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毛白杨labA-like1基因的克隆与表达特性及其表达载体的构建

刘军梅,  李昊,  崔东清,  叶梅霞,  宋体,  张志毅,  安新民,  ,  , 

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刘军梅, 李昊, 崔东清, 叶梅霞, 宋体, 张志毅, 安新民, . 毛白杨labA-like1基因的克隆与表达特性及其表达载体的构建[J]. 北京林业大学学报, 2011, 33(4): 55-62.
引用本文: 刘军梅, 李昊, 崔东清, 叶梅霞, 宋体, 张志毅, 安新民, . 毛白杨labA-like1基因的克隆与表达特性及其表达载体的构建[J]. 北京林业大学学报, 2011, 33(4): 55-62.
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LIU Jun-mei, LI Hao, CUI Dong-qing, YE Mei-xia, SPAN lang, US style, pt solid, solid windowtext, ZHANG Zhi-yi, AN Xin-min. Isolation labA-like1 gene from Populus tomentosa: expression of PtlabA-like1 in P. tomentosa and construction of expression vector[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2011, 33(4): 55-62.
Citation: LIU Jun-mei, LI Hao, CUI Dong-qing, YE Mei-xia, SPAN lang, US style, pt solid, solid windowtext, ZHANG Zhi-yi, AN Xin-min. Isolation labA-like1 gene from Populus tomentosa: expression of PtlabA-like1 in P. tomentosa and construction of expression vector[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2011, 33(4): 55-62.
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毛白杨labA-like1基因的克隆与表达特性及其表达载体的构建

  • 1.

    北京林业大学林木育种国家工程实验室, 林木花卉遗传育种教育部重点实验室, 国家林业局树木花卉育种与生物工程重点开放实验室

Isolation labA-like1 gene from Populus tomentosa: expression of PtlabA-like1 in P. tomentosa and construction of expression vector

  • 1.

    National Engineering Laboratory for Tree Breeding, Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants of Ministry of Education, Tree and Ornamental Plant Breeding and Biotechnology Laboratory of State Forestry Administration, Beijing Forestry University, 100083, P. R. China.

