胡杨SCL7基因及其启动子片段的克隆与分析
Cloning and analysis of SCL7 gene from Populus euphratica
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摘要: 根据拟南芥SCL7基因序列，以杨树基因组数据库为背景克隆得到了胡杨胁迫诱导基因SCL7全长及其启动子片段，所得基因命名为PeSCL7。序列分析表明：该基因的开放阅读框1 767 bp，编码588个氨基酸，该基因不含内含子。同源性比对发现该基因属于GRAS/SCL蛋白家族中SCL4/7分支；半定量RT-PCR结果显示，PeSCL7的表达受到多种逆境胁迫的诱导，且当胁迫处理3 h时表达量达到最大值；对器官表达特异性进行分析，发现PeSCL7在胡杨的根、茎、叶中均有表达。克隆得到的胡杨PeSCL7启动子序列长968 bp，包含可能与干旱胁迫、病害胁迫等应答元件。Abstract: To characterize the function of SCL7 in Populus euphratica, we cloned the full-length PeSCL7 gene and promoter region based on the AtSCL7 sequence of Arabidopsis and the Populus database. DNA sequence analysis showed that the PeSCL7 gene contained an open reading frame of 1 767 bp long without intron and encoded a 588 amino acid polypeptide. Similarity analysis showed that it belonged to the SCL4/7 branch of GRAS/SCL family. RT-PCR analysis revealed that the PeSCL7 could be induced by various stresses and the expression reached a maximum after 3 hrs of induction. PeSCL7 was detected in leaves, stems and roots in P. euphratica via the analysis on the organ-specific expression. The PeSCL7 promoter sequence, about 968 bp in length, contained many stress-responsive cis-acting elements, i.e., ABRE, MYB and WRKY core sequences. The results indicate that the PeSCL7 gene may play a significant role in stress responses of P. euphratica.
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Keywords:
- Populus euphratica /
- GRAS/SCL /
- sequence analysis /
- expression analysis
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期刊类型引用(16)
1. 朱震锋，李梦冉，刘丹，陈丽荣. 中国国有林区研究热点与演变趋势知识图谱分析. 世界林业研究. 2024(01): 23-30 . 
百度学术
2. 李尔彬，吕诺，孙延华. 重点国有林区农林融合发展路径研究. 林业经济问题. 2023(04): 401-408 . 百度学术
3. 严如贺，柯水发，朱烈夫. 资源错配视角下林下经济的产出效率分析——基于国有林区森林猪养殖的案例比较. 林业经济问题. 2018(01): 28-35+103 . 百度学术
4. 王珊珊，曹玉昆. 基于ISM模型的全面停伐后清河林业局经营转型影响因素分析. 中国林业经济. 2017(03): 99-103 . 百度学术
5. 朱震锋，曹玉昆，陈丽荣. 全面停伐背景下重点国有林区改革及发展路径分析——以绥阳林业局为例. 林业经济. 2015(06): 61-65 . 百度学术
6. 杨新华，张敏新. 国有林区经济发展问题的研究现状及展望. 生态经济. 2014(03): 126-130+143 . 百度学术
7. 耿国彪. 林改铺就幸福路. 绿色中国. 2012(04): 12-17 . 百度学术
8. 奚祥华，段永清. 国有林区企业改革探索与实践——聚焦内蒙古根河林业局体制改革. 林业经济. 2012(04): 16-19 . 百度学术
9. 尹华容，程超，刘彬海. 论林权登记制度的法律完善. 当代教育理论与实践. 2011(07): 155-157 . 百度学术
10. 郭小年，支玲，谷振宾，李谦. 天保工程近期研究现状及后续政策研究展望. 世界林业研究. 2011(01): 14-18 . 百度学术
11. 曹玉昆，孙文琪. 国有林区森林资源所有权改革过程中的博弈分析. 商业研究. 2010(10): 60-64 . 百度学术
12. 邓雯雯. 小议《物权法》对国有林权改革的影响. 学理论. 2010(04): 106-107 . 百度学术
13. 刘长乐. 国有林权制度改革面临的主要问题分析. 中国林副特产. 2009(02): 95-96 . 百度学术
14. 田昕加，王兆君. 国有林区林权制度改革博弈分析及政策建议. 林业经济. 2009(05): 42-45 . 百度学术
15. 朱玉杰，李杨，董春芳. 工业工程在森工木材生产中应用实施方案的探讨. 森林工程. 2009(02): 88-91 . 百度学术
16. 吴彦文. 谈国有林区林权制度改革. 黑龙江生态工程职业学院学报. 2007(05): 66-67 . 百度学术
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