [11] 刘海燕, 魏天兴, 王仙.  黄土丘陵区人工林土壤微生物PLFA标记多样性分析 . 北京林业大学学报, 2016, 38(1): 28-35. doi: 10.13332/j.1000--1522.20150262
    [12] 吴静, 成仿云, 庞利铮, 钟原, 蔡长福.  紫斑牡丹表型性状与SSR分子标记的关联分析 . 北京林业大学学报, 2016, 38(8): 80-87. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150377
    [13] 张唯, 郑彩霞, 赵楠, 李芳.  油松胚珠绒毡层组织形成的观察 . 北京林业大学学报, 2015, 37(7): 53-57. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150078
    [14] 张新波, 李悦, 袁虎威, 李伟, 富裕华, 刘致远, 朱松林.  山西油松天然林分21 年子代生长性状遗传变异研究 . 北京林业大学学报, 2014, 36(3): 104-109. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.03.016
    [15] 奚如春, 邓小梅, 马履一.  油松树体声发射信号特征研究 . 北京林业大学学报, 2011, 33(6): 151-156.
    [16] 董金宝, 李文彬.  便携式割灌机U型手柄的人机工程学优化研究 . 北京林业大学学报, 2008, 30(3): 144-146.
    [17] 胡淑萍, 余新晓, 王小平, 秦永胜, 陈俊崎.  人工神经网络在流域植被类型优化中的应用 . 北京林业大学学报, 2008, 30(supp.2): 1-5.
    [18] 杨平, 颜绍馗, 黄荣凤, 郑小贤, 魏潇潇, 张洪江, 吴彩燕, 何亚平, 殷亚方, 高黎, 王费新, 袁怀文, 周永学, 白岗栓, 王芳, 胡胜华, 张莉俊, 邓小文, 张璧光, 秦爱光, 毛俊娟, 李瑞, 胡万良, 刘杏娥, 戴思兰, 王小青, 杜社妮, 汪思龙, 刘燕, 常旭, 乔建平, 樊军锋, 谭学仁, NagaoHirofumi, 李猛, 王正, 费世民, 张岩, 张克斌, 赵天忠, 罗晓芳, 王晓欢, 孙向阳, 王兆印, 崔赛华, 王胜华, 徐嘉, 韩士杰, 张占雄, , 高荣孚, 李昀, 江泽慧, 龚月桦, 孔祥文, 范冰, 江玉林, 张旭, KatoHideo, 王海燕, 李华, 刘云芳, 张双保, 陈放, 侯喜录, 杨培华, IdoHirofumi, 刘秀英, 郭树花, 李媛良, 任海青, 陈宗伟, , 常亮, 李晓峰, 丁磊, 陈秀明, 陈学平, 费本华, 蒋俊明, 李考学, 张桂兰, 高建社, , 薛岩, 张代贵, 徐庆祥, , 王晓东, , 金鑫, 刘永红, 续九如, 李雪峰, 涂代伦, 丁国权, , 张红丽, , .  黄土丘陵区雨季栽植油松试验 . 北京林业大学学报, 2007, 29(6): 196-200.
    [19] 金莹杉, 王蕾, 邢韶华, 任云卯, 张玉兰, 张秀新, 尹增芳, 李云开, 梁善庆, 王超, 李昌晓, 王春梅, 林娅, 周繇, 林勇明, 孙阁, 刘杏娥, 周海宾, 赵铁珍, 张仁军, 张运春, 陈圆, 吴淑芳, 谭健晖, 张颖, 闫德千, 王戈, 李春义, 崔丽娟, 罗建举, 于俊林, 吴普特, 马履一, 徐秋芳, 刘青林, 樊汝汶, 王以红, 刘艳红, 张桥英, 翟明普, 杨培岭, 杨远芬, 黄华国, 赵勃, 高岚, 张志强, 温亚利, 江泽慧, 张曼胤, 张明, 江泽慧, 王莲英, 马钦彦, 余养伦, 洪滔, 钟章成, 周荣伍, 刘国经, 王小青, 周国模, 张本刚, 罗鹏, 刘俊昌, 于文吉, 张晓丽, 陈学政, 周国逸, 费本华, 安玉涛, 杨海军, 柯水发, 崔国发, 汪晓峰, 王希群, 王玉涛, 冯浩, 殷际松, 何春光, 吴承祯, 田英杰, 邵彬, 马润国, 赵景刚, 骆有庆, 何松云, 李敏, 徐昕, 温亚利, 王九中, 邬奇峰, 徐克学, 高贤明, 洪伟, 魏晓华, 刘爱青, 康峰峰, 任树梅, 蔡玲, 费本华, 安树杰, 吴家森, 吴宁, 朱高浦, 郑万建, 林斌, 任海青, 赵弟行, 田平, 赵焕勋, 胡喜生, 卢俊峰, 李永祥, 宋萍, 范海兰.  从森林绿色核算看我国林业政策的优化 . 北京林业大学学报, 2007, 29(3): 164-170.
    [20] 张春雨, 李长洪, 于占源, 姜春宁, 林峰, 李秀芬, 赖巧玲, 吕兆林, 曹金珍, 许月卿, 何恒斌, 何利娟, 杨永福, 郭小平, 史军辉, 李笑吟, 张亚利, 于格, 赵广亮, 王勇, 马履一, 张力平, 王献溥, 王华, 钟健, 贾彩凤, 朱清科, 尚晓倩, 于顺利, 郝玉光, 王继兴, 邵晓梅, 李悦, 赵秀海, 孙长霞, 朱教君, 鲁春霞, 杨明嘉, 杨培岭, 赵博光, 王希群, D.PascalKamdem, 曾德慧, 郭惠红, 毕华兴, 王骏, 胥辉, 李鸿琦, 郑彩霞, 习宝田, 贾桂霞, 黄忠良, 甘敬, 王庆礼, 尚宇, 杨为民, 欧阳学军, 王秀珍, 丁琼, 李黎, 朱金兆, 包仁艳, 谢高地, 陈宏伟, 刘燕, 张榕, 姜凤岐, 丁琼, 任树梅, 郑景明, 费孛, 周金池, 张志2, 崔小鹏, 沈应柏, 张中南, 贾桂霞, 范志平, 刘足根, 沈应柏, , , 何晓青, 张池, 蔡宝军, 贾昆锋, 刘艳, 刘鑫, 纳磊, 周金池, 李凤兰, 毛志宏, 唐小明, 张方秋, 李林, 陈伏生, 鹿振友, 赵琼, , 申世杰, 周小勇, 马玲, .  油松胚珠蛋白质提取分离技术的优化 . 北京林业大学学报, 2006, 28(4): 96-99.
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出版历程
  • 收稿日期:  1900-01-01
  • 修回日期:  1900-01-01
  • 刊出日期:  2007-03-30