  • 摘要: 利用滤纸吸附噬菌体--PCR法，从毛白杨花芽cDNA文库中分离克隆了PtlabA-like1基因cDNA全长序列。 在Conserved Domains Database (CDD)中对该基因氨基酸保守结构域进行分析，发现其包含一个LabA-like superfamily结构域，故将其命名为PtlabA-like1。经BLAST分析，在毛果杨基因组数据库中检索到含有该保守结构域的其他9个家族成员。运用BioEdit和MEGA3.1软件，绘制了该基因家族表达蛋白的系统进化树。通过RT-PCR分析，揭示了该基因及其他家族成员在毛白杨中的组织差异表达模式：PtlabA-like1、PtlabA-like6呈现相似的组织表达模式，在茎、幼叶、成熟叶和雌雄花芽组织中均表达，但PtlabA-like1表达丰度较高；PtlabA-like8只在根部表达，且表达丰度较低；其他成员在根、茎、成熟叶、幼叶和雌雄花芽组织中均有表达，但是不同成员的表达丰度存在一定的差异。为进一步研究该基因的功能，构建了该基因的正义表达载体。
    Abstract: To understand the genetic and molecular mechanisms during floral development in Populus tomentosa, we isolated a full-length cDNA sequence of PtlabA-like1 gene from female floral bud cDNA library of P. tomentosa, with the method of bacteriophage absorption by filter paper-PCR. A conserved LabA-like superfamily domain was found via searching Conserved Domains Database. Therefore, it was given by the name PtlabA-like1. A phylogenetic tree was constructed using BioEdit and MEGA3.1 softwares to depict its evolutionary relationship with other 9 members comprising the same domain that retrieved via BLAST at JGI. The expression patterns of LabA-like superfamily members in tissues of P. tomentosa were estimated by RT-PCR. Results revealed that PtlabA-like1 and PtlabA-like6 had similar expression domains at stems, young leaves, mature leaves, male and female flower buds, but a higher abundance was especially shown in PtlabA-like1. PtlabA-like8 was detected with a low level at root only. Other members which had different abundances had a constitutive expression pattern at all of the six tissues. Furthermore, constitutive expression vector carrying 35S::PtlabA-like1 was constructed. All of these would provide the groundwork for understanding the function of PtlabA-like1 gene.
  • [1] 毛秀红, 朱士利, 李善文, 华辉, 田书勇, 仲伟国, 董玉峰, 安新民.  基于荧光SSR标记的毛白杨核心种质构建 . 北京林业大学学报, 2020, 42(7): 40-47. doi: 10.12171/j.1000-1522.20190413
    [2] 张晋岚, 张祥雪, 冉苒, 伍敏, 吴尚, 贾黎明.  基于植物分割理论的毛白杨干旱落叶研究 . 北京林业大学学报, 2020, 42(): 19-27. doi: 10.12171/j.1000-1522.20190411
    [3] 王兵, 程子义, 张蕾, 赵芝婧, 陆海, 刘頔.  过表达毛白杨线粒体APX基因烟草提高抗逆能力的研究 . 北京林业大学学报, 2020, 42(7): 33-39. doi: 10.12171/j.1000-1522.20190390
    [4] 张永卓, 刘雅琳, 陆海, 李慧.  转录组分析组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA对毛白杨悬浮细胞表达谱的影响 . 北京林业大学学报, 2018, 40(9): 1-14. doi: 10.13332/j.1000-1522.20180158
    [5] 雷恒久, 苏淑钗, 马履一, 马仲.  平欧杂交榛CBF/DREB1转录因子ChaCBF1基因的克隆与功能分析 . 北京林业大学学报, 2016, 38(10): 69-79. doi: 10.13332/j.1000-1522.20150528
    [6] 曹山, 蒋璐瑶, 李丽红, 要笑云, 张强, 撖静宜, 王莹, 李慧, 陆海.  毛果杨中链酰基辅酶A合成酶的克隆及酶学分析 . 北京林业大学学报, 2016, 38(7): 9-15. doi: 10.13332/j.1000-1522.20160121
    [7] 郭鹏, 张士刚, 邢鑫, 姜健.  欧美杨PdPP2C基因的克隆与功能分析 . 北京林业大学学报, 2015, 37(2): 100-106. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2015.02.018
    [8] 郭鹏, 邢鑫, 张万筠, 姜健.  欧美杨脱水素PdDHN2b的克隆与表达分析 . 北京林业大学学报, 2015, 37(1): 22-36. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2015.01.017
    [9] 石玉波, 张荻, 申晓辉, 王玲, 卓丽环.  百子莲CONSTANS 同源基因的克隆及表达分析 . 北京林业大学学报, 2014, 36(4): 113-120. doi: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.04.021
    [10] 潘翔, 李娜, 李印军, 魏弘宜, 张蕾, 陆海.  毛白杨抗坏血酸过氧化物酶基因PtAPX2的克隆表达及分析 . 北京林业大学学报, 2013, 35(1): 36-44.
    [11] 郭斌, 刘军梅, 李英, 陈仲, 李昊, 叶梅霞, 王佳, 安新民.  毛白杨PtPCP-like基因的克隆及其遗传转化初报 . 北京林业大学学报, 2012, 34(5): 31-36.
    [12] 连青龙, 韩昊君, 辛海波, 陈莉, 胡小燕, 何秀丽, 义鸣放.  唐菖蒲GhAOS基因的克隆与表达 . 北京林业大学学报, 2011, 33(2): 77-83.
    [13] 于来, 安新民, 曹冠琳, 陈仲, 张志毅.  PtAP3不育结构转化毛白杨的研究 . 北京林业大学学报, 2010, 32(5): 15-20.
    [14] 董雯怡, 聂立水, 李吉跃, 沈应柏, 张志毅, .  应用15N示踪研究毛白杨苗木对不同形态氮素的吸收及分配 . 北京林业大学学报, 2009, 31(4): 97-101.
    [15] 唐文莉, 彭镇华, 高健, .  刚竹属3种重要散生竹光系统Ⅰ基因（Lhca1）的克隆、序列分析和蛋白结构预测 . 北京林业大学学报, 2008, 30(4): 109-115.
    [16] 陆平, 刘足根, 雷妮娅, 张建军, 于文吉, 于海霞, 张春晓, 孙志蓉, 吴家兵, 李俊, 奚如春, 邵杰, 周睿, 郎璞玫, 李黎, 武林, 宋先亮, 焦雯珺, 周艳萍, 金则新, 张志山, 吕文华, 郑景明, 马玲, 许景伟, 高克昌, 索安宁, 毕华兴, 朱清科, 张小由, 郑红娟, 余养伦, 纳磊, 于志明, 李传荣, 李钧敏, 赵秀海, 盖颖, 习宝田, 韦方强, 马履一, 朱教君, 赵广杰, 陈少良, 翟明普, 蔡锡安, 关德新, 葛剑平, 赵文喆, 戴伟, 饶兴权, 陈勇, Kwei-NamLaw, 赵平, 王瑞刚, 曾小平, 谭会娟, 贾桂霞, 于波, 杨永福, 樊敏, 方家强, 张春雨, ClaudeDaneault, 王天明, 江泽慧, 马履一, 李笑吟, 李俊清, 李增鸿, 张宇清, 袁小兰, 王文全, 朱艳燕, 夏良放, 张弥, 崔鹏, 王贺新, 郭孟霞, 殷宁, 何明珠, 袁飞, 王卫东, 李庆卫, 刘丽娟, 张欣荣, 贺润平, 李丽萍, 唐晓军, 吴秀芹, 陈雪梅, 韩士杰, 邓宗付, 江杰, 熊颖, 毛志宏, 吴记贵, 王旭琴, 王月海, 于贵瑞, 蒋湘宁, 刘鑫, 孔俊杰, 王娜, 郑敬刚, 李新荣, 葛剑平, 王贵霞, 聂立水, 王瑞辉, 孙晓敏, 林靓靓, 郭超颖, 董治良.  双向启动子构建及在毛白杨中瞬时表达研究 . 北京林业大学学报, 2007, 29(1): 119-122.