油松SSR-PCR引物筛选及反应体系的建立

摘要: 油松是我国特有的重要乡土针叶树种,开发合适的油松PCR-SSR引物并建立优化的反应体系,是开展油松天然群体和种子园人工群体遗传研究的基础.该研究以油松总DNA为材料,分析了Taq聚合酶、样本浓度、Mg2+浓度、dNTP浓度以及引物浓度对PCRSSR扩增结果的影响,筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SSR引物12对,建立了稳定的、可重复的油松PCR-SSR最佳反应体系及PCR扩增参数.研究结果表明:在15 μL SSR-PCR反应体系中,样本最适宜浓度为30 ng,Mg2+的最适浓度为0.25 mmol/L,dNTP最适浓度为0.2 mmol/L,单引物的最适浓度均为250 nmol/L;Taq聚合酶在15 μL反应体系中宜加入0.375 U.统计利用所选12对引物,对辽宁兴城油松种子园内49个建园无性系进行了SSR-PCR反应,通过6%的变性聚丙稀酰胺凝胶电泳检测,每对引物扩增产物在100~250 bp之间的等位谱带数最大为10,最小为5,不同无性系间DNA谱带多态性丰富.油松SSR-PCR引物筛选及反应体系的建立,为今后利用SSR标记技术开展油松种子园的父本分析及选择性受精研究提供了一个标准化程序和强有力的工具.