    [17] 杨平, 高黎, 李瑞, 王芳, 黄荣凤, 郑小贤, 白岗栓, 胡胜华, 毛俊娟, 何亚平, 周永学, 张莉俊, 颜绍馗, 胡万良, 殷亚方, 袁怀文, 魏潇潇, 张璧光, 秦爱光, 王费新, 吴彩燕, 刘杏娥, 邓小文, 张洪江, 王兆印, 杜社妮, 张岩, 崔赛华, 王正, 王晓欢, 王胜华, 常旭, NagaoHirofumi, 李猛, 费世民, 刘燕, 赵天忠, 樊军锋, 王小青, 谭学仁, 张克斌, 罗晓芳, 戴思兰, 汪思龙, 孙向阳, 乔建平, 李昀, 张占雄, KatoHideo, 江泽慧, 徐嘉, 张旭, 陈放, 韩士杰, , 王海燕, 刘云芳, 江玉林, 高荣孚, 范冰, 龚月桦, 张双保, 孔祥文, 李华, 杨培华, 常亮, 李媛良, 陈秀明, 丁磊, 侯喜录, 陈宗伟, , 刘秀英, 任海青, 郭树花, IdoHirofumi, 李晓峰, 薛岩, , 徐庆祥, 高建社, 费本华, 李考学, , 蒋俊明, 张代贵, 陈学平, 张桂兰, 刘永红, 王晓东, 涂代伦, 续九如, 李雪峰, , 金鑫, , 张红丽, , 丁国权, .  毛白杨巯基蛋白酶抑制剂基因cDNA的克隆及序列分析 . 北京林业大学学报, 2007, 29(6): 23-28.
    [18] 程占红, 冯夏莲, 齐春辉, 张灿, 段爱国, 谭炳香, 匡文慧, 李贤军, 张求慧, 李雪峰, 吴斌, 王玉涛, 王云琦, 赵燕东, 
    ZHAOGuang-jie, 刘金福, 李吉跃, 刘常富, 邹大林, 常德龙, 郑凌凌, 鲁绍伟, 温俊宝, 徐文铎, 李雪萍, 白陈祥, 吴斌, 李增元, 李吉跃, 洪伟, 吴庆利, 韩烈保, 何兴元, 翟洪波, 赵广杰, 温俊宝, 何正权, 何友均, 王玉杰, 宋湛谦, 张树文, 余新晓, 何承忠, 韩士杰, 朱天辉, 张路平, 张建国, LUOWen-sheng, 刘凤芹, 李俊清, 骆有庆, 陈发菊, 骆有庆, 何静, 黄文豪, 匡秋明, 张养贞, 陈尔学, 张志毅, 姜伟, 郭忠玲, ]陈玮, FurunoTakeshi, 林秦文, ]魏晓霞, 童书振, 梁小红, 安新民, 庞勇, 张振明, 梁宏伟, 李颖, 许志春, 张军, 胡伟华, 崔国发, 张璧光, 郑兴波, 许志春, RENQian, 赵桂玲, 曾会明, PaulWolfgang, 刘君, 宋国正, 雷渊才, 曹川健, 侯伟, 李福海, 杨凯, 郑杰, 李凤兰, 赵广亮, 姚永刚, 董建生, 张全来, 张有慧, 李考学, 田桂芳, 李永波, 赫万成, 李长明, 张世玺.  毛白杨ISSR反应体系的建立及优化 . 北京林业大学学报, 2006, 28(3): 61-65.
    [19] 李绍才, 陈文汇, 范丙友, 朱教君, 金小娟, 时尽书, 吕建雄, 翟明普, 胡晓丽, 李世东, 孙晓梅, 王玉杰, 高峻, 谭伟, 窦军霞, 肖生春, 李发东, 杨振德, 潘存德, 颜容, 南海龙, 张冰玉, 徐双民, 张宇清, 周春江, 康宏樟, 冯仲科, 谢益民, 张一平, 三乃, 孟平, 韩海荣, 李建章, 刘红霞, 田小青, 孙海龙, 张守攻, 刘俊昌, 师瑞峰, 骆秀琴, 王云琦, 朱清科, 宋献方, 胡诗宇, 苏晓华, 肖洪浪, 蔡怀, 岳良松, 王笑山, 吴斌, 陆海, 马钦彦, 李义良, 赵博光, 姜伟, 杨志荣, 张雁, 周文瑞, 蒋佳荔, 刘昌明, 齐实, 齐实, 赵双菊, 李智辉, 何磊, 张劲松, 蒲俊文, 张永安, 宋清海, 蒋湘宁, 赵有科, 伊力塔, 朱金兆, 姚山, 葛颂, 齐力旺, 张德荣, 张岩, 于静洁, 刘元, 褚建民, 石丽萍, 杨聪, 吕守芳, 吴庆利, 曲良建, 康峰峰, 马超德, 崔保山, 刘鑫宇, 王玉珠, 王建华, 朱林峰, 刘相超, 胡堃, 田颖川, 唐常源.  毛白杨4-香豆酸: 辅酶A连接酶可溶性原核表达及活性检测 . 北京林业大学学报, 2006, 28(2): 1-8.
    [20] 殷亚方, 张一平, 符韵林, 侯亚南, 宋小双, 马文辉, 杜华强, 龙玲, 饶良懿, 刘震, 黄国胜, 李景文, 
    王保平, 李全发, 王明枝, 杨晓晖, 张秋英, 李慧, 李景文, 熊瑾, 李梅, 杨海龙, 詹亚光, 李俊清, 张克斌, 韩海荣, 李吉跃, 范文义, 朱金兆, 朱金兆, 耿晓东, 赵敏, 徐峰, 梁机, 王洁瑛, 王雪军, 吕建雄, 窦军霞, 秦瑶, 刘文耀, 李发东, 李俊清, 李妮亚, 陆熙娴, 陈晓阳, 尹立辉, 秦素玲, 陈素文, 赵宪文, 倪春, 李凤兰, 孙玉军, 刘雪梅, 陈晓阳, 李云, 唐黎明, 毕华兴, 于贵瑞, 欧国强, 乔杰, 沈有信, 刘桂丰, 齐实, 康峰峰, 李黎, 慈龙骏, 赵双菊, 李伟, 魏建祥, 宋献方, 王玉成, 文瑞钧, 马钦彦, 张桂芹, 李伟, 韦广绥, 任海青, 王雪, 黎昌琼, 刘伦辉, 蒋建平, 朱国平, 张万军, 丁霞, 周海江, 杨谦, , 孙涛, 宋清海, 李慧, 孙晓敏, 刘莹, 孙志强, 李宗然, 
    , .  毛白杨转rolB基因植株生根能力的研究 . 北京林业大学学报, 2005, 27(5): 54-58.
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  • 收稿日期:  1900-01-01
  • 修回日期:  1900-01-01
  • 刊出日期:  2011-07-30

毛白杨labA-like1基因的克隆与表达特性及其表达载体的构建

  • 1. 北京林业大学林木育种国家工程实验室, 林木花卉遗传育种教育部重点实验室, 国家林业局树木花卉育种与生物工程重点开放实验室
  • 收稿日期: 1900-01-01
  • 修回日期: 1900-01-01
  • 刊出日期: 2011-07-30

摘要: 利用滤纸吸附噬菌体--PCR法，从毛白杨花芽cDNA文库中分离克隆了PtlabA-like1基因cDNA全长序列。 在Conserved Domains Database (CDD)中对该基因氨基酸保守结构域进行分析，发现其包含一个LabA-like superfamily结构域，故将其命名为PtlabA-like1。经BLAST分析，在毛果杨基因组数据库中检索到含有该保守结构域的其他9个家族成员。运用BioEdit和MEGA3.1软件，绘制了该基因家族表达蛋白的系统进化树。通过RT-PCR分析，揭示了该基因及其他家族成员在毛白杨中的组织差异表达模式：PtlabA-like1、PtlabA-like6呈现相似的组织表达模式，在茎、幼叶、成熟叶和雌雄花芽组织中均表达，但PtlabA-like1表达丰度较高；PtlabA-like8只在根部表达，且表达丰度较低；其他成员在根、茎、成熟叶、幼叶和雌雄花芽组织中均有表达，但是不同成员的表达丰度存在一定的差异。为进一步研究该基因的功能，构建了该基因的正义表达载体。

English Abstract

刘军梅, 李昊, 崔东清, 叶梅霞, 宋体, 张志毅, 安新民, . 毛白杨labA-like1基因的克隆与表达特性及其表达载体的构建[J]. 北京林业大学学报, 2011, 33(4): 55-62.
引用本文: 刘军梅, 李昊, 崔东清, 叶梅霞, 宋体, 张志毅, 安新民, . 毛白杨labA-like1基因的克隆与表达特性及其表达载体的构建[J]. 北京林业大学学报, 2011, 33(4): 55-62.
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LIU Jun-mei, LI Hao, CUI Dong-qing, YE Mei-xia, SPAN lang, US style, pt solid, solid windowtext, ZHANG Zhi-yi, AN Xin-min. Isolation labA-like1 gene from Populus tomentosa: expression of PtlabA-like1 in P. tomentosa and construction of expression vector[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2011, 33(4): 55-62.
Citation: LIU Jun-mei, LI Hao, CUI Dong-qing, YE Mei-xia, SPAN lang, US style, pt solid, solid windowtext, ZHANG Zhi-yi, AN Xin-min. Isolation labA-like1 gene from Populus tomentosa: expression of PtlabA-like1 in P. tomentosa and construction of expression vector[J]. Journal of Beijing Forestry University, 2011, 33(4): 55-62.
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