English Abstract

赵铁珍, 汪杭军1, 韦艳葵, 段文霞, 刘剑锋, 刘鹏举, 王兰珍, 周传艳, 李国雷, 耿玉清, 薛康, 任强, 方升佐, 张冬梅, 王立海, HUALi_zhong, 李生宇, 党文杰, 朱小龙, 李雪华, 吴丽娟, 王旭, 李义良, 周亮, 李振基, 雷加强, 高岚, 余新晓, 刘勇, 刘勇, 黎明, 方陆明, 李建章, 韩士杰, 苏晓华, 尹光彩, JIANGXi_dian, 杨娅, 阎秀峰, 朱波, 周宇飞, 宋永明, 何茜, 崔同林, 周国逸, 杨慧敏, 周国逸, 柯水发, 赖志华, 徐新文, 王新杰, HEXiu_bin, 刘锐, 徐扬, 鹿振友, 王春林, 王清文, 唐小明, 虞木奎, 沈熙环, 孙向阳, 玲, 喻理飞, 张冰玉, 宗文君, 程云清, 李吉跃, 李晓兰, 陈实, 孙阁, 齐涛, 张志毅, 王伟宏, , 郭蓓, 国庆, 李丙文, 宋爱琴, 陈峻崎, 3, 茹广欣, 温亚利, 李俊清, 周晓梅, 陈培金, 王建林, 刘志明, 周玉平, 王晓静, 长山, 王旭, 姚永刚, 张可栋, 蒋德明, 唐旭利, 陈放, 王春林, 关少华, 宋湛谦, 赵双荣, 杨伟伟, 闫俊华, 郑凌峰. 油松SSR-PCR引物筛选及反应体系的建立[J]. 北京林业大学学报, 2007, 29(2): 13-17.
引用本文: 赵铁珍, 汪杭军1, 韦艳葵, 段文霞, 刘剑锋, 刘鹏举, 王兰珍, 周传艳, 李国雷, 耿玉清, 薛康, 任强, 方升佐, 张冬梅, 王立海, HUALi_zhong, 李生宇, 党文杰, 朱小龙, 李雪华, 吴丽娟, 王旭, 李义良, 周亮, 李振基, 雷加强, 高岚, 余新晓, 刘勇, 刘勇, 黎明, 方陆明, 李建章, 韩士杰, 苏晓华, 尹光彩, JIANGXi_dian, 杨娅, 阎秀峰, 朱波, 周宇飞, 宋永明, 何茜, 崔同林, 周国逸, 杨慧敏, 周国逸, 柯水发, 赖志华, 徐新文, 王新杰, HEXiu_bin, 刘锐, 徐扬, 鹿振友, 王春林, 王清文, 唐小明, 虞木奎, 沈熙环, 孙向阳, 玲, 喻理飞, 张冰玉, 宗文君, 程云清, 李吉跃, 李晓兰, 陈实, 孙阁, 齐涛, 张志毅, 王伟宏, , 郭蓓, 国庆, 李丙文, 宋爱琴, 陈峻崎, 3, 茹广欣, 温亚利, 李俊清, 周晓梅, 陈培金, 王建林, 刘志明, 周玉平, 王晓静, 长山, 王旭, 姚永刚, 张可栋, 蒋德明, 唐旭利, 陈放, 王春林, 关少华, 宋湛谦, 赵双荣, 杨伟伟, 闫俊华, 郑凌峰. 油松SSR-PCR引物筛选及反应体系的建立[J]. 北京林业大学学报, 2007, 29(2): 13-17.
WANG Lan-zhen, WANG Hang-jun, GAO Jin_hui, SONG Yan, YAN Jun-hua, TANG Jinnian, SONG Zi-juan, XU Xianying, JI Jin-jun, , LIU Yo, FANG Lu-ming, LI Shu-jun, ZHENG Ling_feng, WANG Dong_mei, , ZHU Lin-hong, YU Li-fei, ZHOU Guo-yi, YUAN Hai-jian, LIU Li-mei, ZHAO Liang, ZHANG Shi-ying, CHEN Pei-jin, SUN Ge, JIN Hongxi, , LIU Zhi-ming, TANG Xu-li, ZHANG Dun ming, WANG Duo_dong, SONG Zhan-qian, WANG Chun-lin, , . Selection of primers and establishment of SSRPCR reaction system on Pinus tabulaeformis Carr.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2007, 29(2): 13-17.
Citation:
WANG Lan-zhen,

WANG Hang-jun, GAO Jin_hui, SONG Yan, YAN Jun-hua, TANG Jinnian, SONG Zi-juan, XU Xianying, JI Jin-jun, , LIU Yo, FANG Lu-ming, LI Shu-jun, ZHENG Ling_feng, WANG Dong_mei, , ZHU Lin-hong, YU Li-fei, ZHOU Guo-yi, YUAN Hai-jian, LIU Li-mei, ZHAO Liang, ZHANG Shi-ying, CHEN Pei-jin, SUN Ge, JIN Hongxi,

, LIU Zhi-ming, TANG Xu-li, ZHANG Dun
ming, WANG Duo_dong, SONG Zhan-qian, WANG Chun-lin, , . Selection of primers and establishment of SSRPCR reaction system on Pinus tabulaeformis Carr.[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2007, 29(2): 13-17.

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